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上海市卫生局科研基金(2010163)

作品数：1 被引量：1H指数：1
相关作者：马小军李健蔡郑东孙梦熊李国东更多>>
相关机构：同济大学更多>>
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相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白筛选
  • 1篇血清
  • 1篇血清标志
  • 1篇肉瘤
  • 1篇聚合酶
  • 1篇骨肉瘤
  • 1篇合酶
  • 1篇多肽
  • 1篇RNA聚合酶
  • 1篇F

机构

  • 1篇同济大学

作者

  • 1篇华莹奇
  • 1篇孙伟
  • 1篇李国东
  • 1篇孙梦熊
  • 1篇蔡郑东
  • 1篇李健
  • 1篇马小军

传媒

  • 1篇中华肿瘤杂志

年份

  • 1篇2011
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
骨肉瘤血清标志蛋白筛选及对RNA聚合酶Ⅲ多肽F的初步生物信息学分析被引量：1
2011年
目的筛选潜在的骨肉瘤血清蛋白标志物，对候选标志基因RNA聚合酶Ⅲ多肽F（POLR3F）进行初步生物信息学分析。方法分别利用人类基因组芯片和表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOFMS）筛选骨肉瘤细胞株以及骨肉瘤患者血清中差异表达的基因和标志蛋白。运用Link—test统计学方法对比基因：巷片和SELDI—TOFMS数据，寻找骨肉瘤的血清诊断标志蛋白。用MATLAB软件对POLR3F的启动子和3’-UTR区域进行生物信息学分析，寻找转录因子和微小RNA（miRNA）靶位点。结果与对照组相比，有653个基因在骨肉瘤细胞中的表达差异倍数在2倍以上。SELDI—TOFMS显示，在骨肉瘤患者血清中有6个差异表达的质谱峰。通过Link-test分析，共鉴定出13个差异表达的骨肉瘤血清标志蛋白。POLR3F的启动子区存在保守的信号转导和转录激活因子3（STAT3）结合位点，在3’-UTR保守区域含有1个miRNA靶位点。结论Link-test能够有效地从转录组和蛋白质组数据中筛选骨肉瘤标志蛋白。POLR3F有可能成为骨肉瘤早期诊断的标志蛋白和骨肉瘤治疗的新靶点。
李国东蔡郑东马小军孙梦熊李健孙伟华莹奇
关键词：骨肉瘤血清
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