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国家重点基础研究发展计划(2007CB914304)

作品数:6 被引量:9H指数:2
相关作者:来茂德马兰王海兵林洁黄琼更多>>
相关机构:浙江大学复旦大学中国科学院福建物质结构研究所更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
相关领域:生物学医药卫生理学更多>>

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 4篇生物学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇理学

主题

  • 2篇生物学
  • 2篇细胞
  • 1篇蛋白
  • 1篇多效生长因子
  • 1篇胰岛
  • 1篇胰岛素
  • 1篇胰岛素抵抗
  • 1篇英文
  • 1篇原核
  • 1篇原核表达
  • 1篇整合素
  • 1篇脂肪
  • 1篇脂肪细胞
  • 1篇指纹图谱
  • 1篇融合蛋白
  • 1篇生物学行为
  • 1篇生物学性质
  • 1篇肿瘤
  • 1篇周期
  • 1篇肽指纹图谱

机构

  • 2篇浙江大学
  • 1篇复旦大学
  • 1篇中国科学院
  • 1篇厦门大学
  • 1篇中国药科大学
  • 1篇中国科学技术...
  • 1篇中国科学院研...
  • 1篇中国科学院福...
  • 1篇合肥微尺度物...

作者

  • 2篇来茂德
  • 1篇季朝能
  • 1篇黄琼
  • 1篇黄明东
  • 1篇林洁
  • 1篇田长麟
  • 1篇侯晓敏
  • 1篇陈明晃
  • 1篇袁彩
  • 1篇彭奇
  • 1篇王海兵
  • 1篇赖超华
  • 1篇柳青
  • 1篇马兰

传媒

  • 1篇生物技术通讯
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇临床与实验病...
  • 1篇生物物理学报
  • 1篇Scienc...
  • 1篇第十五届全国...

