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国家科技支撑计划(2013BAD16802)
国家科技支撑计划(2013BAD16802)
- 作品数：1 被引量：0H指数：0
- 相关作者：张丹谭琦王瑞娟徐珍尚晓冬更多>>
- 相关机构：上海海洋大学上海市农业科学院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 金针菇单核体DAN3和M与其杂交双核体G1菌丝阶段基因表达差异的转录组初步分析
- 2016年
- 以金针菇(Flammulinavelutipes)单核菌株DAN3的基因组为参考,完成单核体DAN3和M及其杂交双核体G1在菌丝阶段的转录组测序与数据分析,比较两个样本间的差异基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因86个,其中,在G1中呈上调、下调表达的基因数分别为41、45个,有2个基因在G1中特异表达。GO功能分析结果表明,86个差异基因中有40个基因比对上了GO功能注释,其中18个基因在G1中呈上调表达;单一生物过程和催化活性为显著性富集的功能,相关基因在G1中呈上调表达。KEGG pathway分析结果表明,22个差异基因被定位到17条Pathway,其中10个基因在G1中呈上调表达,包括赖氨酸代谢途径对应基因,3_M和G1菌丝样品中赖氨酸含量分别为1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,说明G1中上调的基因可能与之降解相关;DNA复制是显著性富集的代谢途径,相关基因在G1中呈下调表达。
- 徐珍刘建雨张丹王瑞娟潘迎捷谭琦尚晓冬
- 关键词：菌丝转录组差异表达基因
