江苏省高校自然科学研究项目(09KJB10006)
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 相关作者：齐晓花陈学好罗晶晶徐强更多>>
- 相关机构：扬州大学更多>>
- 发文基金：江苏省科技基础设施建设计划项目江苏省高校自然科学研究项目江苏省科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 黄瓜抗白粉病品系cDNA文库构建及EST分析被引量：3
- 2010年
- 采用SMART技术构建了高抗白粉病的黄瓜品系JIN5-508的叶片cDNA文库,并对其进行了质量鉴定。结果表明,该文库的重组率为95.3%,库容量为1.02×106pfu·mL-1,平均插入片段为0.5kb左右,是一个高质量的cDNA文库。利用该文库随机挑选的8352个克隆从5′端进行单向测序,共获得8035个有效的ESTs(expressed sequence tags),序列的平均长度为838bp。进一步的生物信息学分析表明:EST序列拼接出3467个unigenes,其中包括953个contigs和2514条singletons,文库冗余度较低,为56.9%;从文库中筛选出了大量的低丰度表达基因,约占unigene总数的72.5%,说明文库的复杂性较高;1991个unigenes获得分子功能注释,其中与蛋白结合活性和催化活性相关的基因分别达到了41.34%和38.72%;在获得功能注释的unigene中,有部分抗病抗逆相关基因高丰度表达,其中3个unigenes与拟南芥白粉病抗性基因Mlo2、Mlo8和Mlo14高度同源,表明该文库可为进一步研究黄瓜抗白粉病相关的特异基因的克隆及功能验证奠定基础。
- 齐晓花罗晶晶Mouammar Alfandi马威徐强陈学好
- 关键词：黄瓜白粉病CDNA文库
