国家自然科学基金(30571280) 作品数:13 被引量:81 H指数:6 相关作者: 王跃进 张剑侠 张军科 张艳艳 张朝红 更多>> 相关机构: 西北农林科技大学 中华人民共和国农业部 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
中国野葡萄新基因cDNA全长的克隆及序列分析 被引量:6 2007年 根据对中国野生葡萄华东葡萄株系白河-35-1在白粉病诱导下构建的cDNA文库中获得的1条EST序列设计特异引物,以总RNA逆转录产物为模板,进行SMART-RACE扩增。结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,并预测了蛋白质的理化性质、信号肽、酶与非酶分析、亚细胞定位以及蛋白质二级结构。结果表明,获得的中国野生葡萄新基因的全长序列为854 bp,其开放阅读框为585 bp,5′非编码区为107 bp,3′非编码区为162 bp;同源性比对表明该新基因推导的氨基酸序列与拟南芥RNA结合蛋白和水稻推定的半乳糖基转移酶的同源性分别为55%和63%,第8-82位氨基酸序列与RNA识别基序相类似,是一个典型的结构功能域;推导该基因表达产物为相对分子质量为21 801.27、等电点为6.86的不稳定蛋白,定位于细胞核,不包含信号肽,二级结构主要是无规则卷曲。 赵伟 徐伟荣 徐炎 贺明阳 王跃进关键词:中国野生葡萄 CDNA全长 RACE 生物信息学 白粉菌对葡萄叶片生理特性的影响 2010年 以欧洲葡萄F1代株系15-1-9为试验材料,在叶片上接种葡萄白粉菌后,分别在0、5、10、15、20、25、30 d取样,测定叶片的过氧化物酶(POD)活性、过氧化氢酶(CAT)活性、多酚氧化酶(PPO)活性、苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性、可溶性蛋白质含量、丙二醛和木质素含量等生理特性的动态变化,为葡萄白粉病的防治和葡萄抗白粉病育种提供基础参考资料。结果表明:葡萄叶片感染白粉菌后,POD、CAT、PAL的酶活性均高于未接种的健康叶片(CK),呈上升趋势,而PPO活性则呈下降趋势,并且在后期略有回升。接种后叶片的可溶性蛋白质含量降低,丙二醛、木质素的含量有不同程度上升。由此可见,葡萄白粉菌的侵染对叶片内的生理特性的动态变化有较大影响。 王伟 张军科 王跃进 杜敬 张玉洁 李爽关键词:白粉菌 葡萄 生理特性 中国野生葡萄抗霜霉病基因RAPD标记的筛选 被引量:15 2008年 以抗病的中国野生华东葡萄(Vitis pseudoreticulata)白河-35-1(Baihe-35-1)与感病的欧洲葡萄佳利酿(Carignane)杂交F2代为试材,从520条随机引物中筛选出21条可以扩增多态性DNA片断的随机引物,从中获得了6个抗霜霉病基因的RAPD标记,对这些标记回收、克隆、测序后,将得到的6个标记分别记录为:S294-369,S202-527,S382-615,S221-677,S416-1224和S390-725。通过分析这6个RAPD标记在F2代植株中的表现,证明这些标记都与霜霉病抗性的基因有连锁关系。这将为葡萄抗霜霉病育种的分子标记辅助选择提供分子依据。 张艳艳 张剑侠 王跃进关键词:中国野生葡萄 霜霉病 抗病基因 RAPD标记 中国野生葡萄抗黑痘病基因RAPD标记的克隆、序列分析及辅助育种应用 被引量:15 2009年 对中国野生葡萄抗黑痘病基因RAPD标记OPS03-1300进行了克隆、测序及序列分析,结果表明该标记实际长度是1354bp,因此更名为OPS03-1354,其GenBank登录号为DQ350885。该标记序列与99条来自欧洲葡萄的EST有同源性,其中与1条来自赤霞珠叶片感染葡萄皮尔斯病病原菌后获得的EST同源性为82%,与2条来自赤霞珠果实在不同发育期获得的EST同源性分别为80%和85%。该序列与1条来自中国野生华东葡萄白河-35-1叶片接种霜霉病病原菌后获得的EST同源性为67%。该序列编码葡萄的一种假定蛋白。此外,应用该标记对中国野生葡萄与欧洲葡萄的种间杂交广西-1×京可晶F1代339株、白河-35-1×佳利酿F2代207株进行了辅助选择。 