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兵团博士基金(2013BB003)

作品数:3 被引量:14H指数:2
相关作者:刘永昌孙杰张新宇李艳军赵兰杰更多>>
相关机构:石河子大学湖南科技学院更多>>
发文基金:兵团博士基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 2篇启动子
  • 2篇胁迫
  • 2篇基因
  • 1篇盐胁迫
  • 1篇生物胁迫
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇水稻
  • 1篇拟南芥
  • 1篇启动子分析
  • 1篇基因家族
  • 1篇非生物
  • 1篇非生物胁迫
  • 1篇PLANT
  • 1篇U-BOX

机构

  • 2篇石河子大学
  • 1篇湖南科技学院

作者

  • 2篇孙杰
  • 2篇刘永昌
  • 1篇赵兰杰
  • 1篇李艳军
  • 1篇胡克坚
  • 1篇何福林
  • 1篇张新宇
  • 1篇刘小文
  • 1篇张涛
  • 1篇袁志辉
  • 1篇赵云龙
  • 1篇唐清

传媒

  • 2篇西北植物学报
  • 1篇分子植物育种

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2015
  • 1篇2014
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
雷蒙德氏棉Plant U-box(GrPUBs)基因家族生物信息学分析被引量:2
2018年
PUBs蛋白调控了作物的生长发育及响应非生物胁迫和生物胁迫的过程。为探讨棉花中U-box类型泛素连接酶家族,本研究利用生物信息学方法分析了二倍体雷蒙德氏棉中PUBs的数目、进化、基因结构、结构域分布及基因表达模式。结果表明,雷蒙德氏棉中有93个Gr PUBs基因家族成员,基因长度为1 101~11 191 bp。亚细胞定位预测结果表明,Gr PUBs编码产物大部分定位在细胞质和细胞核中,少数定位在胞外基质线粒体中。根据除U-box以外所含结构域将该家族成员分为7类,分别含有UFD2结构域、ARM结构域、激酶结构域、只含U-box、WD-40、TPR以及异构酶结构域。Gr PUBs基因家族染色体定位显示,基因在13条染色体上均有分布,但分布不均匀。在第5条染色体最多,有11条基因序列,第4、第12和Scaffold染色体上的基因最少,仅有2条。基因结构分析表明,基因内含子的数目变化较大,在0~17之间,且具有相似结构的基因,其编码蛋白聚为一类。基因表达模式分析发现。几乎1/3的基因在花中优势表达,个别基因在开花后10 d、20 d、30 d和40 d的种子中表达量高于在叶和花中的表达,如Gorai.006G251300。本试验为深入研究U-box类型泛素连接酶在棉花生长发育及抗逆的机理提供了理论指导。
刘永昌曾丽亚盘俊齐成媚袁志辉袁志辉胡克坚何福林
关键词:U-BOX生物信息学分析基因家族
水稻胁迫相关基因OsPM1启动子的克隆与分析被引量:5
2015年
依据NCBI数据库OsPM1的序列信息,采用PCR技术扩增获取OsPM1的2 100bp的启动子序列。利用PLACE预测启动子的顺式作用元件分析表明,启动子内含有大量与胁迫相关的顺式作用元件,主要有ABA响应相关元件、脱水响应元件、低温响应元件、热激响应元件和转录因子结合元件。构建OsPM1的启动子和GUS基因融合表达载体,转入拟南芥。组织化学染色分析结果显示,非生物胁迫处理前,幼苗中GUS基因表达水平很低;干旱、低温、高盐等胁迫处理后,GUS基因表达量显著升高。研究表明,OsPM1的启动子能够显著提高在干旱、高盐和低温处理后下游基因的表达水平。
裴柳玲唐清张涛赵云龙林书岱孙杰刘永昌
关键词:水稻非生物胁迫启动子
盐胁迫对拟南芥AtPUB18基因的诱导表达及其启动子分析被引量:7
2014年
用300mmol/L NaCl处理拟南芥幼苗,分别于处理后0、1、2、4、8、16、24、48h通过Northern Blot检测其AtPUB18基因的表达量。结果显示:拟南芥AtPUB18基因的表达量受高盐胁迫的诱导而升高,于处理后4h表达量达到最高,处理后16h表达量最低。采用PCR技术克隆AtPUB18的启动子,序列为1 974bp;序列分析发现启动子内含有大量与非生物胁迫相关的顺式作用元件,如HSE、LTR、MBS及ABRE;将启动子克隆到表达载体pCambia1300-221-GUS中,驱动报告基因GUS表达。组织化学染色结果表明,未经过高盐处理的幼苗中GUS基因表达水平很低;300mmol/L NaCl处理后GUS基因表达量显著升高。研究表明,AtPUB18的表达受高盐胁迫诱导,且AtPUB18基因的启动子是一个盐胁迫诱导型启动子。
张新宇赵兰杰李艳军孙杰刘永昌
关键词:拟南芥盐胁迫启动子
共1页<1>
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