国家自然科学基金(81201143) 作品数:3 被引量:24 H指数:2 相关作者: 董继扬 沈桂平 邓伶莉 陈忠 许晶晶 更多>> 相关机构: 厦门大学 安徽中医药大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 福建省自然科学基金 更多>> 相关领域: 理学 更多>>
基于K-L散度的核磁共振波谱数据尺度缩放方法 被引量:4 2014年 在基于核磁共振(NMR)的代谢组学数据分析中,尺度缩放是关键的预处理步骤之一,其主要目的是通过调整数据的方差结构,改善后续的多变量统计分析的结果。从信息熵的角度出发,利用KullbackLeibler(K-L)散度来度量不同实验分组的生物样品的1 H NMR波谱数据的差异程度,并结合单位方差缩放法,提出一种基于K-L散度的尺度缩放方法。该方法先利用单位方差法将数据各变量的标准差调整到同一水平上,再利用K-L散度对各变量进行有监督地加权,增强重要变量、减弱无关变量。由于K-L散度是在概率分布的意义上度量数据间的差异程度,且对于高斯和非高斯分布的数据均适用,因此能更准确地度量不同实验分组样品的1 H NMR波谱数据的差异性,从而更有效地地对谱数据的重要变量进行识别和加权。人群尿液1 H NMR波谱数据的分析结果表明,基于K-L散度的尺度缩放方法能有效抑制噪声变量,同时很好地区分特征变量和非特征变量;提高主成分回归(PCR)模型的判别能力;改善偏最小二乘回归判别分析(PLS-DA)模型的解释能力、预测能力以及对特征代谢物的辨识能力。 邓伶莉 Cheng Kian-Kai 沈桂平 周玲 刘新卓 董继扬 陈忠关键词:核磁共振波谱 代谢组学 家族性甲亢患者血清和尿液的核磁共振代谢组学研究 被引量:18 2013年 采用基于核磁共振(NMR)的代谢组学方法,研究了家族性甲亢患者、非家族性甲亢患者和健康志愿者人群的血清和尿液的代谢差异.结果表明,家族性甲亢组血清样品中的乙酰乙酸、柠檬酸及牛磺酸等代谢物的浓度显著升高,超低密度脂蛋白、低密度脂蛋白、乳酸及甘氨酸等代谢物的浓度显著降低;尿样中的肌酐和葡萄糖的浓度显著升高,琥珀酸、苯乙酰甘氨酸及马尿酸等代谢物的浓度显著降低.以上结果表明家族性甲亢患者可能存在糖和脂类代谢的紊乱、肝脏和肾脏功能的损伤以及肠道环境的破坏等.此外,家族性甲亢组血清样品中的乙酰乙酸、葡萄糖、柠檬酸及肌酐等代谢物的浓度显著升高,表明家族性甲亢人群的肾脏功能受损更为严重,由此可区分家族性与非家族性甲亢的NMR代谢轮廓. 沈桂平 戴晓侠 邓伶莉 危阳洋 许晶晶 王彩虹 董继扬 陈忠关键词:核磁共振 代谢组学 电针胃经穴大鼠体液的~1H NMR代谢轮廓分析 <正>胃粘膜损伤是由于情志应激、理化因素、微生物等因素引起的胃粘膜炎症、糜烂和出血的疾病。现代研究表明多种难治性胃病首先表现为胃粘膜损伤,进一步导致胃粘膜坏死、腺体萎缩、穿孔、癌变等恶劣后果。目前临床和实验研究皆证实针灸... 许晶晶 刘晓莎 刘琼 杨宗保 董继扬 陈忠文献传递 五常稻花香米的~1H NMR代谢轮廓分析 <正>五常大米是国家质检总局认定的地理标志产品。稻花香是五常大米中的一个独特品种,深受广大消费者的喜爱。然而,由于缺乏有效的鉴别方法,市场上假冒五常大米的情况日益严重。据报道,五常大米的年产量仅为80万吨,而全国各地的年... 何瑶 郑彦婕 罗美中 杨万颖 许晶晶 董继扬 陈忠文献传递 妊娠期糖尿病患者体液~1H NMR代谢轮廓分析 <正>妊娠期糖尿病(GDM)是妊娠期常见的并发症之一,对母婴的危害极大[1]。GDM的病理机制尚未清楚,其早期诊断方法也不成熟。基于NMR的代谢组学研究机体内源性小分子代谢物的组成随疾病发生和发展的变化规律,为GDM的研... 周玲 Cheng Kian-Kai 沈桂平 许晶晶 董继扬 陈忠文献传递 铜负荷大鼠基底节对肝豆灵代谢响应的^1H NMR研究 被引量:2 2016年 采用核磁共振氢谱(1H NMR)技术与多元统计分析相结合的方法,对肝豆灵对大鼠基底节铜损伤的调节机制进行研究。24只雄性Wistar大鼠随机分为正常组、模型组和肝豆灵组,每组8只,以铜负荷法造模。从造模第7周开始,肝豆灵组大鼠以肝豆灵灌胃。数据分析显示:与正常组比较,模型组的基底节细胞凋亡指数显著增高(p<0.01);基底节组织中的谷氨酰胺、尿苷、苏氨酸含量升高(p<0.05),甘露醇、腺苷、N-乙酰天冬氨酸、谷氨酸、N-乙酰谷氨酸(NAG)、天冬酰胺、乙酸、天冬氨酸、肌醇、三磷酸腺苷(ATP)含量降低(p<0.05);与模型组相比,肝豆灵组的基底节细胞凋亡指数显著降低(p<0.01);基底节组织中的谷氨酰胺、尿苷、乙酸、天冬氨酸含量降低(p<0.05),甘露醇、腺苷、苏氨酸、N-乙酰天冬氨酸、谷氨酸、N-乙酰谷氨酸、天冬酰胺、肌醇、ATP含量升高(p<0.05)。研究结果表明,肝豆灵可影响铜负荷大鼠基底节的代谢,对铜损伤具有一定的修复作用,其机制可能是通过调节氨的解毒和兴奋性氨基酸类神经递质的代谢,干预能量代谢,恢复神经元和神经胶质细胞功能。 蒋怀周 许晶晶 董继扬关键词:基底节