广西壮族自治区自然科学基金(2010GXNSFD013033) 作品数:7 被引量:11 H指数:2 相关作者: 孙翔翔 梁丹洁 李春英 张欣明 欧莹 更多>> 相关机构: 广西大学 广西动物疫病预防控制中心 广东永顺生物制药股份有限公司 更多>> 发文基金: 广西壮族自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析 2013年 对广西猪源Ⅰ型副粘病毒F基因测序分析,为今后开展猪源副粘病毒的相关研究提供参考,也为有效防控副粘病毒感染奠定基础。参考GenBank发表的相关禽副粘病毒I型(Avian paramyxovirus serotype I,APMV-X)基因组序列,设计了1对特异性引物,用RT-PCR法分别扩增出病毒各F基因片段,并将目的基因片段回收纯化。测定得F基因的序列结果表明,从猪组织中分离获得1株猪源禽Ⅰ型副粘病毒,分离株F基因112~117位裂解位点的氨基酸组成为R-R-Q-R-R-F,与强毒株DQ417113、AF458012的裂解位点一致。同源性分析结果表明,分离株与标准强毒株的核苷酸同源性分别为87.5%和87.4%。猪源禽I型副粘病毒分离株为强毒株,属于基因Ⅰ型是传统型毒株,广西地区禽I型副粘病毒宿主范围呈不断扩大趋势。 张欣明 梁丹洁 李春英 胡巧云 欧莹 周师师 孙翔翔 熊毅 颜健华广西猪源H9N2亚型流感病毒的分离与鉴定 被引量:1 2011年 用SPF鸡胚从广西地区猪群中分离到1株H9N2型猪流感病毒(SIV),经鸡胚接种3代后出现稳定的鸡血红细胞凝集效价为27,且凝集性能被H9亚型阳性血清抑制,而不被其他亚型流感病毒阳性血清所抑制。分离株的HA基因及NA基因扩增结果显示,该毒株HA基因与流感病毒H9亚型同源性最高,NA基因与流感病毒N2亚型同源性最高,说明该病毒属于H9N2亚型猪流感病毒,命名为A/Swine/Guan-gxi/01/2009。 韦达有 伍和明 蒋家霞 付薇 孙翔翔 何奇松 马琳 徐贤坤关键词:猪流感病毒 H9N2亚型 HA基因 NA基因 马源禽Ⅰ型副粘病毒的分离与鉴定 2013年 【目的】了解广西马源Ⅰ型副粘病毒的生物特性,为今后有效防控副粘病毒在不同宿主间传播提供科学依据。【方法】用SPF鸡胚对广西百色疑似病马组织悬浮液进行病原分离培养后,经血清学试验和致病性试验鉴定,再用RT-PCR对分离株F基因进行扩增,并对扩增片段进行测序分析。【结果】分离获得的病毒能使鸡红细胞发生凝集,且这种凝集可被鸡新城疫(ND)标准阳性血清所抑制,HA和HI效价分别为27和210。分离株毒力试验结果显示,鸡胚平均死亡时间(MDT)为72 h,雏鸡脑内接种致死指数(ICPI)为1.48,属中发型毒株。分离株与禽I型副粘病毒基因Ⅶ型毒株NDV04-21、TW-96p的核苷酸同源性分别为95.9%和95.1%;基于F基因的遗传分型进化树显示,分离株与NDV04-21、TW-96p处于同一进化树分支,属于禽I型副粘病毒基因Ⅶ型;分离株F蛋白112~117裂解位点氨基酸序列与标准强毒株F48E9、HER33的一致,在第112~117位氨基酸序列为3'-R-R-Q-R-R-F-5'。【结论】广西马群已有禽I型副粘病毒存在,再次证实广西地区禽I型副粘病毒宿主范围在不断扩大。 李春英 蒋家霞 周师师 梁丹洁 张欣明 孙翔翔 欧莹 曾永芳 吴军 熊毅关键词:禽I型副粘病毒 毒力试验 F基因 同源性 不同动物来源的新城疫病毒F基因序列分析 被引量:4 2014年 为了解广西地区新城疫病毒(NDV)在不同动物宿主内的分布流行情况,对从广西地区鸡、野鸟、猪、鹅、马等5种不同动物体内分离到 NDV 毒株,进行了 F 基因的克隆扩增和序列分析。