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重庆市自然科学基金(2010BB1139)
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
相关作者:
康定荣
刘显林
秦国伟
齐晓冉
周泽扬
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相关机构:
重庆师范大学
西南大学
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发文基金:
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相关领域:
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机构
1篇
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重庆师范大学
作者
1篇
李田
1篇
陶美林
1篇
潘国庆
1篇
周泽扬
1篇
齐晓冉
1篇
秦国伟
1篇
刘显林
1篇
康定荣
传媒
1篇
蚕业科学
年份
1篇
2013
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4种微孢子虫的分泌蛋白的比较基因组学分析
被引量:4
2013年
微孢子虫营专性细胞内寄生,其分泌蛋白是一类重要的侵染互作因子。利用分泌蛋白预测程序EuSecPred 2.0对家蚕微孢子虫、中蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫和毕氏肠道微孢子虫的分泌蛋白进行全基因组预测,分别获得了315、90、30和45个分泌蛋白。不同微孢子虫分泌蛋白的序列平均长度和氨基酸组成特征相似,信号肽和非信号肽区均以疏水性氨基酸为主;但统计所获蛋白质功能注释的分布却是大部分分泌蛋白为各种微孢子虫的特异蛋白,仅有少部分分泌蛋白为3种以上微孢子虫所共有,如几丁质脱乙酰基酶(CDA)、热激蛋白70(HSP70)、孢壁蛋白(SWP)和Ricin B-凝集素等。4种微孢子虫分泌蛋白信号肽区的基序分别为[LI]xx[IV]xAS、L[FY]x、[LI]LL[LI][GSA]L[VI][IS][CAG]和L[LF]LFLAISAGA[SA],非信号肽区域的基序分别为[LM][RK]N、L[RK][ND]、[KR][KR][KR]LP和[PG]D[LM]。研究结果有助于揭示微孢子虫的适应性进化机制,同时也为微孢子虫的侵染和与宿主互作机制的研究提供了靶标。
李田
齐晓冉
陶美林
刘显林
康定荣
秦国伟
潘国庆
周泽扬
关键词:
微孢子虫
分泌蛋白
比较基因组学
信号肽
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