四川省教育厅资助科研项目(11ZA084)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：贾仁勇徐雨李鹏飞卢燕燕张志龙更多>>
- 相关机构：四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室更多>>
- 发文基金：四川省自然科学基金四川省教育厅资助科研项目国家科技部科技人员服务企业行动项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 鸭圆环病毒Cap基因酵母双杂交诱饵载体的构建及鉴定被引量：1
- 2015年
- 为构建鸭圆环病毒Cap基因酵母双杂交诱饵载体,以本实验室分离鉴定的DuCV GH01株Cap基因为模板,对其进行酵母密码子优化后,连接到pGBKT7载体上构建诱饵质粒,经菌落PCR、酶切鉴定以及测序后,转化酵母菌株Y2HGold感受态,检测诱饵蛋白表达以及诱饵蛋白对酵母细胞毒性和自激活现象。结果表明,优化后的Cap基因全长774bp,成功连接到诱饵载体pGBKT7中,重组质粒pGBKT7-Cap转入酵母细胞后,Western blot检测到50kD左右的蛋白条带,诱饵蛋白对酵母细胞既无毒性,又没有自激活现象。为进一步利用酵母双杂交技术筛选与Cap蛋白互作的蛋白奠定了基础。
- 徐雨张志龙卢燕燕张蕾李鹏飞贾仁勇
- 关键词：鸭圆环病毒酵母双杂交诱饵载体
- 鸭乙型肝炎病毒CHv株PreS/S基因的克隆及分子特性分析被引量：1
- 2013年
- 为了给鸭乙型肝炎病毒(DHBV)PreS/S基因及其编码蛋白功能特性的研究提供理论依据,用PCR扩增DHBV-CHv株的PreS/S基因并将其克隆到pMD18-T载体进行测序,运用生物学软件对PreS/S基因与来自不同地区的17株DHBV及禽嗜肝DNA病毒属的其他5种病毒PreS/S基因的相似性及系统进化分析,预测了其编码蛋白的信号肽、N-糖基化位点、磷酸化位点、跨膜区及蛋白二级结构,并对其密码子偏爱性和抗原性进行分析。结果显示,PreS/S基因全长1 101bp,编码366个氨基酸,DHBV-CHv属于中国分离群,且与国内DHBV河南分离株相似性最高,达到94.8%。DHBV-PreS/S编码的蛋白不含信号肽,具有2个潜在的N-糖基化位点和13个潜在的磷酸化位点;其C端存在3个跨膜区域;α螺旋和无规则卷曲分别占到31.97%和65.57%;密码子偏爱性显示其对Leu,Ser,Thr,Gly,Pro,Ile,Gln,Ala和Lys等氨基酸具有一定的偏爱性;抗原表位主要集中在该蛋白的39～55aa,97～150aa,179～201aa区域。分析结果显示PreS/S编码的包膜蛋白为一C端锚定的膜蛋白,体外表达选择真核系统更为合适,同时其抗原性较好的97～150aa区域适合用于截短表达制备抗体,为进一步开展其蛋白生物学功能的研究提供参考。
- 刘强贾仁勇
- 关键词：鸭乙型肝炎病毒PRESS基因分子特性生物信息学分析
