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国家自然科学基金(20735005)

作品数:26 被引量:89H指数:5
相关作者:钱小红张养军郝斐然蔡耘田芳更多>>
相关机构:军事医学科学院北京蛋白质组研究中心北京理工大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:理学生物学天文地球医药卫生更多>>

文献类型

  • 26篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 19篇理学
  • 6篇生物学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇天文地球

主题

  • 13篇蛋白
  • 13篇蛋白质
  • 13篇白质
  • 12篇质谱
  • 9篇色谱
  • 8篇蛋白质组
  • 7篇蛋白质组学
  • 7篇液相
  • 7篇液相色谱
  • 7篇相色谱
  • 5篇高效液相
  • 5篇高效液相色谱
  • 3篇毛细管
  • 2篇等电聚焦
  • 2篇质谱技术
  • 2篇质谱联用
  • 2篇色谱-质谱联...
  • 2篇色谱柱
  • 2篇糖肽
  • 2篇肽段

机构

  • 16篇军事医学科学...
  • 3篇北京理工大学
  • 3篇北京蛋白质组...
  • 2篇复旦大学
  • 2篇北京工业大学
  • 2篇沈阳药科大学
  • 2篇中国计量科学...
  • 2篇北京放射与辐...
  • 2篇中国医学科学...
  • 1篇安徽医科大学
  • 1篇广西医科大学
  • 1篇西北大学
  • 1篇中国人民解放...
  • 1篇中南大学
  • 1篇中国人民武装...

作者

  • 20篇钱小红
  • 16篇张养军
  • 5篇蔡耘
  • 5篇郝斐然
  • 4篇应万涛
  • 4篇秦伟捷
  • 4篇贾伟
  • 4篇田芳
  • 3篇周廉淇
  • 3篇李佳斌
  • 3篇邓玉林
  • 3篇付斌
  • 2篇周春喜
  • 2篇李楠楠
  • 2篇毛心丽
  • 2篇张姣
  • 2篇卫军营
  • 2篇张万军
  • 2篇杨芃原
  • 2篇林虹君

