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黑龙江省杰出青年科学基金(JC200611)

作品数：14 被引量：105H指数：5
相关作者：郭茂祖邹权刘扬张涛涛王峻更多>>
相关机构：哈尔滨工业大学东北农业大学厦门大学更多>>
发文基金：黑龙江省杰出青年科学基金国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>

文献类型

  • 14篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 11篇自动化与计算...
  • 6篇生物学

主题

  • 5篇生物信息
  • 4篇生物信息学
  • 3篇图像
  • 2篇多序列比对
  • 2篇支持向量
  • 2篇支持向量机
  • 2篇质心
  • 2篇向量
  • 2篇向量机
  • 2篇关键字
  • 2篇RNA二级结...
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇蛋白质相互作...
  • 1篇多序列比对算...
  • 1篇序列比对算法
  • 1篇英文
  • 1篇直推式支持向...
  • 1篇质心法

机构

  • 15篇哈尔滨工业大...
  • 2篇哈尔滨工程大...
  • 2篇东北农业大学
  • 1篇厦门大学
  • 1篇内蒙古科技大...

作者

  • 14篇郭茂祖
  • 8篇邹权
  • 5篇刘扬
  • 3篇张涛涛
  • 2篇韩英鹏
  • 2篇邓超
  • 2篇王峻
  • 2篇李文滨
  • 1篇蔡禄
  • 1篇陈时
  • 1篇单颖
  • 1篇张菁
  • 1篇张菁
  • 1篇刘群
  • 1篇李建伏
  • 1篇王春宇
  • 1篇于建涛
  • 1篇王晓凯

传媒

  • 4篇电子学报
  • 2篇计算机研究与...
  • 2篇生物信息学
  • 1篇哈尔滨工业大...
  • 1篇模式识别与人...
  • 1篇南京大学学报...
  • 1篇计算机学报
  • 1篇小型微型计算...
  • 1篇山东大学学报...
  • 1篇全国第18届...

