天津市科委基金(023616211)
- 作品数:1 被引量:2H指数:1
- 相关作者:杜智聂福华高英堂阚学锋王毅军更多>>
- 相关机构:天津市第三中心医院更多>>
- 发文基金:天津市卫生局科技基金天津市科委基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 肝细胞癌高表达基因cDNA文库的构建及生物信息学分析被引量:2
- 2006年
- 目的:构建肝细胞癌的高表达基因cDNA文库并进行相应的生物信息学分析。方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术,以7对肝癌组织和癌旁组织为实验材料,构建肝癌高表达基因的cDNA文库;使用BioEdit、BLAST和EGAD等软件进行生物信息学分析。结果:获得1450个白色阳性克隆,经PCR扩增后均有100~1000bb的插入片段,经杂交验证选取125个克隆进行测序;经BLAST、EGAD等生物信息学工具分析获得基因83个,其中细胞分裂相关基因5个,参与细胞信号转导或通讯的基因5个,参与细胞结构或运动的基因7个,细胞或器官防御相关基因11个,参与细胞内基因转录或蛋白表达的基因22个,代谢相关基因18个,另有15个未归类基因。结论:利用SSH技术可构建肝细胞癌组织差异表达基因的消减cDNA文库,为进一步深入探讨肝癌的诊断、治疗和预后评估等提供更多的分子指标。
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- 关键词:肝细胞癌抑制性消减杂交CDNA文库生物信息学