传媒

  • 11篇色谱
  • 7篇分析化学
  • 3篇质谱学报
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇分析测试学报
  • 1篇化学进展
  • 1篇Scienc...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 3篇2015
  • 2篇2014
  • 3篇2013
  • 2篇2012
  • 3篇2011
  • 5篇2010
  • 8篇2009
  • 1篇2008
26 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
18O同位素标记定量肽段串联体蛋白质结合同位素稀释-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法被引量:2
2013年
建立了定量肽段串联体蛋白质(concatamers of Q peptides,QconCATs)结合18O同位素标记-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法。首先对QconCAT重组蛋白质进行了纯度表征,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)表征结果表明重组蛋白质的纯度在99%以上,相对分子质量约为63.4 kDa。对QconCAT重组蛋白质酶切后的肽段混合物进行质谱分析,并经pFind和pLabel软件处理,验证了目标肽段。还考察了QconCAT重组蛋白质的酶切效率和18O标记效率,并对QconCAT蛋白质结合18O标记-同位素稀释-多反应监测质谱方法进行了评价。实验结果表明,采用该方法对腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis,TTE)中选定蛋白质的肽段进行绝对含量测定时,相对标准偏差小于20%,准确度较高,说明该方法可用于复杂生物样本中蛋白质的绝对定量。更重要的是所建方法不仅解决了细胞培养氨基酸稳定同位素标记(SILAC)技术的重标试剂价格昂贵的问题,也为定量蛋白质组学提供了一种新的方法。
李楠楠周廉淇毛心丽张姣卫军营林虹君李佳斌田芳张养军钱小红
关键词:同位素稀释
螯合稀土金属标记蛋白质技术的建立与优化被引量:1
2010年
建立了一种基于螯合稀土金属标记蛋白质的技术,优化了影响标记效率的各种条件。在50mmol/LTEAB缓冲体系(pH7.5),DTPA与肽段摩尔比为100∶1,常温反应30min的条件下,DTPA标记完全;在100mmol/L乙酸铵缓冲液(pH6.0),稀土金属与DTPA摩尔比为4∶1,37℃反应1h的条件下,稀土金属螯合反应完全。考察了不同稀土金属的螯合效率,发现离子半径最小的Lu螯合效率最高。本方法被成功应用于肽混合物标记。
米薇王晶应万涛蔡耘钱小红
关键词:质谱
糖蛋白/糖肽的分离富集方法被引量:12
2009年
蛋白质糖基化是一种重要的翻译后修饰,糖基化对蛋白质的结构和功能有着重要的影响。目前,作为蛋白质组学的一个组成部分,糖蛋白质组学是备受关注的研究热点,而从复杂的生物样品体系中富集糖蛋白/糖肽是蛋白质糖基化研究的重点和难点。本文就糖蛋白/糖肽分离富集方法的研究进展和应用作了简要概述。这些方法包括常用的凝集素亲和法、硼酸法、肼化学法和亲水作用法,还包括分子筛法、强阳离子交换法等新方法。
曹晶聂爱英陈瑶函王胜陆豪杰杨芃原
关键词:糖蛋白糖肽
中枢神经系统血管母细胞瘤细胞与人脑神经元细胞差异蛋白质分析被引量:2
2009年
以人工培养的中枢神经系统血管母细胞瘤(Central nervous system hem angioblastoma,HB)细胞为研究对象,发展了蛋白质组学分析方法,鉴定了HB细胞与人脑神经元细胞的差异蛋白质。采用在线HPLC串联LTQ-Orbitrap质谱鉴定样品的可溶性蛋白质,得到了HB细胞的蛋白质组表达谱。HB细胞鉴定得到674个蛋白质,神经元细胞鉴定获得531个蛋白质。根据基于肽段鉴定的蛋白质组半定量分析方法对质谱数据进行蛋白质的差异比较分析,发现了波形蛋白(Vimentin),14-3-3epsilon蛋白和碳酸酐酶Ⅱ(Carbonic anhydraseⅡ,CAⅡ)等在HB细胞中表达量发生明显变化的蛋白质,并对其进行了免疫组织化学染色分析。结果显示,波形蛋白(Vimentin)、14-3-3epsilon蛋白以及碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)等蛋白质表达量的改变与HB的发病密切相关,对探索HB的起源有重要意义。
刘杭谢嵘姚鋆樊惠芝朱剑虹杨芃原
关键词:中枢神经系统血管母细胞瘤蛋白质组学高效液相色谱-质谱半定量分析
Toward a high resolution 2-DE profile of the normal human liver proteome using ultra-zoom gels被引量:4
2011年
The human liver is the largest organ in the body and has many important physiological functions. A global analysis of human liver proteins is essential for a better understanding of the molecular basis of the normal functions of the liver and of its diseases. As part of the Human Liver Proteome Project (HLPP), the goal of the present study was to visualize and detect as many proteins as possible in normal human livers using two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). We have constructed a reference map of the proteins of human normal liver that can be used for the comprehensive analysis of the human liver proteome and other related research. To improve the resolution and enhance the detection of low abundance proteins, we developed and optimized narrow pH range ultra-zoom 2-DE gels. High resolution patterns of human liver in pH gradients 4.5-5.5, 5-6, 5.5-6.7, 6-9 and 6-11 are presented. To improve the poor resolution in the alkaline pH range of 2-DE gels, we optimized the isoelectric focusing protocol by including sample application using cup loading at the anode and incorporating 1.2% hydroxyethyl disulfide, 15% 2-propanol and 5% glycerol in the rehydration buffer. Using the optimized protocol, we obtained reproducibly better resolution in both analytical and preparative 2-DE gels. Compared with the 2386 and 1878 protein spots resolved in the wide range 3-10 and 4-7 pH gradients respectively, we obtained 5481 protein spots from the multiple (overlapping) narrow pH range ultra-zoom gels in the range of pH 4.5-9. The visualized reference map of normal human liver proteins presented in this paper will be valuable for comparative proteomic research of the liver proteome.
