国家科技重大专项(2012ZX10004-210-002)
- 作品数：5 被引量：31H指数：4
- 相关作者：严菊英周佳悦张严峻茅海燕缪梓萍更多>>
- 相关机构：浙江省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项浙江省科技厅项目浙江省医药卫生科学研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 浙江省2013年输入性登革热病例病原分子溯源被引量：10
- 2015年
- 目的对2013年浙江省登革热病例进行实验室确诊与病原的分子溯源。方法对患者血清样本同时进行登革热病毒Ig M抗体和核酸检测及病毒分离,阳性分离株采用RT-PCR方法扩增E基因,进行核苷酸序列测定和同源性与进化分析。结果 18例患者发病前均有在境外登革热流行区暴露史,从患者18份血清样本中检测到登革热病毒Ig M抗体阳性15份（83.3%）,核酸阳性8份（44.4%）,分离到登革热1型病毒6株,4型1株。6株登革热1型株之间E基因核苷酸和氨基酸同源性分别为90.9%~99.7%和96.8%~100%,与浙江省2004年登革热1型株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为91.4%~98.5%和96.6%~99.0%;E基因进化树显示,登革热1型株位于GⅠ、GⅣ和GⅤ基因亚型上,登革热4型株位于GⅠ亚型上,2013年7株登革热病毒与浙江省2004-2009年登革热病毒之间亲缘关系较远。结论证实2013年浙江省登革热病例均为输入性,输入国为菲律宾、安哥拉、斯里兰卡和巴西等;登革热1型株基因亚型分别为亚洲型、南太平洋型和美洲/非洲型,登革热4型株为东南亚型;登革热4型病毒为浙江省首次分离。
- 严菊英周佳悦楼秀玉茅海燕张严峻
- 关键词：登革热输入性基因亚型E基因
- 基于DPO引物的多重RT-PCR技术检测常见呼吸道病毒被引量：3
- 2013年
- 目的:应用DPO引物技术建立一种同时检测流感等5种常见呼吸道病毒的多重RT-PCR检测方法。方法:设计针对流感病毒甲、乙型,呼吸道合胞病毒,腺病毒,以及肠道病毒通用的高特异性DPO引物,通过对多重RT-PCR反应体系的优化,建立上述5种病原体的多重RT-PCR检测技术。结果:建立的多重RT-PCR方法可同时扩增甲型流感病毒等5种病原体的基因片段,检测敏感性分别为102copies/ml、103copies/ml、102copies/ml、103copies/ml、102copies/ml,并与副流感等其它呼吸道病毒无交叉反应。结论:本研究建立的多重RT-PCR可以同时准确分型甲、乙型流感病毒,呼吸道合胞病毒,腺病毒和肠道病毒,为呼吸道感染的病原学诊断提供了有效的实验室检测手段。
- 徐昌平卢亦愚冯燕陈寅钟淑玲
- 关键词：呼吸道病毒
- 浙江省仙居县2012-2013年流行性乙型脑炎病毒基因特征和人群血清学研究被引量：6
- 2014年
- 目的：分析浙江省仙居县媒介蚊虫中流行性乙型脑炎（乙脑）病毒（JEV）基因型别和健康人群乙脑抗体水平。方法2012-2013年在浙江省仙居乙脑监测点采集蚊虫，分离JEV，测定其E基因核苷酸序列，并进行同源性与进化分析；对监测点的642名健康人群，在乙脑流行季节前后，分别采集双份血清，共计样本1263份，检测JEV中和抗体。结果采集11650只蚊虫标本，分离25株JEV，同源性分析显示，2012-2013年分离到的JEV与浙江省1982-2010年JEV之间E基因核苷酸同源性为87.8%～99.7%，与乙脑疫苗株SA14-14-2之间核苷酸同源性为87.7%～88.0%。E基因进化分析显示，2012-2013年JEV属于基因Ⅰ型，E基因编码病毒毒力和抗原表位的位点未发生改变。健康人群JEV中和抗体阳性率为31.5%～42.0%，抗体几何平均滴度（GMT）为1∶2.56～1∶3.53，流行前后人群抗体阳性率（χ2≤1.76，P＞0.05）和GMT（u≤0.64，P＞0.5）差异均无统计学意义。结论2012-2013年浙江省仙居县蚊媒中携带基因Ⅰ型JEV，健康人群JEV中和抗体阳性率≤42.0%，流行前后抗体阳性率和中和GMT均无明显变化。
