北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目(2013-3-087)
- 作品数：5 被引量：87H指数：3
- 相关作者：朱汝南钱渊孙宇邓洁赵林清更多>>
- 相关机构：首都儿科研究所首都儿科研究所附属儿童医院更多>>
- 发文基金：北京市科技计划项目北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2013至2014年北京手足口病流行季相关肠道病毒型别变化和分析被引量：52
- 2015年
- 目的分析北京2013至2014年手足口病流行期间肠道病毒的型别、流行趋势和临床特点，为手足口病的防治提供科学依据。方法2013年4至9月和2014年3至10月，首都儿科研究所附属儿童医院感染门诊就诊患儿的咽拭子标本共977份，其中2013年初步诊断手足口病患儿标本147份；2014年初步诊断手足口病患儿标本343例，不典型手足口病患儿标本201份，疱疹性咽峡炎患儿标本83份，发热伴抽搐患儿标本25份，发热伴出疹患儿标本64份，皮疹待查患儿标本114份。采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法检测肠道病毒（EV）通用型，肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CA16）；采用巢式PCR方法对EV通用型阳性而非EV71和CA16的标本核酸进行VP1片段的扩增和测序分析以鉴定型别。分别比较不同年龄组、不同年份间肠道病毒的检出情况，分析其在两个年份的流行趋势。结果977份标本总阳性率为80．1％（783／977），其中CA16为25．6％（250／977），EV71为18．9％（185／977），CA6为20．0％（195／977），CA10为5．0％（49／977），CA4为1．5％（15／977），其他EV为9．1％（89／977），阴性19．9％（194／977）。2013年和2014年检出的各型别地方株同型间均具有较高的同源性，CA6的同源性为94．3％～100％，CA10的同源性为93．8％～99．1％，CA4的同源性为92．7％～99．8％。≤1岁年龄患儿肠道病毒总阳性率为71．1％（106／149），低于其他年龄组（P均〈0．05），但与〉5岁组相近（χ2=1．181，P=0．277）。2013年147例手足口病患儿标本中肠道病毒阳性率为85．7％（126／147），CA6为优势型别占54．8％（69／126），其次是CA16和EV71，分别为20．6％（26／126）和11．9％（15／126）。2014年343例手足口病患儿标本中肠道病毒阳性率为85．4％（293／343），CA16和EV71成为主要型别，分别占42．7％（125／293）和38�
- 宋秦伟黄辉邓洁赵林清邓莉孙宇王芳钱渊朱汝南
- 关键词：手足口病肠道病毒属基因型
- 来自肺炎患儿的A1基因亚型人偏肺病毒全基因组序列分析
- 2016年
- 人偏肺病毒（human metapneumovirus,HMPV）是婴幼儿呼吸道感染的重要病原之一。本研究目的在于分析在HMPV监测中发现的少见型别A1基因亚型BJ-1610的全基因组序列,为HMPV的进一步研究提供数据支持。BJ-1610来源于一名患有肺炎的3月龄女婴的鼻咽洗液标本。对该毒株进行全基因组RNA分段扩增、测序、序列拼接并分析其基因组特征、变异程度及是否存在重组等现象。BJ-1610株基因组全长为13 406nt（KU821121）。BJ-1610与HMPV参考株进行全基因和各蛋白核苷酸和氨基酸序列比较,显示全基因组的核苷酸相似性范围为81.2%-98.4%,其中相似性最高的为澳大利亚株（KC562226）,而SH和G基因则与其他澳大利亚株相似性更高。系统进化分析发现BJ-1610与HMPV A1基因亚型参考株位于同一分支,显示了与相似性分析相同的特征。对BJ-1610的膜表面蛋白F、SH和G蛋白序列进行分析结果显示,F蛋白最为保守,SH基因编码区的终止密码发生了突变,导致终止密码后移15位,长度由552bp变为567bp;G蛋白氨基酸序列突变较多,并导致N-糖基化位点的减少。HMPV作为儿童呼吸道疾病的重要病原之一,对其流行株基因组的分析将对其流行特征、遗传进化、致病机理、疫苗研制和抗病毒药物研发等方面的研究产生积极的推动作用。
- 郭春颖朱汝南孙宇赵林清邓洁王芳宋秦伟田润钱渊
- 关键词：儿童肺炎人偏肺病毒
- 人副肠孤病毒与儿童脓毒症和中枢神经系统感染的相关性被引量：6
- 2014年
- 目的 了解疑似中枢神经系统（CNS）感染患儿中人副肠孤病毒（HPeV）的感染状况及脓毒症感染的关系.方法 回顾性收集2012年因疑似CNS感染而在首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿的脑脊液标本.采用针对HPeV基因组相对保守的5＇端非编码区和变异显著的衣壳蛋白基因3和1交界区的通用引物和分型引物,分别对脑脊液标本核酸进行反转录巢式PCR （RT-nPCR）扩增.阳性标本的PCR产物直接进行核苷酸序列测定,与GenBank中的序列进行比对分析并建立系统进化树.对HPeV筛查阳性的脑脊液标本进行肠道病毒（EV）、EB病毒（EBV）和人巨细胞病毒（HCMV）的检测.同时收集HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本（包括血清、鼻咽洗液、粪便标本等）进行上述检测.结果 577份脑脊液标本中检测到18份HPeV阳性标本,检出率为3.1％.阳性患儿中男12例,女6例,年龄范围为15 d～14岁,其中3个月以下患儿最多,占7例;其次是3个月～1岁年龄组5例;另有3例阳性患儿＞9岁.对分型成功的10份脑脊液标本中HPeV的序列分析显示7份为HPeV 3型,3份为HPeV 1型.18份HPeV筛查阳性的脑脊液标本中EV、EBV和HCMV检测均为阴性.脑脊液HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本中,8份血清标本中检出2份阳性（均为HPeV3）,其中1份与脑脊液标本检出及分型结果一致,而另1份对应脑脊液标本筛查为阳性,但未分出型别;2份粪便标本中检出1份阳性（HPeV1）,但对应脑脊液标本未分出型别.HPeV阳性患儿临床诊断主要是脓毒症（7/18）和CNS感染（4/18）.其中6例（6/8） HPeV3阳性患儿诊断为脓毒症.HPeV3感染多集中于8月份,而HPeV1则集中于1月份.结论 HPeV与北京儿童脓毒症和CNS感染性疾病相关.1岁以下儿童为易感人群.HPeV3型为脑脊液中主要的检出型别.
