国家重点基础研究发展计划(2014CB138302)
- 作品数：41 被引量：239H指数：10
- 相关作者：谢宝贵严俊杰陶永新江玉姬张磊更多>>
- 相关机构：福建农林大学中国科学院沈阳农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 草菇谷胱甘肽S-转移酶编码基因(vv-gto1)的序列分析及其差异表达被引量：9
- 2014年
- 【目的】通过对草菇组学数据的分析,获得一个谷胱甘肽S-转移酶(GSTs)编码基因(vv-gto1),对其基因结构、序列特征及表达情况进行分析,探索GSTs在食用菌生长发育过程中的作用机制,并为其他食用菌GSTs编码基因的发现提供依据。【方法】应用ZOOM软件将基因组与转录组的测序读段(reads)与基因组拼接序列进行定位确定基因全长及其序列准确性,并对基因结构进行可视化分析。采用MEGA 5.1进行多序列比对及进化树分析,对草菇GTO1进行功能归类及同其他真菌的亲缘关系分析。结合表达谱、蛋白质组数据分析该基因在草菇不同生长时期的差异表达,并应用荧光定量PCR进行验证。【结果】vv-gto1全长2083bp,含有11个外显子、10个内含子,编码356个氨基酸;5'端非翻译区长度为305bp、包含1个内含子区域,3'端非翻译区为86bp;RNA加工过程中有两个内含子存在保留现象,由内含子保留所形成的转录本均无法翻译形成正确的保守功能域。vv-gto1全长序列都获得超过50个reads的准确定位,证明该区段的基因组测序及组装结果正确可靠。进化树结果显示,草菇GTO1属于Omega类第I小类谷胱甘肽S-转移酶,与黄孢原毛平革菌的GTO1、GTO2亲缘关系最近。数字基因表达谱、荧光定量PCR及蛋白质组的分析结果表明,vv-gto1在异核体菌丝H1521的表达量最高。【结论】本研究首次在草菇中获得一个Omega类谷胱甘肽S-转移酶编码基因,该基因在异核体菌丝生物学功能的行使过程中可能起到重要作用,同时也暗示草菇异核体菌丝具备较强的抗逆性。另外,vv-gto1可以通过形成不同的可变剪接体来调节基因的转录和翻译,最终影响蛋白质的功能行使。
- 严俊杰郭丽石羡赵静静谢宝贵
- 关键词：异核体表达谱定量PCR
- 二氧化碳浓度影响金针菇形态发育机理初探
- 金针菇(Flammulina velutipes)味道鲜美、营养丰富,是我国的主要栽培食用菌之一。菌柄长度和菌盖大小是金针菇重要的商品性状,传统的理论认为,它们会受到环境中二氧化碳浓度的调控,二氧化碳浓度高会刺激菌柄伸长...
- 仝宗军严俊杰刘媛媛徐伟南黄蓉梅韩星谢宝贵
- 关键词：金针菇二氧化碳
- 文献传递
- 大型真菌光受体及其功能研究进展被引量：15
- 2015年
- 真菌通过光受体感受光信号,光除了调控大型真菌生理周期、形态变化和代谢产物产生外,还是大多数大型真菌原基分化和子实体生长的必要条件。本文对近年来大型真菌的光反应和光受体研究进行了概述。大型真菌中光受体研究目前仅限于WC‐1同源蛋白,WC‐1既有对光信号应答的能力,同时作为转录因子,又能激活下游基因的表达,但是不同物种中可能存在不同的靶基因。wc‐1基因敲除造成裂褶菌、蛹虫草子实体发育阻断。光受体及其作用机制的研究将为大型真菌子实体发育机制研究奠定基础。
- 郭明敏杨涛卜宁董彩虹
- 关键词：大型真菌光受体子实体发育
- 机械损伤诱导金针菇原基形成的分子机理
- 金针菇是工厂化生产程度最高的食用菌之一,子实体形成多少直接关系到金针菇企业的效益。机械损伤(生产中俗称'搔菌')可以显著诱导金针菇子实体的形成,然而其分子机理尚不清楚。本研究首先对机械损伤后的菌丝体进行RNA-Seq,筛...