年份

  • 1篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2010
  • 2篇2009
  • 2篇2008
6 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
人源膜蛋白组跨膜螺旋蛋白的预测与分析(英文)
2011年
我们对于两个主要人源基因组数据库(NCBI和UniprotKB/Swissprot)中已知功能的跨膜螺旋膜蛋白进行了系统化的预测和分析。首先应用TMHMM算法预测了每个膜蛋白跨膜螺旋的拓扑结构,应用SignalP预测算法剔除其中的含信号肽的分泌蛋白,并根据蛋白质的已知功能排除信号肽预测中的假阳性结果。同时,在整个跨膜螺旋膜蛋白组中,或者在不同功能类别中,进行了跨膜螺旋数量和分子量分布的分析;并在此基础上,进一步分析了每个跨膜螺旋的氨基酸分布及相对于细胞膜的不同位置上的氨基酸分布。对具有已知功能的人类螺旋膜蛋白的全基因组预测和分析为进一步研究膜蛋白三维结构、功能及蛋白质间的相互作用提供了良好的开端。
赖超华柳青田长麟
人类多效生长因子(Pleiotrophin)的全基因合成、原核表达与纯化被引量:2
2012年
PTN作为重要的细胞因子,存在于多种生物体内,参与多种生物学过程,具有刺激细胞增殖、分化、粘附、迁移等多种功能。根据PTN的基因序列及大肠杆菌密码子的偏爱性,人工合成ptn基因,构建pMAL-his-sumo-ptn重组表达载体,将重组表达载体转化到E.coli(Rosetta)中并进行优化表达。融合蛋白在0.4 mmol/L IPTG、37℃条件下诱导3 h表达量最高。收集菌体、纯化、酶切、SDS-PAGE可检测到分子量为18 kD左右的重组蛋白。
马兰季朝能
关键词:密码子优化原核表达融合蛋白
Evaluation of non-covalent interaction between Seryl-Histidine dipeptide and cyclophilin A using NMR and molecular modeling被引量:2
2010年
Seryl-Histidine dipeptide(Ser-His) has been previously reported to be capable of cleaving DNAs and carboxyl esters,as well as proteins.The protein cleavage mechanism has not been addressed yet.As an initial step of protein cleavage activity,the non-covalent binding affinity of Ser-His for proteins is a crucial prerequisite.In this work,we took cyclophilin A(CyPA) as a substrate protein,and evaluated the non-covalent interaction between CyPA and Ser-His using a combination of NMR spectroscopy and molecular modeling approach.Two independent Ser-His binding sites on CyPA were detected using 15N-1H heteronuclear single-quantum coherence(HSQC) spectra.Each binding site binds one Ser-His molecule.Dissociation constants,Kd1 and Kd2,were estimated to be 2.07 and 6.66 mmol/L,respectively,indicative of the weak non-covalent interaction between Ser-His and CyPA.Based on molecular modeling results,we suggest that both the α-amino and the side chain hydroxyl group of Ser-His are crucial for the non-covalent interaction between Ser-His and CyPA.This work sheds light on the molecular mechanism of Ser-His and its analogues cleaving proteins.
LIU Yan1,SHI YanHong2,LIU XiaoXia1,LIN MingKun1,LIN DongHai1,2 & ZHAO YuFen1,3 1Key Laboratory for Chemical Biology of Fujian Province,Department of Chemical Biology,Department of Chemistry,College of Chemistry and Chemical Engineering,Xiamen University,Xiamen 361005,China 2Shanghai Institute of Materia Medica,Shanghai Institutes of Biological Sciences,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 201203,China 3Key Laboratory for Bioorganic Phosphorus Chemistry and Chemical Biology,Ministry of Education,Department of Chemistry,School of Life Sciences and Engineering,Tsinghua University,Beijing 100084,China
关键词:CYCLOPHILINHSQCNON-COVALENT
保守的二硫键对大鼠lipocalin型前列腺素D合成酶生物学性质的影响
Lipocalin型前列腺素D合成酶(L-PGDS)主要分布于中枢神经系统、雄性生殖器官和人的心脏等器官中,并被分泌到脑脊液、精浆及血浆中。L-PGDS是一种糖基化的单体蛋白质,同时又是一种双功能蛋白,具有催化PGD的合...
刘家福郭晨云高红昌姚一贺林东海
文献传递
IGFBP7诱导3T3-L1脂肪细胞发生胰岛素抵抗
糖尿病、代谢综合征作为目前危及人类健康的重大疾病,研究它们的发病机制,以此寻找其有效的治疗途径以及预防方法成为了越来越紧迫的任务。IGFBP7作为一个可能与糖尿病相关的基因,进行其相关生物效应及分子机制的研究有重要的意义...
王海兵阮文静来茂德
关键词:IGFBP73T3-L1脂肪细胞胰岛素抵抗
文献传递
5-氮-2′-脱氧胞苷对结肠癌细胞生物学行为的影响被引量:2
2008年
目的检测去甲基化药物5-氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine,5-aza-dC)对结肠癌细胞株SW620、COLO205和HT29生物学行为的影响,并研究该药物对多个基因表达的影响。方法5-aza-dC处理对各结肠癌细胞生长周期、凋亡、细胞迁移和侵袭能力的影响分别采用流式细胞术、Annexin V/Propidium Iodide法、细胞划痕实验和Transwell小室侵袭实验检测。采用RT-PCR法检测抑癌基因THBS1、TIMP3、RASSF1A和癌基因c-myc、c-fos、bax在5-aza-dC处理前后各结肠癌细胞株中的表达改变情况。结果5-aza-dC处理后,3株结肠癌细胞的生长周期均明显阻滞于G2/M期,细胞凋亡率显著增加(P<0.05)。划痕实验后72h,对照组结肠癌细胞明显向划痕的中央迁移,而药物处理组结肠癌细胞迁移不明显。5-aza-dC处理后,结肠癌细胞的侵袭能力较未处理组降低(P<0.05)。5-aza-dC可恢复结肠癌细胞中多个抑癌基因的表达,但是对癌基因的表达没有影响。结论5-aza-dC对结肠癌细胞有阻滞细胞生长周期、促进凋亡及抑制细胞迁移和侵袭能力等作用,该作用可能是通过恢复多个抑癌基因的表达来实现的。
林洁黄琼来茂德
关键词:结肠肿瘤细胞周期
整合素αMβ2 I-结构域的基因合成和蛋白表达被引量:1
2009年
目的:利用大肠杆菌表达系统表达整合素αMβ2 I-结构域,并对其进行纯化。方法与结果:利用DNAWorks在线引物程序设计经过密码子优化的整合素αMβ2 I-结构域的寡核苷酸序列;采用PCR介导的基因拼装法合成αMβ2 I-结构域DNA模板,将其克隆至原核表达载体pET11d-6h上,并转化大肠杆菌,获得表达菌株;经IPTG诱导,αMβ2 I-结构域在大肠杆菌BL21(DE3)中获得高效表达,表达产物经Ni-NTA琼脂糖层析柱纯化后,纯度达到90%以上;电喷雾电离质谱测定表明纯化所得的蛋白精确的相对分子质量为23720.0,与预期值相符;肽指纹质谱图谱鉴定其为目的蛋白。结论:αMβ2 I-结构域的高效表达,为进一步研究其与配体的结合及其复合物晶体结构奠定了基础。
侯晓敏袁彩彭奇陈明晃黄明东
关键词:整合素肽指纹图谱
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