国家自然科学基金(30972371)
- 作品数：4 被引量：27H指数：3
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- 相关机构：中南林业科技大学教育部更多>>
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- 松乳菇ITS序列比较及其在乳菇属中的系统发育分析被引量：9
- 2013年
- 提取江苏、云南、江西、湖南、广西、安徽、湖北地区的松乳菇(Lactarius deliciosus)、红汁乳菇(L.hatsudake)、橙色乳菇(L.akahatsu)和鲑色乳菇(L.salmonicolor)共25个子实体样本的基因组DNA,扩增ITS序列,对GenBank下载和本次及以前测序的松乳菇ITS序列的碱基组成、变异位点及碱基替换类型进行分析,从GenBank下载乳菇属其它8个种,构建乳菇系统发育树。结果显示:松乳菇ITS序列共有20 bp长度的变化,碱基C、T含量大于G、A含量。变异位点ITS共有99个(ITS1 58个、5.8S 4个、ITS2 37个),其中主要是T与C的转换,转换与颠换位点数分别为8和5。ITS1、5.8S、ITS2中转换与颠换的比值R分别为2.34、1.95、1.12。基于ITS序列计算不同地区松乳菇间的遗传距离,江西与意大利、西班牙,法国与西班牙序列间的遗传距离最大为0.012,云南和法国序列间遗传距离为0,是同源序列。系统发育树显示:松乳菇和红汁乳菇、橙色乳菇亲缘关系较近。
- 陈玉华刘君昂周国英李河王圣洁路宗岩
- 关键词：松乳菇ITS序列系统发育
- 中国南方地区松乳菇遗传多样性分析被引量：15
- 2011年
- 松乳菇Lactarius deliciosus是一种对松树的生长具有重大意义的外生菌根真菌,具有很高的经济价值,因无法人工培育,过度的人工采摘造成产地生态的严重破坏。比较中国南方3个省9个不同地区的68个松乳菇的rDNA ITS区碱基序列的差异,以期研究各不同群体的ITS单倍体型多样性,不同地区群体之间的遗传关系,以及遗传分化与地理隔离的关系。遗传分析发现,得到的68个松乳菇样品的ITS序列可认定为7种单倍体型,这些单倍体型聚集为2个不同的系统进化群体,表现出两种不同的系统进化方向。7种单倍体型中,两个主要的单倍体型(Haplotype3和Haplotype6)分别含有34和26个样品,且基本上每个样品采集地都有分布。AMOVA测试中,观察到的总的单倍体型变异频率主要体现在不同地理种群的个体内(84%)。剩下的16%属于不同地理种群间的变异,PhiPT的显著性分析结果p<0.01。Mantel测试显示地理距离与遗传差异FST值没有显著的线性关系(p=0.32)。研究结果说明松乳菇自然种群间有一定程度的基因漂流发生。群体遗传分析还发现在松乳菇自然种群中存在显著遗传分化,但遗传分化程度与地理距离没有显著的线性关系。
- 郭亮刘君昂周国英李河
- 关键词：外生菌根真菌遗传分化基因漂移
- 基于形态特征和ITS序列分析对湖南松菌的分类鉴定被引量：7
- 2011年
- 基于子实体及孢子的形态特征,结合ITS序列分析对湖南省松林中分布最多的4种松菌进行分类鉴定。样品CSUFTHH1、CSUFTHH2、CSUFTZJ和CSUFTHY分别鉴定为乳菇属未知种(Lactariussp.)、松乳菇(L.deliciosus)、橙红乳菇(L.akahatsu)以及红汁乳菇(L.hatsudake)。
- 郭亮刘君昂周国英李河
- 关键词：乳菇属ITS序列
- 橙黄乳菇遗传多样性分析被引量：2
- 2012年
- 分析来自湖南省道县(DX)、张家界市(ZJJ)、芷江县(ZJ)、麻阳县(MY)和贵州省玉屏县(YP)以及泰国(TL)6个橙黄乳菇种群38个菌株的ITS-5.8S序列的遗传结构和遗传多样性。所有的ITS-5.8SrDNA序列样品共检测到2个变异位点,碱基A、T、G、C的平均含量分别为22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根据序列的核苷酸变异共定义了3种单倍型,其中单倍型Hapolotype 3是湖南和贵州5个种群共享单倍型,Hapolotype 2为6个种群的共享单倍型。中国橙黄乳菇各地区种群的单倍型多样性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之间,表明橙黄乳菇种群具有较高的单倍型多样性。遗传分化指数(fixation index,FST)表明,不同地理种群间的遗传分化较大。AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的17%,种群内部变异占总变异的83%。Mantel测试显示地理距离与种群的遗传分化FST值之间线性关系显著(P<0.05)。采用N-J法构建的分子系统树表明,当与乳菇属相近种进行比较时,湖南、贵州和泰国不同地区的所有橙黄乳菇样品紧密聚为一支。采用中性检验进行分析,推测湖南橙黄乳菇群体样品在进化上遵循中性模型,并且经历过种群扩张过程。研究结果表明橙黄乳菇种群具有丰富的遗传多样性。
- 李河徐建平郭亮刘君昂周国英朱丹雪
- 关键词：地理种群遗传分化
