淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题基金(2008FB016)
- 作品数：2 被引量：18H指数：2
- 相关作者：余育和颜庆云冯伟松李学梅张堂林更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学环境科学与工程更多>>
- 武汉东湖浮游生物宏基因组与环境重金属的关系被引量：9
- 2010年
- 采用针对16SrRNA和18SrRNA基因的引物,对武汉东湖不同营养水平湖区的浮游生物宏基因组进行凝胶电泳分析(PCR-DGGE)的指纹分析,并探讨宏基因组与环境重金属的关系.结果表明,PCR-DGGE分析共获得82条谱带,其多态率为82.9%,特有谱带占31.7%.I^V站点的谱带分别为36,34,44,50,56条.5个站点浮游生物群落PCR-DGGE指纹结构的聚类分析(UPGMA)分成两大类:I、II、Ⅲ站为一类,IV、V站为一类,这与重金属(铅、铬、汞、镉、砷、铜)浓度对各站点的聚类分枝关系相一致.相关分析显示,变性梯度凝胶电泳(DGGE)谱带所代表的分类单元数(OTUs)与镉、铬的浓度存在较明显的相关性,其相关系数分别为-0.942(P<0.05)和-0.928(P<0.05).
- 颜庆云余育和冯伟松
- 关键词：浮游生物群落宏基因组重金属
- 滤食性鲢、鳙肠含物PCR-DGGE指纹分析被引量：9
- 2009年
- 以采自武汉东湖的滤食性鲢、鳙为对象,通过PCR-DGGE并结合序列分析对其肠道微生物及肠含物中残留的食物组分进行了探索研究。在所有个体中都能检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中包括肠道细菌在内的原核谱带较多,真核谱带相对较少;分析结果表明针对鲢、鳙肠含物这一特殊生境样品进行PCR-DGGE指纹分析是可行的。PCR-DGGE指纹结构及针对部分特定PCR-DGGE谱带的序列分析显示,从武汉东湖采集的鲢、鳙在食性上存在很大的重叠,并没有像基于常规食性分析文献报道的那样明显不同。基于肠含物DNA来进行鱼类食性分析的方法不受对食物碎片分类鉴定的制约,可同时对多个样品平行进行分析,且不同研究者间的研究结果便于进行比较,以便总结生态学的内在规律。
- 颜庆云余育和张堂林冯伟松李学梅