- 罗雷朱汝南赵林清邓洁王芳孙宇宋秦伟丁雅馨钱渊
- 关键词：中枢神经系统感染脓毒症儿童
- 北京地区2014—2015年和2015年—2016年流感流行季儿童流感流行特征分析被引量：27
- 2016年
- 目的 比较分析北京地区2014—2015年和2015—2016年连续2个流感流行季中儿童流感的流行特征。方法 2014年9月（全年第36周）至2016年5月（全年第22周）每周采集首都儿科研究所附属儿童医院门、急诊流感样病例患儿的咽拭子标本，应用实时荧光反转录PCR方法进行甲型流感病毒、乙型流感病毒的核酸检测，同时对甲型流感病毒阳性标本进一步鉴别甲3型（H3N2）和甲1型（H1N1）流感病毒，对乙型流感病毒阳性标本进行B/Victoria（B/V）系和B/Yamagata（B/Y）系分型。采用描述性分析及t检验、χ^2检验对两个流感流行季的流行特征及各型别流感病毒感染患儿性别和年龄等特征进行比较分析。结果 2014年9月至2016年5月共采集流感样病例咽拭子标本1 821例，共检测到H3N2阳性标本139例（7.6%）；甲型H1N1阳性标本共43例（2.4%）；乙型流感病毒阳性标本共204例（11.2%），包括B/V系108例，B/Y系96例。甲型H1N1感染患儿年龄（3.3±2.2）岁，小于H3N2患儿组[（4.7±3.2）岁]和乙型患儿组[（4.9±2.8）岁]，差异有统计学意义（t＝2.848、3.682，P均〈0.05）。2014—2015年流行季，出现2个明显的流行峰，分别以H3N2和乙型流行峰（全部为B/Y系）为主要流行株；2015—2016年流行季，流感出现时间延后，起始于2015年第51周，整个流行季呈现H3N2、甲型H1N1和乙型共同流行的特点，乙型以B/V占绝对优势。结论 2014—2015年和2015—2016年2个流行季北京地区儿童中流感的流行呈现明显不同的流行特征。进入流感流行季应密切关注儿童中流感病毒的变异，包括乙型流感，及时为流感的防控提供科学依据。
- 孙宇朱汝南王芳邓洁赵林清田润钱渊
- 关键词：流感流行病学儿童
- 北京脓毒症患儿血清中发现的3型人副肠孤病毒的全基因组序列分析被引量：2
- 2014年
- 3型人副肠孤病毒(Human parechovirus 3,HPeV3)是2004年发现的与儿童脓毒症密切相关的一种病原体。HPeV基因组是不分节段的单股正链线性RNA。测定其全基因组序列有助于了解北京儿科患者中流行的HPeV3的遗传背景和进化地位。方法采用将一名脑脊液和血清中HPeV3核酸检测均为阳性的脓毒症患儿(编号:BJC3174)的血清标本接种到细胞后从培养上清中检测到HPeV3核酸,随后分段扩增HPeV3BJ-C3174株的全基因组序列,并进行序列测定、拼接及分析。结果表明BJ-C3174株基因组全长(未包括3′末端的PolyA尾)7 329个核苷酸(nt),其中5′和3′编码区(UTR)分别长707nt和91nt,编码区长6 531nt,可编码一个长为2 177个氨基酸的多聚蛋白。BJ-C3174病毒株与已发表的HPeV3型病毒株位于同一进化分枝,而与HPeV8、HPeV6和HPeV1等型别进化距离较远。BJ-C3174株与德国HPeV3BONN-2株亲缘关系最为密切,两者核苷酸相似性达到99.3%,氨基酸相似性达到99.8%,均高于其与HPeV3原型株A308/99的相似性(89.6%和98.6%)。各基因片段中,BJC3174株均与BONN-2株相似性最高,核苷酸和氨基酸相似性分别达到98.3%和99.3%以上。未发现BJ-C3174株存在基因重组现象。
- 朱汝南罗雷钱渊赵林清邓洁王芳孙宇宋秦伟丁雅馨
- 关键词：全基因组