结果表明,5个NDV 分离株 F 基因的核苷酸序列同源性为85.2%~98.6%,推导氨基酸序列同源性为88.9%~98.6%,同源性差异较大;5个毒株的 F 基因与国内贵州、长春、福建等地的当前流行株同源性较高;以 F 基因前374 bp核甘酸同源性比较分型表明,鸡源、鹅源、马源毒株为当前流行的基因Ⅶ型,而猪源毒株和野鸟源毒株为传统的基因Ⅱ型。 冯淑萍 石伟革 孙翔翔 潘杰 黄胜斌 曾咏芳 何奇松 杨可研 胡巧云 熊毅关键词:新城疫病毒 F基因 同源性 来自5种动物禽Ⅰ型副粘病毒HN基因的序列分析 被引量:1 2013年 本研究对从广西5种不同动物体内分离到的禽Ⅰ型副粘病毒毒株,进行了HN基因的扩增、克隆和序列分析.5个APMV-Ⅰ分离株HN基因的核苷酸序列同源性为94.7%~98.4%,推导氨基酸序列同源性为96.3%~99%,同源性较高;5个毒株的HN基因与国内广东、山东、福建等地的当前流行株同源性较高,但与经典毒株同源性较低;遗传分析表明HN基因相对保守,都源于同一个基因亚群. 潘杰 冯淑萍 孙翔翔 张欣明 李春英 梁丹洁 吴军 曾咏芳 周师师 欧莹 黄胜斌 胡巧云 徐贤坤 熊毅关键词:HN基因 同源性 广西宠物诊疗市场现状和规范化管理探讨 被引量:2 2012年 随着宠物热的兴起,宠物诊疗业蓬勃发展,但该行业依然存在专业人员严重缺乏,行业标准和规范不完善、管理落后等问题,严重阻碍了发展,本文就广西宠物诊疗业存在的问题及应对措施进行了深入的探讨,以期为促进广西宠物诊疗业的良性发展提供借鉴。 徐贤坤 廖朝辉 陆荣宝 徐贤平 杨娜关键词:宠物 诊疗 H1N1猪流感病毒广西分离株HA基因序列分析 被引量:3 2013年 【目的】了解H1N1猪流感病毒广西分离株的分子特征,为广西猪流感疫情监控提供参考依据。【方法】采用RT-PCR对2011年分离获得的H1N1猪流感病毒广西分离株(A/swine/Guangxi/1/2011)的HA基因进行扩增,然后利用DNASTAR分析软件对测序基因片段进行整个阅读框架的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性比对分析,并用MEGA4.0绘制遗传进化树。【结果】广西分离株HA基因长1701bp,编码566个氨基酸,核苷酸序列与经典SIV的同源性为88.0%~99.6%,与季节性H1N1人流感病毒的同源性为76.3%~77.3%,与欧洲类禽SIV分离株的同源性为72.9%~75.4%,与2009甲型H1N1流感病毒的同源性为99.2%~99.6%;从核苷酸遗传进化树可知,广西分离株与类禽H1N1流感病毒和人H1N1流感病毒分离株的亲缘关系较远,而与2009甲型H1N1流感病毒分离株的亲缘关系最近。广西分离毒株HA基因的裂解位点序列为IPSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子生物学特征;共有8个糖基化位点,其中6个位于HAl区,两个位于HA2区;广西分离株HA蛋白RBS位点的氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。【结论】广西分离株(A/swine/Guangxi/1/2011)属于2009甲型H1N1流感病毒。 颜健华 梁丹洁 李春英 徐贤坤 胡巧云 孙翔翔 何奇松 熊毅关键词:猪流感病毒 甲型H1N1流感病毒 HA基因 同源性