国家教育部博士点基金(20121210120006)
- 作品数：3 被引量：25H指数：3
- 相关作者：田晓轩朱彦刘杰张春晖赵亚楠更多>>
- 相关机构：天津中医药大学更多>>
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- 基于DNA条形码区域的中药地鳖隐存物种多样性发现研究被引量：6
- 2014年
- [目的]基于DNA条形码COI数据,发现地鳖(土鳖虫主要基原)内部可能的隐存多样性。[方法]对8批33个地鳖个体的线粒体COI片段进行PCR扩增及序列测定。分析COI序列单倍型,分析变异位点,运用邻接法、最大简约法分别构建分子系统发育树,结合种群(批次)内及临时种间的遗传距离发现隐存多样性。[结果]根据系统发育结果区分临时种EsPS1及EsPS2。分析得到COI基因的物种间阈值SST为5.33%。临时种EsPS1与EsPS2间的最小遗传距离为12.00%,显著大于物种间阈值SST。[结论]地鳖内部存在隐存物种多样性。
- 田晓轩刘杰肖咪王鹏朱彦
- 关键词：DNA条形码
- 药用动物乌梢蛇线粒体基因组全序列分析被引量：4
- 2016年
- [目的]获取药用动物乌梢蛇线粒体基因组全序列。[方法]采用Ion Torrent PGM技术,对乌梢蛇全基因组DNA进行提取测序,采用MIRA方法从头组装方法和近缘种mapping方法进行组装拼接,应用MITOS等方法进行注释。[结果]获得17 162 bp乌梢蛇线粒体基因组全序列。其共编码22个tRNA,13个蛋白编码基因,2个rRNA(16S rRNA、12S rRNA)并有1个轻链(L链)复制起始区。[结论]获取乌梢蛇线粒体基因组全序列,并可用于该药用动物的资源调查与保护研究。
- 刘杰田晓轩崔英朱彦
- 关键词：乌梢蛇线粒体基因组线粒体DNA
- 中成药大黄蛰虫丸的宏条形码基原鉴定被引量：16
- 2014年
- [目的]探索应用宏条形码方法进行复方中成药基原鉴定分析的可行性。[方法]磁珠法提取中药大黄蛰虫丸DNA,以16S、trnL及Mini-barcode为靶标进行荧光定量PCR。产物经克隆测序拼接后,经BLASTn比对,用MEGAN软件进行分类单元解析,对虻虫来源序列应用MEGA软件进行遗传分析。[结果]从23条单克隆测序结果中解析到蛴螬、虻虫、甘草及桃仁或苦杏仁等中药成分,对虻虫6条序列分析,显示其源于3组遗传差异较显著的个体。[结论]宏条形码技术可用于中成药成分的鉴定,可作为中成药质量评价的潜在工具。
- 田晓轩刘杰窦永杰赵亚楠吕朝耕张春晖朱彦
- 关键词：中成药