MI WeiLIU XinJIA WeiLI LeiCAI YunYING WanTaoQIAN XiaoHong
A novel method for identification and relative quantification of N-terminal peptides using metal-element-chelated tags coupled with mass spectrometry
2014年
By means of the reaction between a DOTA-NHS-ester bifunctional reagent and N-terminal peptides of proteins, and then che- lation of lanthanide metal ions as tags, we established a novel method for the identification of N-terminal peptides of proteins and their relative quantification using metal-element-chelated tags coupled with mass spectrometry. The experimental results indicate that metal elements are able to completely label N-terminal peptides at the protein level. The N-terminal peptides are enriched as the peptides digested with trypsin are selectively eliminated by isothiocyanate-coupled silica beads. We success- fully identified the N-terminal peptides of 158 proteins of Thermoanaerobacter tengcongensis incubated at 55 and 75 ℃, among which N-terminal peptides of 24 proteins are partially acetylated. Moreover, metal-element tags with high molecule weights make it convenient for N-terminal peptides consisting of less than 6 amino acids to be identified; these make up 55 percent of the identified proteins. Finally, we developed a general approach for the relative quantification of proteins based on N-terminal peptides. We adopted lysozyme and ribonuclease B as model proteins; the correlation coefficients (R2) of the standard curves for the quantitative method were 0.9994 and 0.9997, respectively, with each concentration ratio ranging from 0.1 to 10 and both relative standard derivations (RSD) measured at less than 5%. In T. tengcongensis at two incubation tem- peratures, 80 proteins possess quantitative information. In addition, compared with the proteins of T. tengcongensis incubated at 55 ℃, in T. tengcongensis incubated at 75 ℃, 7 proteins upregulate whereas 16 proteins downregulate, and most differential proteins are related to protein synthesis.
YAN HuiHAO FeiRanCAO QiChenLI JiaBinLI NanNanTIAN FangBAI HaiHongREN XiaoJunLI XianYuZHANG YangJunQIAN XiaoHong
关键词:PROTEOMICS
基于强阳离子交换色谱与等电聚焦的磷酸化蛋白质组学分离策略比较被引量:4
2012年
比较分析了强阳离子交换(SCX)与等电聚焦(IPG-IEF)技术在磷酸化蛋白质组学中的应用。采用3种标准磷酸化蛋白对SCX与IPG-IEF两种技术对磷酸化肽段富集的有效性进行考察。以HepG2细胞为复杂样本,考察SCX与IPG-IEF在实际样本中的应用情况。对SCX与IPG-IEF技术在18O标记的磷酸化蛋白质组定量研究中的应用情况进行考察。蛋白鉴定采用高准确度、高灵敏度、高分辨率的LTQ-FTICR-MS/MS质谱仪。实验表明:SCX和IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离过程中均有效;在复杂样本中,SCX技术的分离效果优于IPG-IEF;IPG-IEF的重复性好于SCX;在磷酸化蛋白质组定量分析结果表明,IPG-IEF技术的稳定性优于SCX。本研究为根据不同实验目的而选择适当的磷酸化蛋白质组预分离技术提供了有用信息。
隋少卉董俊军王京兰蔡耘钱小红
关键词:强阳离子交换等电聚焦
一种简单的毛细管色谱柱电加热装置的制作方法及其在液相色谱-质谱联用系统中的应用被引量:1
2015年
为了实现蛋白质组的深度覆盖,特别是低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,目前常用的方法是采用更长或装填更小粒径填料的毛细管色谱柱,但因此带来的问题是色谱柱反向柱压显著升高。针对以上问题发展了一种简单的毛细管色谱柱电加热装置制作方法,并将该装置安装于液相色谱-质谱联用系统,分别以牛血清白蛋白(BSA)酶切肽段混合物和酵母蛋白(yeast)酶切肽段混合物为样品,从柱压和柱效两方面对该装置的性能进行了评价。实验结果表明,所制作的毛细管柱电加热装置安装在装填粒径为3μm反相色谱填料的毛细管柱上,在最佳电流(100 mA)下对BSA及yeast酶切肽段混合物进行分离时的柱压比不加电流时的柱压降低至少50%,柱效略有升高。这说明所制作的毛细管色谱柱电加热装置能显著降低柱压,为在较低的柱压条件下选择更小粒径色谱颗粒填料的毛细管色谱柱提供了一种有效的方法。
金祖耀吕雅瑶周珊珊郝斐然付斌应万涛钱小红张养军
关键词:蛋白质组学柱效
分离分析技术在蛋白质组学研究中应用的新进展被引量:9
2009年
蛋白质组学研究的核心技术之一是分离分析方法。该综述重点评述了分离分析技术在蛋白质组学研究,即在蛋白质组表达谱构建、翻译后修饰蛋白质组研究、蛋白质复合体和相互作用研究、蛋白质组定量研究中应用的新进展,介绍了各种分离分析方法的优点、应用范围和有待解决的问题。引用文献89篇。
张养军张万军马岩彭博钱小红
关键词:蛋白质组学质谱蛋白质相互作用
一种多通道匀浆装填毛细管色谱柱的新装置及应用被引量:1
2015年
针对目前毛细管色谱柱装柱效率低、不同批次装填的毛细管色谱柱之间性能差异大的问题,我们发展了一种多通道匀浆装填毛细管色谱柱的新装置。该装置以液相色谱泵提供压力、采用磁力搅拌保持匀浆液均匀分散,一次可装填多达6根毛细管色谱柱。以牛血清白蛋白(BSA)的胰蛋白酶酶切肽段混合物为样本,选择峰容量、蛋白覆盖率、3个特定离子的保留时间以及毛细管色谱柱柱压为指标,在毛细管液相色谱-质谱联用系统上对装填的反相毛细管色谱柱的性能进行了评价。分别考察了一次装填的6根毛细管色谱柱、两次装填的12根毛细管色谱柱以及一次装填1根与一次装填6根毛细管色谱柱的性能及稳定性。实验结果表明:同一批次装填的6根毛细管色谱柱的性能相近;不同批次装填的12根毛细管色谱柱的峰容量和覆盖率没有明显的区别,但保留时间和毛细管色谱柱柱压的稳定性较差;一次装填1根和一次装填6根毛细管色谱柱柱性能的稳定性与两次分别装填6根毛细管色谱柱的稳定性相近,即采用本装置可显著提高毛细管色谱柱的装填效率且每次装填毛细管色谱柱的数量不会对柱性能产生影响。
吕雅瑶郝斐然王欢欢付斌钱小红张养军
关键词:毛细管色谱柱多通道
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