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黑龙江省科技攻关计划(GB03C602-1)
作品数:
3
被引量:8
H指数:1
相关作者:
刘平
张春巍
王林杰
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相关机构:
哈尔滨医科大学
中国医学科学院北京协和医学院
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发文基金:
黑龙江省研究生创新科研项目
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张春巍
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刘平
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2007
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应用串联质谱法对成年男性正常晶状体纤维进行蛋白质组分析
2007年
目的建立成年男性正常晶状体纤维蛋白表达谱。方法晶状体纤维总蛋白质通过聚丙烯酰胺凝胶电泳初步分离、胶内酶切后的多肽利用反相液相色谱串联质谱的方法,对成年男性正常晶状体中的全部纤维蛋白质进行鉴定。根据高丰度离子的匹配率、匹配离子的连续性和随机性评分,通过SEQUEST和AMASS软件筛选结果。同一样品重复进行3次实验,具有可信度〉98%、有2个或2个以上合格谱图、不少于2次实验均鉴定的蛋白质作为阳性结果。结果实验室共鉴定60个蛋白质,有22个晶状体蛋白质在以前的晶状体蛋白质组研究中有过鉴定。结论该研究建立了成年男性正常晶状体纤维蛋白质表达谱。聚丙烯酰胺凝胶电泳与液相色谱串联质谱相结合是简单、高灵敏度的蛋白质组学方法,适用于研究晶状体纤维的蛋白质随年龄及白内障形成过程中的变化。
张春巍
刘平
王林杰
关键词:
晶体蛋白质类
蛋白质组
人眼晶状体蛋白质二维液相色谱串联质谱初步检测
2007年
目的运用二维液相色谱串联质谱(SCX—RPLC—MS/MS)的方法,初步探讨建立健康成人眼晶状体的蛋白质数据库的实验方法,为研究晶状体的相关疾病提供数据基础。方法晶状体蛋白质混合物被尿素溶解后,做成凝胶块,胶内酶切后的多肽通过二维液相色谱串联质谱的方法,鉴定晶状体中的全部蛋白质。结果具有可信度在98.29%以上,同时有2个或2个以上合格谱图的蛋白质作为阳性结果,共鉴定出56个蛋白。假阳性率:35(反向数据库鉴定肽段数)/2037(正向数据库鉴定肽段数)×100%=1.71%.实验鉴定酸性蛋白质偏多,蛋白相对分子质量集中在20000~80000。结论实验结果为研究年龄相关性白内障和白内障相关蛋白的特殊修饰提供实验方法和数据。二维液相色谱串联质谱是快捷的实验方法,是研究晶状体较好的实验方法之一。
张春巍
刘平
关键词:
蛋白质
强阳离子交换
反相色谱
串联质谱
年龄相关性白内障和正常晶状体蛋白质组的差异分析
被引量:8
2007年
目的运用双向电泳和基质辅助的激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)的方法,鉴定年龄相关性白内障和正常晶状体之间差异表达的蛋白质。方法用固相pH梯度双向凝胶电泳技术分离16例年龄相关性白内障和正常晶状体之间的总蛋白质,建立二维电泳图谱,再利用MALDI-TOF-MS分析及数据库搜索相结合对差异表达的蛋白质点进行鉴定。结果双向电泳胶图显示年龄相关性白内障和正常晶状体共有84个差异点,其中52个上调表达,32个下调表达。有和无的差异表达点10个,相差3倍以上差异表达点10个。利用MALDI-TOF-MS对差异表达的15个蛋白质点进行肽指纹图谱分析,经数据库检索后鉴定出5个蛋白质。结论年龄相关性白内障和正常晶状体之间蛋白表达存在差异,蛋白质组的分析结果为年龄相关性白内障的基础研究提供依据和新实验方法。
张春巍
刘平
关键词:
正常晶状体
年龄相关性白内障
双向电泳
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
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