张剑侠 王跃进 张艳艳 周邦军关键词:中国野生葡萄 RAPD标记 克隆 标记辅助育种 白粉菌在不同抗病性葡萄叶片上的侵染过程比较 被引量:15 2008年 【目的】探明葡萄白粉病侵染过程中病原与植物互作的关键时期。【方法】以抗白粉病的中国野生葡萄白河-35-1、感病欧洲葡萄品种佳丽酿及其F1代抗病株系6-12-4和感病株系6-12-2为材料,通过考马斯亮蓝G-250染色和解剖观察统计叶片的自然带菌率。采集田间白粉病发病葡萄叶片,人工接种试验叶片,于接种后0,1,3,5和7d分别采集接种叶片,制片后显微观察,研究白粉菌在葡萄叶片表面的生长和侵染过程。【结果】田间自然条件下和田间人工套袋隔离2周后,葡萄抗、感白粉病植株的新稍叶片均存在自然带菌现象,但抗病植株带菌率较低。人工压片接种后,菌丝和分生孢子成功附着在感病和抗病植株的叶片表面。随着接种后时间的延长,不同抗病性葡萄叶片表面白粉菌的数量均增加,接种3 d后感病植株叶片表面的菌丝数量快速增加,并表现出白粉症状;抗病葡萄植株叶片表面的菌丝数量增加较慢,不表现白粉症状。感病材料上葡萄白粉病的侵染过程为:分生孢子萌发形成芽管,然后在芽管顶端萌发形成附着胞,附着胞下方长出侵染丝并侵入叶片,完成侵染过程。【结论】葡萄白粉病菌与寄主识别反应的关键时期在接种后3 d内。白粉病人工接种前,葡萄叶片保持至少2周的隔离是必要的。 张军科 罗世杏 李小伟 王跃进关键词:葡萄 白粉病 人工接种 侵染过程 中国野生葡萄醛脱氢酶基因在拟南芥中的过量表达 被引量:1 2009年 将质粒pWR306中包含ED35s启动子、Omega元件及TNOS终止子的一段核苷酸序列定向克隆到质粒pCAMBIA1300,构建了植物中间表达载体pWR-II;将重组质粒pGEM-T-ALDH的醛脱氢酶(ALDH)基因片段定向克隆到pWR-II,构建了葡萄ALDH基因的植物过量表达载体pWR-II-ALDH。采用改进冻融法将其导入农杆菌EHA105,采用花序浸蘸法转化拟南芥,获得了潮霉素抗性的转化拟南芥植株。PCR检测证明外源基因已整合进拟南芥基因组,Real-timePCR结果表明ALDH基因在转化植株的表达量远高于野生种。转化植株和野生植株在形态上有一定的差异,说明葡萄ALDH基因在拟南芥中表达对其生长发育有一定影响。 雷龑 王跃进 徐伟荣 张方方 余皓 王西平关键词:中国野生葡萄 拟南芥 无核葡萄胚挽救影响因素的研究 被引量:15 2007年 分别以‘底莱特’和‘大粒红无核’自交、‘红宝石无核’ב新郁’和‘爱莫无核’ב黑奥林’胚珠为材料进行无核葡萄胚挽救影响因素的研究。结果显示:(1)‘底莱特’自交和‘红宝石无核’ב新郁’胚珠剥胚后萌发率分别为11.4%和10.0%,高于横切胚珠情况下的萌发率(5.5%、0.6%);(2)用Nitsch培养基培养的‘大粒红无核’自交和‘爱莫无核’ב黑奥林’胚珠的胚萌发率分别为9.5%和5.6%,胚状体诱导率分别为6.3%和3.9%,明显高于ER培养基的萌发率。结果表明:剥胚有利于无核葡萄胚的萌发;Nitsch比ER培养基更有利于胚萌发和胚状体诱导;同时,由于杂交亲本染色体倍性的差异导致胚萌发率不同,表现为:二倍体无核自交>二倍体无核×二倍体有核>二倍体无核×四倍体有核。 程琳琳 王跃进 石艳 张剑侠 唐冬梅 张宗勤关键词:无核葡萄 胚挽救 胚珠 胚状体发生 染色体倍性 应用基因芯片检测中国野生葡萄抗白粉病基因表达 被引量:5 2008年 研究了利用Affymetrix的欧洲葡萄基因表达芯片检测中国野生葡萄基因表达的可行性,并检测了葡萄白粉病菌(Uncinular necator)人工接种诱导48h后的基因表达情况。结果表明:该芯片可以在感病材料中检测出表达的基因11906个,抗病材料中检测到表达的基因11839个,在二者中同时检出表达的基因11839个,能够检出的基因数占该芯片基因探针组总数的71.3%,因此用欧洲葡萄基因芯片检测中国野生葡萄中基因表达水平是可行的;利用此芯片检测出在人工接种诱导后,抗病材料中和感病材料相比表达上调的基因共1920个,占检测出基因总数的16.21%;表达下调的基因数1760个,占检测出基因总数的14.87%;表达上调和下调的幅度(signal log ratio)都在1—7倍之间。 