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国家自然科学基金(20271009)

作品数:3 被引量:8H指数:2
相关作者:陈光巨杨作银贾木欣刘若庄更多>>
相关机构:北京师范大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
相关领域:理学化学工程更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 2篇理学
  • 1篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇药物
  • 2篇抗癌
  • 2篇抗癌药
  • 2篇抗癌药物
  • 2篇抗冻蛋白
  • 1篇手性
  • 1篇苏氨酸
  • 1篇量子化学
  • 1篇量子化学计算
  • 1篇昆虫
  • 1篇昆虫抗冻蛋白
  • 1篇化学计算
  • 1篇基因
  • 1篇加合物
  • 1篇氨酸
  • 1篇PT
  • 1篇RECOGN...
  • 1篇REGULA...
  • 1篇CI
  • 1篇DNA加合物

机构

  • 4篇北京师范大学

作者

  • 4篇陈光巨
  • 2篇谭宏伟
  • 2篇杨作银
  • 1篇贾木欣
  • 1篇刘若庄
  • 1篇曲雯雯
  • 1篇周艳霞

传媒

  • 2篇中国科学(B...
  • 2篇中国化学会第...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 2篇2005
  • 1篇2004
  • 2篇2003
3 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
一种具有规则结构的蛋白单体之间相互识别的分子力学模拟和量子化学计算被引量:2
2003年
使用分子力学、分子动态学以及量子化学计算方法,对天然的昆虫抗冻蛋白质分子(TmAFP)以长轴平行的方式发生二体相互作用的可能模式进行了系统研究.分子模拟的结果表明,在可能的相互作用模式中,其相互作用区域必须至少包含一个β-面,并且当蛋白单体均取β-面靠近时,其侧链上的羟基在空间的分布满足结构上的二维匹配;利用分子力学与量子化学相结合的方法得到的结果表明两单体的β-面之间具有相对最强的相互作用,同时,高级别的DFT计算以及van der Waals键电荷密度分析进一步证实β-面的相互识别主要表现为β-面的一个苏氨酸侧链的羟基对另一个的苏氨酸羟基氧的识别,即它们之间能形成较强的氢键.因此,分子力学以及量子化学的计算结果都说明蛋白单体在相互识别的过程中,均以β-面相互作用的可能性最大.
杨作银贾宗超刘若庄陈光巨
关键词:抗冻蛋白量子化学计算苏氨酸
Molecular and quantum mechanical studies on the monomer recognition of a highly-regular β-helical antifreeze protein
2004年
The possible interaction models for an antifreeze protein from Tenebrio molitar (TmAFP) have been systematically studied using the methods of molecular mechanics, molecular dynamics and quantum chemistry. It is hoped that these approaches would provide insights into the nature of interaction between protein monomers through sampling a number of interaction possibilities and evaluating their interaction energies between two monomers in the course of recognition. The results derived from the molecular mechanics indicate that monomer? β-sheets would be involved in interaction area and the side chains on two p-faces can match each other at the two-dimensional level. The results from molecular mechanics and ONIOM methods show that the strongest interaction energy could be gained through the formation of H-bonds when the twoβ-sheets are involved in the interaction model. Furthermore, the calculation of DFT and analysis of van der Waals bond charge density confirm further that recognition between the two TCTs mainly depends on inter-molecular hydroxyls. Therefore, our results demonstrate that during the course of interaction the most favorable association of TmAFPs is via their β-sheets.
YANG Zuoyin, JIA Zongchao, LIU Ruozhuang & CHEN GuangjuDepartment of Chemistry, Beijing Normal University, Beijing 100875, China
关键词:ANTIFREEZEMOLECULAR
抗癌药物cis-[Pt(NH_3)(2-picoline)]^(2+)与DNA加合物的结构和成键特征被引量:6
2003年
利用分子力学、分子动力学、分子力学与量子化学相结合(Oniom)以及量子化学等多种方法研究了抗癌药物cis-[Pt(NH_3)(2-picoline)]^(2+)与DNA片段d(ATACATG~*-G~*TACATA)·d(TATGTACCATGTAT)的加合物的几何构型和电子结构。结果表明Oniom方法优化得到的构型与NMR实验测定的结构最为接近,Pt配合物与DNA中相邻的两个鸟嘌呤的N7原子形成较强化学键,从而导致DNA的构型发生较大的变化,同时,配合物中NH_3的一个H与其邻近的鸟嘌呤的O6间形成的氢键也是影响Pt配合物与DNA加合物几何构型的重要因素。上述化学键、氢键以及药物与碱基的甲基间的相互作用是药物分子能够对DNA进行识别的重要基础。
贾木欣刘恺杨作银陈光巨
关键词:抗癌药物
含手性Pt(dach)抗癌药物与DNA作用的理论研究
<正>顺铂抗癌作用的发现及其临床应用开辟了金属配合物抗癌药物研究的新领域。顺铂对睾丸、卵巢肿瘤有极高的疗效,对治疗口咽、支气管、宫颈、淋巴等肿瘤也有一定功效。但是, 由于顺铂存在着明显的缺陷,比如具有严重的毒副作用,没有...
曲雯雯谭宏伟陈光巨
文献传递
昆虫抗冻蛋白中基因突变效应的理论研究
<正>抗冻蛋白是一类可以抑制冰晶生长的功能性生物大分子,它能以非依数性形式降低溶液的冰点而不影响其熔点,从而导致溶液冰点和熔点的差异,这种差异称为热滞活性或者抗冻活性。来源于云杉蚜虫的抗冻蛋白CfAFP具有规则的左手型β...
周艳霞谭宏伟陈光巨
文献传递
共1页<1>
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