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利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础被引量：4: 2013年; 以溧水中子黄豆（P1）和南农493-1（P2）组合的504个正反交F2：3~F2：7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境（QE）互作、QTL′细胞质（QC）互作和QTL′QTL（QQ）互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。; 闫宁谢尚潜耿青春徐宇李广军刘兵汪霞李其刚章元明; 关键词：大豆上位性

大豆粒形性状QTL的精细定位被引量：13: 2013年; 在溧水中子黄豆×南农493-1衍生的504个F2:6家系中选择Satt331～Satt592目标区间7个杂合单株和168个重组单株,衍生成356株RHL-F2个体(群体Ⅰ)和168个重组体家系(群体Ⅱ)。群体Ⅱ来自142个F2:6家系,若每个F2:6家系只保留1个重组家系则构成群体Ⅲ。采用lasso和复合区间作图(CIM)法检测3个群体粒形性状2种指标的QTL。结果表明,lasso法检测到的粒长关联标记是O19和S21/Satt331,而CIM检测到的QTL区间是S21～S22和O23～O19;lasso法检测到的粒宽关联标记是O19/O21,而CIM检测到的QTL区间是O23～O19/O19～O21;长宽比与S21～S22关联是由于粒长QTL引起的,与O23～O19/O19～O21关联是由于粒长和粒宽QTL引起的。将原Satt331～Satt592目标区间的粒长QTL剖分为与标记S21～S22和O23～O19/O19～O21关联的2个多效性QTL。根据大豆基因注释数据库,Glyma10g35240和Glyma10g34980可能是控制粒形性状发育的候选基因。; 牛远谢芳腾布素红谢尚潜韩世凤耿青刘兵章元明; 关键词：大豆粒形数量性状基因座候选基因

偏分离群体连锁图矫正和QTL定位软件包DistortedMap的研制被引量：3: 2014年; 为使偏分离群体连锁图矫正方法能被广泛应用,在Microsoft Visual Studio 2010操作平台下,利用C++语言研制了Windows界面友好的DistortedMap软件包。结果显示:DistortedMap软件包具有遗传群体模拟、偏分离群体连锁图矫正和数量性状基因座定位的功能。使用该软件包可获得偏分离标记间遗传距离的无偏估计值并消除标记偏分离对QTL定位的影响。; 谢尚潜耿青春章元明; 关键词：偏分离连锁图 QTL定位软件包

大豆籽粒大小和粒形的驯化研究被引量：9: 2012年; 从野生大豆到栽培大豆的驯化过程中,籽粒大小和形状发生了很大变化,探究这些性状的变化规律能加深对基因驯化机制的认识。以14个野生大豆、45个地方品种和30个育成品种为材料,进行上述性状的偏相关和因子分析。结果表明:栽培品种中百粒重和籽粒大小呈极显著相关,但野生大豆中百粒重和粒长不相关;野生大豆中长宽比是因子分析第1因子的重要成分,而栽培品种并非如此;百粒重与籽粒大小显著相关,与粒形性状不相关。此外,上述结果还通过溧水中子黄豆和南农493-1杂交组合构建的504个正反交F2∶3、F2∶4和F2∶5家系群体的偏相关分析和QTL定位结果予以证实。; 牛远徐宇李广军王云清刘晓芬李河南魏世平章元明; 关键词：驯化数量性状基因座粒形大豆

植物数量性状分离分析Windows软件包SEA的研制被引量：129: 2013年; 近十几年来,利用双亲分离群体数量性状表型观测值来鉴定数量性状主基因+多基因混合遗传模式的研究时有报道,其结果可指导作物育种实践。然而,随着计算机技术的进步,本课题组研制的软件操作性、算法和功能模块等方面都存在一定缺陷。在Microsoft Visual Studio 2010操作平台下,利用C++语言研制了Windows界面友好的植物数量性状分离分析(segregation analysis,SEA)软件包,其中采用了线性算法包Clapack V3.1.1解线性方程组并估计一阶遗传参数,更精确地计算适合性检验的概率,增加了结果输出模块和计算分离群体植株或家系的主基因型后验概率。新软件包计算更稳定,结果更全面,界面更友好。; 曹锡文刘兵章元明; 关键词：数量性状 C++语言软件包

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