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贵州省科学技术基金(J[2011]2280)
作品数:
2
被引量:8
H指数:1
相关作者:
王定明
唐光鹏
阎岩
郭军
周敬祝
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相关机构:
贵州省疾病预防控制中心
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发文基金:
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2008~2011年贵州省肠道病毒71型分子流行特征分析
被引量:7
2013年
为研究贵州省肠道病毒71型(EV71)的基因型和分子流行特征,监测了全省报告的手足口病病例,选择2008年以来贵州全省部分EV71阳性标本进行病毒分离及VP1全基因测序(含重症病例、死亡病例和轻症病例),与国内外近年流行毒株及各亚型代表株进行基因比对,分析同源性及基因亚型。2008年、2009年及2011年贵州省流行的主要病原为EV71,获得109株参比序列毒株的同源性为95.3%~99.7%,贵州省毒株与邻省及山东省、上海市、南京市、吉林省和宁波市代表株的同源性最高,轻症与重死病例的核苷酸及氨基酸序列无明显的特征性差异,未出现不同基因亚型病毒的输入或改变,仍属C4a亚型。同地区、同年度内的核苷酸序列差异小于跨地区、跨年度差异。
阎岩
郭军
周敬祝
唐光鹏
王定明
关键词:
手足口病
VP1基因
单种及联合靶向EV71VP1~VP4基因的shRNA干扰病毒复制的研究
被引量:1
2014年
目的检测单种及2种联合靶向Ev71病毒衣壳蛋白VP1、VP2、VP3、VP4基因(VP1~VP4)的shRNA干扰病毒复制的效果。方法靶向EV71病毒的VP1~VP4基因序列设计及合成shRNA,并分别将其克隆到慢病毒质粒表达载体pLOV.CMV.EGFP中。重组表达质粒同psPAX2和pMD2.G共转染293T细胞,3d后收集上清中的重组病毒颗粒。用荧光定量RT—PCR法(real—timeqRT—PCR)和Westernblot检测单种及2种联合shRNA干扰EV71mRNA的表达水平及病毒蛋白的表达水平。结果靶向EV71VP1-VP4基因的shRNA对本研究的毒株(含死亡病例、重症病例、普通病例,FY0805)复制干扰差异无统计学意义(P〉0.05),对EV71病毒的抑制率分别约为:sh-VP1—1(51.6%),sh—VP1—2(85.1%),sh—VP1-3(76.4%),sh-VP2—1(57.5%),sh-VP2-2(81.4%),sh—VP2-3(79.5%),sh—VP3(68.9%),sh—VP4(56.7%),且有剂量依赖性。干扰病毒效率最高的为sh—VP1-2联合sh—VP2—2,抑制率可达96.6%,联合组均比单种加倍剂量的抑制率高。结论本研究设计的单独及联合靶向EV71病毒衣壳蛋白每个基因区均筛选到抑制率均大于50%的shRNA,且联合shRNA可以增强其干扰复制的能力。
阎岩
李世军
郭军
周敬祝
唐光鹏
王定明
关键词:
基因靶向
EV71
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