- 陶永新李肖陈仁良严俊杰黄千慧朱坚江玉姬谢宝贵
- 关键词：机械损伤原基形成
- 文献传递
- 广西巴马小型猪Presenilin-2基因真核表达载体的构建及其在小鼠N2a细胞中的表达验证被引量：8
- 2015年
- 本研究的目的是构建广西巴马小型猪Presenilin-2真核表达载体并在细胞水平对其进行验证。利用RT-PCR的方法扩增并克隆Presenilin-2基因,再将Presenilin-2亚克隆到p EGFP-N1,通过脂质体转染方法将p EGFP-PS2-N1转至N2a细胞,48 h后在荧光显微镜下观察细胞是否表达绿色荧光蛋白。结果显示,本研究成功构建了阅读框架正确的广西巴马小型猪Presenilin-2基因真核表达载体,转染p EGFP-PS2-N1后,N2a细胞有绿色荧光蛋白的表达。该研究将为下一步研究Presenilin-2基因的功能和生产转Presenilin-2基因猪奠定基础。
- 吴延军陈秋明杨秀荣兰干球张名媛李艳君郭亚芬蒋钦杨
- 关键词：广西巴马小型猪N2A细胞阿尔茨海默病转基因猪
- 草菇分别在稻草诱导下和菌柄伸长中CAZy家族的表达调控
- 草菇(Volvariella volvacea)是一种典型的草腐生食用菌,也是一种常见的菌类蔬菜。然而在生产栽培中,有两大问题制约着草菇产业的发展:第一,生物学效率低;第二,易开伞,货架期短。生物学效率低,主要与草菇降解...
- 陶永新
- 关键词：草菇
- 文献传递
- 草菇NADPH Oxidase组成亚基的鉴定及非生物胁迫诱导vvcdc24上调表达的机制
- NADPH氧化酶(NADPH Oxidase)是真核生物细胞膜上产生活性氧信号以应答环境胁迫的主要酶复合体。本研究通过生物信息学方法注释获得草菇NADPH氧化酶六个组成亚基的编码基因,并对其基因结构、氨基酸序列特征进行系...
- 严俊杰谢斌张磊李肖谢宝贵
- 关键词：草菇NADPH氧化酶
- 文献传递
- 草菇超氧化物歧化酶家族基因的组成、结构及其表达的特殊性
- 超氧化物歧化酶是细胞防御活性氧毒害作用的第一道防线,在生物体应答胁迫、抵抗衰老以及细胞分化等过程中起到十分重要的作用。本研究基于草菇基因组测序结果注释获得1个Cu-Zn SOD编码基因和2个Mn SOD编码基因。亚细胞定...
- 严俊杰王瑞清谢斌张磊李肖谢宝贵
- 关键词：草菇超氧化物歧化酶可变剪接子实体发育
- 文献传递
- 金针菇戊糖磷酸途径的关键基因表达分析被引量：4
- 2019年
- 生物细胞主要依靠戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway,PPP)产生还原力,该途径也是细胞内各种单糖分子相互转变和不同结构糖分子合成的重要方式。PPP途径能够在生物的不同生长发育或代谢活动中发挥重要的作用。本研究基于金针菇单核体菌株W23基因组数据,使用KEGG数据库注释了与金针菇PPP途径相关的22个基因。进一步结合生物信息学分析手段,研究了两个限速酶:葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase,G6PDH)与6-磷酸葡糖酸脱氢酶(6-phosphogluconate dehydrogenase,6PGDH)基因结构,并利用金针菇不同发育时期的不同组织转录组数据,分析了这两个限速酶编码基因的表达模式。结果表明,两个基因编码蛋白均具有行使其功能的保守结构域,定位在细胞质中,包含多个磷酸化位点。G6PDH系统发育分析表明该基因较为保守,进化与物种分类地位相一致。基因g6pdh与6pgdh的表达量呈高度正相关(相关系数为0.99),两个基因在菌丝阶段的表达量均高于子实体阶段,并且在菌盖中表达量高于菌柄,显示了PPP途径在金针菇不同发育阶段的活跃程度。本研究能够为金针菇生长和发育过程研究提供理论参考。
- 张文静丑天胜刘芳吴安齐谢宝贵王威
- 关键词：葡萄糖-6-磷酸脱氢酶
- 甲型H1N1流感监测及其HA1基因特性分析,以2013~2014年新余市为例被引量：2
- 2015年
- 因HA基因的头部重链区（HA1）是流感病毒的抗原位点和受体结合位点,所以了解流感病毒的HA1基因特性可以评估当前WHO推荐的疫苗株的预防效果。本文选取新余市2013-2014年通过狗肾传代细胞（MDCK）培养分离到的H1N1流感毒株12株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增HA1基因片段。对序列分析发现2013-2014年新余市甲型H1N1流感病毒HA1基因序列与疫苗推荐株有较高的同源性,核苷酸同源性97.9%-98.5%。2013年的6株毒株HA1区与疫苗株比较,氨基酸变异位点7-11个,其中3株有2个变异位点在不同的抗原决定簇区。而2014年毒株单独集中在进化树的一支。以上提示,目前流感疫苗对2014年的流感人群仍有保护作用,对2013年的部分流行的H1N1预防效果有限;甲型H1N1爆发流行的可能性很大,应加强防控。
- 潘虹刘瑞弘文奇刘琴周银古熊英
- 关键词：血凝素基因进化分析
