北京市教委科技计划面上项目(KM200910025006)
- 作品数：1 被引量：0H指数：0
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- 人类基因组isochore边界的保守性研究
- 2011年
- 人类基因组由一些较长的,G+C含量相对均匀的DNA片段组成,也就是我们所说的isochore结构。Isochore结构与许多重要的生物学特征相关,如:基因密度、CpG岛等,关于这些已有系统的研究。我们使用基于Z曲线理论的基因组序列分段算法,在单核苷酸精度的水平上定位了人类基因组56个isochore的边界,共得到79个独立的边界。我们发现在这79个边界中,45.6%的isochore边界在与17个脊椎动物基因组比对时,显示出明显的保守性,比如:某段高保守的序列在isochore边界处转换为一段弱保守或者完全不保守序列。另外isochore边界附近的序列组成高度保守。通过和已被实验证实的复制开关点附近的序列相比较。有理由推断这79个isochore边界都有可能是人类基因组中的复制开关位点,这一点有待实验验证。
- 郑文新郑卫英华琳刘红李林
- 关键词：人类基因组保守性
