广东省自然科学基金(07300160)
- 作品数：4 被引量：16H指数：2
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- 相关领域：理学化学工程医药卫生更多>>
- DNA小沟结合药物DB818的分子动力学模拟和结合自由能分析被引量：3
- 2009年
- 采用分子动力学模拟了DNA小沟结合芳香二脒药物DB818形成的复合物.通过5ns的模拟研究表明:DB818药物分子可紧密结合在DNA的AATTC小沟区域,和双螺旋d[CGCGAATTCGCG]2形成稳定的复合物.由于噻吩硫原子的弱电负性,使DB818能够以更大的伸展程度与DNA的小沟结合,形成更强的结合力.DB818苯并咪唑的氮原子能够与DNA7位和19位T碱基上的氧原子形成两个稳定的氢键,同时,DB818末端氨基氮原子分别与DNA的20位T碱基的氧原子和9位C碱基的氧原子形成两个氢键.另外,运用MM_PBSA方法计算了DB293-DNA和DB818-DNA复合物的结合自由能,计算结合能与实验值能较好的吻合,通过比较其结合自由能,从热力学能量角度说明了DB818有较大的熵值与较小的焓值贡献,从而与DNA小沟结合的结合力比DB293强.本文在分子水平上提供了DB818直接与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况,为设计出更高生物活性的DNA小沟结合剂提供一定的理论依据.
- 马国正刘聪求亚芳南俊民
- 关键词：DNA动力学模拟
- DNA小沟结合二脒:水分子的识别作用
- 2008年
- 采用分子动力学模拟了DB921-DNA复合物,通过7ns的模拟研究表明:DB921一端的氨基氮原子与一个水分子形成氢键,同时,水分子又与DNA的5位A碱基的氮原子形成一个氢键.水分子在DB921与DNA小沟结合中起了桥连的作用,使得直线型的芳香二脒化合物DB921通过水桥与DNA小沟结合,水分子诱导DB921分子与DNA的小沟域构型相适应,与DNA小沟域的AATTC碱基有较强的结合作用.在分子水平上提供了DB921与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况,指出水分子在DNA小沟结合二脒化合物中的识别作用,为设计出更高生物活性的DNA小沟结合剂提供一定的理论依据.
- 马国正求亚芳南俊民肖信
- 关键词：水分子分子识别
- Al-MCM-41介孔分子筛对镉离子吸附性能的研究被引量：13
- 2008年
- 以十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)为模板剂,合成Al-MCM-41介孔分子筛,通过X-ray粉末衍射、氮气吸附-脱附等温线对样品进行了表征.采用Al-MCM-41为吸附剂,乙酰丙酮为螯合剂对含有二价镉离子的溶液进行了吸附实验,结果表明:Cd2+能定量吸附在Al-MCM-41分子筛上,静态饱和吸附量约为136.86 mg/g,吸附性能符合Langmuir吸附方程特征,并且随吸附液pH值的增大,Cd2+去除率也随之增加.Al-MCM-41介孔分子筛作为吸附剂,对处理有毒金属离子的废水具有积极意义.
- 马国正刘聪南俊民葛杏心刘权浩
- 关键词：镉离子
- 呋喃二脒抗寄生虫衍生物的3D_QSAR研究
- 2009年
- 应用分子场分析法(MFA)对一系列呋喃二脒类抗寄生虫衍生物进行了三维定量构效关系研究,采用偏最小二乘法建模,得到了一个良好的统计模型,r2=0.963,r2cv=0.940.利用该模型对随机选取的4个化合物组成的测试集进行了预测,外在预测的r2pred值达到0.953.
- 马国正罗东升
- 关键词：三维定量构效关系偏最小二乘法
