广东省自然科学基金(915100890100005)
- 作品数:1 被引量:1H指数:1
- 相关作者:王波郭媛媛胡兢晶伍苑宾谢斌华更多>>
- 相关机构:广州医科大学广东省妇幼保健院更多>>
- 发文基金:广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测与分析被引量:1
- 2013年
- 目的预测与分析人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因B细胞表位。方法应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,结合跨膜结构、Hopp&Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL148基因B细胞表位。结果 HCMV pUL148氨基酸包含316个氨基酸残基,相对分子质量为36kD,等电点为9.15;应用SOPMA,GOR,HNN方案预测pUL148二级结构,均显示以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域多位于14~21,98~106,132~139,174~181,191~197,267~272,235~240。TMHMM预测pUL148存在一个跨膜区域,为286~308位氨基酸,胞外区域为1~285位氨基酸。结论 HCMV UL148基因265~275,221~229,18~25位氨基酸序列区域内或其附近主要以无规则卷或β-转角结构为主,且抗原指数(AI)较高,极有可能是B细胞表位。
- 伍苑宾胡兢晶王波苏海浩郭媛媛谢斌华密英鸽
- 关键词:人巨细胞病毒B细胞表位
- 人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测及其免疫原性分析
- 目的:预测与分析人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位并制备人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因的抗体对其进行免疫原性分析. 方法:应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用...
- 伍苑宾胡兢晶王波六苏海浩郭媛媛谢斌华密英鸽
- 关键词:人巨细胞病毒B细胞表位