年份

  • 2篇2010
  • 5篇2009
  • 3篇2008
  • 5篇2007
共 14 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基于视频序列的运动目标跟踪方法
阐明了一种跟踪视频图像序列中运动目标的方法。该方法采用了自适应背景方法,利用图像的面积特征消除运动区域的虚目标,结合二值形态学方法消除内部噪声,得到具有精确边缘的特定运动目标,并记录运动目标的质心坐标位置,利用MER算法...
单颖张菁郭茂祖
关键词：视频分析图像处理质心目标跟踪
文献传递
基于直推式支持向量机的图像检索被引量：2
2009年
为缩小图像的低层特征与高层语义之间的语义鸿沟,基于支持向量机的相关反馈机制受到越来越广泛的关注,但这种方法并没有利用未标记样本的隐含信息.为更好地利用这些信息,提出将直推式支持向量机作为反馈过程中的学习算法.通过分析其所用特征向量的特点,设计一种颜色稀疏特征,并将其与纹理特征结合作为图像描述的特征.实验结果表明该方法较令人满意,同时也说明直推式支持向量机可在文本分类以外的领域取得较好结果.
陈时郭茂祖刘扬邓超
关键词：图像检索特征提取
蛋白质相互作用及其网络预测方法研究进展被引量：5
2007年
依据蛋白质序列、蛋白质空间结构、基因本体（GeneOntology）注释、文献挖掘、网络比对及基因组信息将蛋白质相互作用预测方法分为六类，阐述并评价了各种方法的研究进展．从网络建模与挖掘两个角度探讨了相互作用网络预测方法．还概述了与之密切相关的问题：位点预测、转录因子间相互作用预测及数据库评价，指出了研究中存在的问题和发展方向．
于建涛郭茂祖蔡禄
关键词：蛋白质相互作用蛋白质相互作用网络相互作用位点
多序列比对算法的研究进展被引量：7
2010年
多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着十分重要的作用。自从计算机的出现,就有许多研究者致力于多序列比对算法。人类基因组计划和单体型计划使多序列比对研究再次成为研究热点。本文详细归纳了多序列比对的主要算法,总结了国内外近年来多序列比对的研究进展,同时也分析并预测了未来该问题的研究方向。
邹权郭茂祖韩英鹏李文滨
关键词：多序列比对NP难题生物信息学
转录因子结合位点识别算法的研究被引量：2
2007年
转录因子结合位点的识别是生物信息学中的一个重要领域．本文从计算机等信息科学的角度，对转录因子结合位点的识别方法进行了综合分析，包括该问题的生物学意义、主要算法思想以及每种算法的优缺点．使用TRANSFAC数据库中几组样例对具有代表性的6种主要软件进行测试，对其结果进行了详细地比较分析．最后，在总结分析现有算法的基础上探讨了该领域进一步的研究方向．
王峻郭茂祖
关键词：转录因子结合位点
生物信息学中的学习问题被引量：2
2009年
生物信息学是结合了信息科学和生命科学的一门交叉学科,兴起于人类基因组计划.随着人类基因组计划的完成与深入,生物信息的研究工作由原来的计算生物学时代进入后基因组时代,后基因组时代中一个最重要的分支就是系统生物学.本文从信息科学的视角出发,详细论述了机器学习方法在计算生物学和系统生物学中的若干应用.
郭茂祖邹权李文滨韩英鹏
关键词：生物信息学计算生物学系统生物学
一种基于关键字树的DNA数据库搜索算法
2009年
针对BLAST等软件在生物数据库中搜索DNA分子序列时,不能兼顾时间开销和搜索敏感性的问题,提出一种基于关键字树的多种子搜索算法。首先将查询序列分割成多个种子并将它们构建成一棵关键字树;然后利用Aho-Corasick算法在数据库中搜索,找到每个种子的所有完全匹配;最后检查种子匹配密度大的区域,确定其是否是查询序列的近似出现。实验表明算法兼顾了时间开销和搜索的敏感性,而且能发现基因序列中的移位现象.
邹权郭茂祖刘扬王春宇
关键词：种子
质心法:受类别驱动的RNA二级结构预测方法被引量：3
2009年
RNA二级结构预测问题是计算分子生物学中的一个重要问题.目前的RNA二级结构预测模型和算法都是把待测结构RNA的一级序列作为输入,仅根据输入的序列预测其二级结构.这样做丢失了待测RNA的类别信息,进而无法利用同类别RNA二级结构的保守性.在实际的生物学研究中,对于关心二级结构的RNA,其类别往往是已知的.本文提出一种新的RNA二级结构预测思路:结合类别信息、根据已知的近似形状细化RNA的二级结构.这种方法尤其适用于长度较短、保守性好的非编码RNA.该方法的一个关键问题是如何将一个序列按照近似的形状进行折叠.为此本文首次提出了茎区的"质心"和"质心距"的概念,并且给出了一个结合了Hopfield网络和类别信息的RNA二级结构预测算法.实验表明本文提出的方法在所测试ncRNA分子上效果好于目前的方法.
邹权郭茂祖刘扬
关键词：RNA二级结构生物信息
基于自适应数据剪辑策略的Tri-training算法被引量：18
2007年
Tri-training能有效利用无标记样例提高泛化能力.针对Tri-training迭代中无标记样例常被错误标记而形成训练集噪声,导致性能不稳定的缺点,文中提出ADE-Tri-training(Tri-training with Adaptive Data Editing)新算法.它不仅利用Remove Only剪辑操作对每次迭代可能产生的误标记样例识别并移除,更重要的是采用自适应策略来确定Remove Only触发与抑制的恰当时机.文中证明,PAC理论下自适应策略中一系列判别充分条件可同时确保新训练集规模迭代增大和新假设分类错误率迭代降低更多.UCI数据集上实验结果表明:ADE-Tri-training具有更好的分类泛化性能和健壮性.
邓超郭茂祖
关键词：半监督学习自适应策略TRI-TRAINING
参数序列比对算法研究(英文)被引量：4
2008年
序列比对是生物信息学中的一项重要任务,通过序列比对可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息。序列比对结果的生物学意义与所选择的匹配、不匹配、插入和删除以及空隙的罚分函数密切相关。现介绍一种参数序列比对方法,该方法把最佳比对作为权值和罚分的函数,可以系统地得到参数的选择对最佳比对结果的影响。然后将其应用于RNA序列比对,分析不同的参数选择对序列比对结果的影响。最后指出参数序列比对算法的应用以及未来的发展方向。
张涛涛郭茂祖邹权
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