- 严菊英潘金仁张意坚周佳悦倪红年张严峻
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒基因型中和抗体
- 浙江省2008-2012年肠道病毒相关病毒性脑炎病原谱及分子流行病学特征分析被引量：9
- 2013年
- 目的了解2008--2012年浙江省肠道病毒相关病毒性脑炎病原谱及分子流行病学特征。方法从监测点采集疑似病毒性脑炎患者脑脊液和粪便样本利用RD和Hep-2细胞分离病毒，采用肠道病毒标准血清定型，并对分离株VPl基因测序，进行同源性与进化分析。结果从610例患者616份样本中分离到人类肠道病毒（HEV）127株（20．6％），其中柯萨奇病毒（CV）60株，埃可病毒（ECHO：E）67株，病毒血清型分别为CVA9、CVBl、CVB3～5、E3、E4、E6、E9、E14、E25、E30。2008—2012年优势株分别为CVB3、CVB5、E6、E30和E30。各分离株VP1基因序列全长834～918个核苷酸，与相应原型株核苷酸（nt）和氨基酸（aa）的同源性分别为76．7％～85．0％和91．1％。97．9％；浙江分离株型内差异最大为E6，nt和aa差异分别为20．4％和4．8％。基于VPl基因的进化分析结果表明，浙江分离株均位于HEV-B分支上，并显示出一定地域和时间效应；E6血清型内部又分成2小分支。结论2008--2012年浙江省病毒性脑炎的主要病原为HEV-B，涉及12个血清型；不同年份优势流行株不断变化，E30为绝对优势株；浙江E6分离株存在2个亚类流行株。
- 严菊英缪梓萍吕华坤周佳悦陈寅卢亦愚张严峻
- 关键词：病原谱VP1基因
- 浙江省2013年病毒性脑膜脑炎病原学及分子流行病学特征被引量：5
- 2015年
- 目的 分析2013年浙江省监测点病毒性脑膜脑炎病原学及分子流行病学特征。方法 从浙南和浙北监测点医院采集疑似病毒性脑膜脑炎患者脑脊液和/或粪便样本,用荧光定量PCR方法检测样本中人类肠道病毒（HEV）、流行性乙型脑炎病毒（JEV）、腮腺炎病毒（MuV）、单纯疱疹病毒（HSV）和巨细胞病毒（CMV）核酸,采用人横纹肌瘤细胞（RD）和人喉表皮样癌细胞（Hep-2）分离HEV,对HEV阳性分离物或核酸阳性样本扩增VP1基因并测序,然后进行同源性与进化分析。结果 在229例患者共计239份样本中检测到病毒核酸阳性92份（38.5%）,其中HEV阳性87份,MuV、HSV和CMV阳性分别为1、2和2份;87份HEV中柯萨奇病毒（CV）38份和埃可病毒（E）49份;239份样本中分离到56株（23.4%）HEV;在31份HEV核酸阳性但病毒分离阴性的脑脊液样本中,检出最多的为E9（9份）,其次为CVA9（8份）;HEV血清型分别为CVA9、CVB4、CVB5、E6、E7、E9、E11、E14、E16、E25和E30;浙南监测点优势流行株为CVB5,浙北为E6。VP1区进化分析显示,浙江省HEV均为B组EV。结论 2013年浙江省监测点病毒性脑膜脑炎的主要病原为HEV-B,涉及11个血清型,首次在浙江省分离到E7;浙南优势流行株为CVB5,浙北为E6;核酸检出率明显高于病毒分离率,采用常规EV分离法存在漏检E9和CVA9的风险。
- 严菊英缪梓萍吕华坤周佳悦龚黎明茅海燕孙逸张严峻
- 关键词：病毒性脑膜脑炎进化分析