张军科 桑春果 王跃进 张朝红 史江莉 粟霞 罗世杏关键词:葡萄 基因芯片 抗病基因 基因表达 The EST Analysis of A Suppressive Subtraction cDNA Library of Chinese Wild Vitis pseudoreticulata Inoculated with Uncinula necator 被引量:6 2010年 Uncinula necator is a worldwide serious fungus disease causing annual heavy lost on grapevine production. In order to get more informations on defense related EST sequences and help breeding program, we constructed and characterized a suppression subtractive hybridization cDNA library with artificially inoculated leaves and control Chinese wild Vitis pseudoreticulata clone Baihe-35-1, which is highly resistant to powdery mildew. In the library, the length of 58 EST fragments known as putative functions varied from 130 to 800 bp, and 60% of the ESTs exhibited high similarity to known sequences in database of GenBank with BLASTX analysis. These genes were involved in stress/defense response, detoxification, signal transduction, disease defense, and etc., and 14 ESTs remained unknown or hypothetical proteins, which may be new genes. The experiment provided an important basis for studying the disease-resistance mechanism and obtaining the genes for the aim of improving grapevine powdery mildew resistance. SHI Jiang-li, WANG Yue-jin, ZHU Zi-guo and ZHANG Chao-hong Key Laboratory of Horticultural Plant Germplasm Utilization in Northwest China, Ministry of Agriculture/Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture/College of Horticulture, Northwest A&F University, Yangling 712100, P.R.China中国野生葡萄白粉菌诱导cDNA文库中抗病基因的筛选 被引量:3 2008年 【目的】从中国野生华东葡萄白河35-1经白粉菌接种诱导后叶片所构建的cDNA文库中,筛选抗病相关基因。【方法】根据植物抗病基因保守序列NBS位点设计特异引物,对葡萄白粉病接种诱导后的环化cDNA文库进行菌落PCR筛选,从随机挑选的大量菌落中筛选出82个PCR阳性菌落,提取阳性菌落的质粒进一步进行PCR检测确认,对确认的36个阳性质粒插入片段进行了测序。【结果】测序结果和序列生物信息学分析结果均表明,有3个基因序列与Genbank中的已知序列有较高的同源性,其中1个基因序列与葡萄抗白粉病基因(DT661587.1)序列同源性达99%,另外2个基因序列与水分胁迫下葡萄特异表达基因(DT031657.1)和葡萄抗皮尔斯病基因(CF202948.1)的同源性分别为89%和96%。【结论】初步推测获得的3个基因均为抗性相关基因。 张军科 王静 王静 王跃进 张朝红关键词:中国野生葡萄 CDNA基因 文库筛选 抗病基因