艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2009ZX10601)
- 作品数:2 被引量:14H指数:2
- 相关作者:朱宝利武娜张苑怡朱玉琢李源更多>>
- 相关机构:中国科学院吉林大学北京协和医院更多>>
- 发文基金:中国科学院知识创新工程艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项北京市科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 快速检测NDM-1基因的环介导恒温扩增技术的建立与评价被引量:11
- 2011年
- 基于DNA环介导恒温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP),探索建立一种应用于NDM-1基因(New Metallo-β-Lactamase-1 Gene,NDM-1)的快速检测方法,以适应临床实验室等的检测需求。利用LAMP技术,以NDM-1基因为靶序列,设计4组LAMP引物,并筛选最优引物组,建立LAMP反应体系与条件,进行灵敏度和特异性实验。结果表明整个检测过程仅需1 h,即可通过肉眼直接目测实验结果。在灵敏度试验中,NDM-1基因的最低检测限为6拷贝/反应。在特异性实验中,以4株病原菌(肺炎克雷伯氏菌、大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌)以及肠道菌群元基因组DNA、土壤菌群元基因组DNA为模板对NDM-1基因进行检测,结果显示均没有发生非特异性扩增反应。文中建立的LAMP检测方法能够快速检测NDM-1基因,且可直接观察到实验结果,实现了检测结果的可视化。具有操作简单安全、检测灵敏度高、特异性高的特点,能够满足基层实验室、应急检测或现场监测等方面的使用需求,具有良好的应用价值。
- 张苑怡武娜朱宝利陈蕾朱玉琢
- 关键词:Β-内酰胺酶聚合酶链式反应
- 采用PCR-测序法对北京地区325例妇女宫颈脱落细胞样品中人乳头瘤病毒进行检测和基因分型被引量:3
- 2011年
- 为了探讨PCR-测序法在宫颈脱落细胞样品中人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)临床检测中的应用价值,采用HPV通用引物PGMY09/11针对HPV L1区基因序列进行PCR扩增,并通过DNA测序法对HPV进行基因分型。对于混合感染样品,利用HPV型别特异性引物PCR的方法进行基因分型。325例临床样品中,228例为HPV阳性,其中66例为混合感染。共发现27种不同的HPV型别,其中HPV 16比例最多,其次是HPV 58和52。高危型HPV检出率随病变程度加重显著性增加(P〈0.05),但混合感染的比例呈下降趋势(P〈0.05)。在21~30岁年龄组中,HPV感染率最高。PCR-测序法与HC2对高危型HPV检测的符合度较好(kappa=0.675)。PCR-测序法可有效地对宫颈脱落细胞样品进行HPV检测和基因分型,对大规模的HPV筛查具有潜在的应用价值。
- 蔡玉品张瑞芬李源夏小雨向阳朱宝利杨毅
- 关键词:宫颈病变聚合酶链式反应DNA测序基因分型