中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ITBB130201)
- 作品数：3 被引量：8H指数：1
- 相关作者：王静毅张银东冯仁军柴娟卢利方更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 木薯乙烯信号途径重要基因的生物信息学及表达分析被引量：1
- 2014年
- 木薯是全球三大薯类作物之一,具有抗逆、耐瘠的特性。气态植物激素乙烯在植物生长发育和应对生物及非生物胁迫过程中起着重要作用。本研究收集了木薯乙烯信号途径中的受体基因家族(MeERS1,MeERS2,MeERS3,MeERS4,MeERS5,MeETR2和MeEIN4)和部分转录因子基因家族(MeEIL1,MeEIL2),通过生物信息学方法对这些基因进行了多重比对、保守结构域预测和聚类分析,并采用实时荧光定量PCR的方法测定它们在木薯华南五号不同组织器官中的转录表达水平。生物信息学分析结果表明,受体蛋白都含有高度保守的GAF和HisKA结构域,而转录因子则含有EIN3结构域。另外,受体蛋白都具有跨膜结构域,有的还具有信号肽,而转录因子不具有这些结构域。转录表达分析结果表明,MeERS1、MeERS3、MeEIN4和MeEIL2成组成型表达,在茎、根、块根和叶中没有明显的表达差异;而另一部分基因则成组织器官差异型表达,其中MeERS2和MeETR2主要在茎和叶中高表达,MaERS4、MaERS5和MaEIL1主要在根、茎和叶中表达,在块根中表达量较低。这些结果将为进一步研究乙烯信号途径在木薯抗胁迫过程中的功能奠定基础。
- 任梦云冯仁军史后蕊云天艳张恒王静毅卢利方张银东
- 关键词：木薯生物信息学分析
- 一种快速提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法被引量：6
- 2014年
- 在SDS法的基础上,以富含多糖、多酚等次生代谢物质的香蕉叶片为材料,通过选择性添加适量5 mol/L KAc(pH4.8)或不同体积无水乙醇分别提取香蕉叶片总核酸、总RNA(不含DNA)和总DNA(不含RNA)。结果表明:不添加KAc的可提取到总核酸;添加1/3体积和2/3体积的KAc得到总RNA,添加1/3体积无水乙醇处理得到总DNA。该结果获得一种简单、快速,能在1次实验中添加不同试剂提取香蕉叶片总核酸、总RNA和总DNA的新方法。
- 柴娟冯仁军史后蕊任梦云王静毅张银东
- 关键词：香蕉叶片总RNA总DNA
- 香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析被引量：1
- 2014年
- 从香蕉基因组数据库和NCBI数据库中检索香蕉GAPDH基因家族的所有成员,并采用生物信息学方法对其进行亚细胞定位、进化树分析和保守结构域预测。克隆测序发现,巴西蕉内的GAPDH基因家族成员序列与小果野蕉基因组数据库中提供的序列基本一致,同源性超过98%。转录表达分析表明,GAPDH基因家族成员在巴西蕉不同器官的表达模式多样:MaGAPCP1,MaGAPC6/8/10/11成组成型表达,其余的基因则在各组织器官间成差异型表达,且差异型表达的基因在不同组织器官中表达模式也不相同,组成型表达的基因在不同组织器官中表达模式虽相同,但表达量有差异。GAPDH基因家族成员在表达模式上的多样化,可能暗示其功能的多样化,这种多样化可能是在进化过程中为适应环境而出现的功能分化或冗余。结果为进一步研究GAPDH基因家族成员在香蕉生长、发育,非生物胁迫,果实后熟等重要生物学过程中的功能奠定基础。
- 史后蕊冯仁军王静毅柴娟任梦云卢利方张银东
- 关键词：香蕉生物信息学分析
