江苏省高校自然科学研究项目(03KJB180064)
- 作品数：5 被引量：17H指数：2
- 相关作者：余多慰袁生吴冬梅李伟勤金晓燕更多>>
- 相关机构：南京师范大学更多>>
- 发文基金：江苏省高校自然科学研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学轻工技术与工程化学工程生物学更多>>
- 绿色木霉纤维二糖水解酶Ⅱ的X射线辐射损伤研究被引量：1
- 2007年
- 南京师范大学生命科学学院,江苏南京210097摘要根据半胱氨酸相关的拉曼光谱分析指标,采用X光管1.82keV,40mA,处理4h的辐射条件,水溶液中绿色木霉纤维二糖水解酶Ⅱ的各种S—H伸缩振动拉曼谱带虽然偏移不多,但呈现了二极分化的演变状态。辐照后的样品中2554cm-1峰宽加大。辐照没有引起维系高级空间结构存在的二硫键断裂,二硫键键长有缩小变化,二硫键几何构象类型未改变,但各种异构体成分的相对含量有变化,辐射前半胱氨酸C—S键异构体特征模PC型略多,辐射后PN和PH型增多。除半胱氨酸CH2摇摆的贡献在辐射后有明显减弱外,此辐射条件没有造成拉曼技术所能证明的与巯基有关的蛋白结构的明显损伤,但可见有变化存在。
- 余多慰袁生
- 关键词：半胱氨酸拉曼光谱
- 绿色木霉纤维素酶分子侧链构象与侧链环境特征的研究被引量：10
- 2004年
- 运用拉曼光谱分析技术能够揭示蛋白质分子基团振动特征 ,本文对绿色木霉 (Trichodermaviride)纤维素酶中的CBHⅡ在固态以及两种 pH值的液态中酶分子的侧链构象与侧链环境状态进行了拉曼分析。结果揭示了CBHⅡ中胱氨酸的CαCβ—S—S′—Cβ′Cα′基团和C—S键 ,蛋氨酸 (甲硫氨酸 )的CαCβ—Cγ—SC基团 ,HCβ—CγS基团和C—S键 ,以及半胱氨酸的HCβ—CγS基团和C—S键的构象特征。实验还证明14个色氨酸是部分暴露的 ,C2—C3—Cβ—Cα 侧链的扭转角[χ2.1]形式多样。在 pH6.0和固体样品中 ,酶蛋白中酪氨酸均为强氢键供体 ,两种样品各有20.3 %、25.1 %是暴露于溶剂的。而pH8.0水溶液中酪氨酸酚羟基成键能力特点是既可做氢键供体 ,又可做氢键受体 ,它们有80
- 余多慰袁生
- 关键词：绿色木霉纤维素酶构象拉曼光谱
- DNA碱基质子化学位移受所在序列的五联体性质影响
- 2007年
- 根据生物大分子核磁共振数据库(BMRB)内16条单链DNA序列中的碱基特征质子的化学位移信息,分析结果表明,五联体(pentaplet)是到目前为止可以由实验数据证明的、决定中部碱基质子化学位移水平的基本单位,即DNA碱基质子的NMR化学位移受所在五联体序列的控制。以五联体中部是T碱基为例,来自化学位移的证据符合来自量子力学计算所得“5'嘧啶-嘌呤比5'嘌呤-嘧啶的顺序更稳定”的论断,表现为5'嘧啶-嘌呤侧翼顺序导致的中部T碱基质子化学位移,比5'嘌呤-嘧啶顺序δ值小0.089。对于中部碱基质子化学位移,5'侧翼二联体效应与3'侧翼二联体效应明显不同。5'侧翼序列对五联体中部碱基质子化学位移的影响从大到小,与5'序列的色散力排列顺序更相关。氢谱上A H8、A H2、G H8、T H6、C H6的位移分布顺序,与从头计算(ab initio)和δ+HMON二种伴氢碳原子净电荷计算结果最为接近,相关性好。与ab initio法得到的氢原子净电荷相关性不好。二翼碱基可以对五联体中心碱基的非交换质子在8.5!的距离上产生影响,这是对NMR偶极作用距离极限的突破。DNA的质子次级化学位移不是像蛋白质那样由氢键起主导作用。以上分析为建立双链DNA碱基质子化学位移理论预测公式提供了依据。
- 余多慰袁生金晓燕
- 关键词：NMR质子化学位移DNA
- d(TTTCCTCGCCGGAAA)的一维NMR氢谱分析
- 2005年
- 单链d(TTTCCTCGCCGGAAA)易溶于水,且由于其本身存在序列特异性,即可形成分子内“发夹”结构,本实验分别测得其在全重水(D2O)、92%D2O+8%H2O溶液中的一维1H谱,认为环出区域碱基质子的共振峰与其他同种质子的共振峰有明显的区别,主要表现在其共振峰会明显移向高场区。
- 余多慰袁生李伟勤吴冬梅
- 关键词：核磁共振DNA质子
- 绿色木霉纤维素酶分子内氢键特征的研究被引量：13
- 2005年
- 运用能够揭示蛋白质分子基团振动特征的激光拉曼光谱分析技术,对绿色木霉纤维素酶中的CBHⅡ在固态以及两种pH值的液态中酶分子内的氢键状态进行了分析。结果表明相对于纤维素酶固体干粉,液态中酶分子酰胺Ⅰ羰基氧原子作为氢键质子受体的能力为上升;酰胺Ⅱ与酰胺Ⅰ的β结构特征峰变化倾向相似。在3种样品中,酶蛋白中Trp均为强氢键供体,从成键能力方面证实了以往同类酶空间分析的结果。固体与pH 6 0水溶液酶蛋白中酪氨酸酚羟基成键能力也是强的。根据游离巯基分析可以判断绿色木霉CBHⅡ的成熟肽CBD与瑞氏木霉CBHⅡ的CBD有相似的二硫键构成。
- 余多慰袁生
- 关键词：纤维素酶绿色木霉分子内氢键成键能力激光拉曼瑞氏木霉
