黑龙江省自然科学基金(C200725)
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
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- 梅花鹿鹿茸生长顶端组织CaM基因全长cDNA的克隆及表达分析
- 鹿茸在快速生长期细胞增殖分化的速度最快可达每天2 cm,是一种在90天内能迅速成长为骨、血血管、毛发和神经等俱全的综合器官,由此推测鹿茸中可能存在特殊的促进骨和上皮组织快速生长的活性物质。本研究首次从梅花鹿鹿茸生长顶端组...
- 郝丽李和平
- 关键词:鹿茸钙调蛋白CDNA文库实时荧光定量RT-PCR
- 文献传递
- 东北梅花鹿鹿茸尖端组织全长cDNA文库的构建被引量:7
- 2009年
- 为克隆出与鹿茸生长发育相关基因的全长序列,采用SMART技术构建了东北梅花鹿鹿茸尖端组织的全长cDNA文库。用SVTotal RNAIsolation System试剂盒提取总RNA,以逆转录酶PowerScriptTM反转录合成第一链cDNA,然后通过LD-PCR合成并扩增ds cDNA。扩增产物经纯化、SfiⅠ酶切、过CHROMASPIN-400柱去除小片段后,连接到SfiⅠ消化过的pDNR-LIB质粒载体中,最后用电转化法将重组质粒转化到E.coliDH5α内得到原始文库。经测定,构建的原始文库约含有2.56×106个重组子,插入片段多在0.5~2 kb之间,平均插入片段长度约1.1 kb,重组效率接近100%。结果表明,东北梅花鹿鹿茸尖端组织的全长cDNA文库已构建成功。
- 郝丽李和平严厉
- 关键词:东北梅花鹿鹿茸全长CDNA文库SMART技术
- 梅花鹿鹿茸尖端组织ESTs分析被引量:2
- 2011年
- 文章通过对东北梅花鹿(Cervus nippon hortulorum)鹿茸尖端组织cDNA文库随机测序获得了906条高质量ESTs,906条ESTs拼接后代表了701个Unigenes,其中包括重叠群86个,单拷贝615个。Blast分析显示具已知和推测功能的基因580个(82.7%),通过Gene Ontology(GO)分类对获得的580个功能基因进行了包括分子功能、生物过程和细胞组分在内的3个层次的功能注释,并根据BLAST的注释结果及进一步的筛选与分析,共得到39条与鹿茸尖端组织生长发育相关的基因。cDNA文库的构建和ESTs分析填补了鹿科动物在NCBI公共数据库上基因组信息的空白,并为科学的开发和利用梅花鹿资源提供了重要的理论依据。
- 郝丽李和平严历
- 关键词:梅花鹿鹿茸CDNA文库基因本体论
- 鹿茸尖端组织核心蛋白多糖基因全长cDNA的克隆及其表达分析被引量:2
- 2011年
- 为了进一步了解鹿源DCN基因的结构与功能,揭示该基因在鹿茸尖端不同组织层的表达规律,本研究从梅花鹿鹿茸尖端组织cDNA文库中首次克隆具有完整编码区的DCN基因全长cDNA序列,并结合生物信息学方法和实时荧光定量RT-PCR技术对该基因的氨基酸序列结构和表达特征进行分析。结果表明,梅花鹿DCN基因cDNA全长为1 831bp,编码360个氨基酸;其编码蛋白具有N端信号肽,相对分子质量为39.9ku,理论等电点为8.8,其一级结构中亮氨酸所占比例最高(12.5%);梅花鹿与绵羊DCN氨基酸序列的相似性最高(98%)。实时荧光定量RT-PCR分析表明,DCN在间充质层的表达显著高于其他3层组织,提示DCN的抗纤维化活性可能是维持鹿茸间充质层快速生长的重要调节因素。
- 郝丽
- 关键词:鹿茸核心蛋白多糖CDNA文库克隆实时荧光定量RT-PCR
- 梅花鹿茸角组织BSPⅡ基因全长cDNA的克隆及序列特征分析
- 2011年
- 从梅花鹿鹿茸尖端组织全长cDNA文库中克隆了与骨形成和骨改建有关的一种新的骨生长因子BSPⅡ基因的全长cDNA序列,并结合生物信息学方法和实时荧光定量RT-PCR技术对该基因的氨基酸序列及其在鹿茸尖端不同组织层的表达情况进行了分析。结果表明,BSPⅡ基因cDNA全长为1 576bp,编码311个氨基酸。经生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白具有N端信号肽及跨膜区,相对分子质量为34 100,理论等电点为4.05,其一级结构中谷氨酸所占比例最高;二级结构元件主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;同源序列分析表明,梅花鹿与欧洲牛BSPⅡ氨基酸的相似性最高(93%);多重序列比对显示,此蛋白的N-端和68~215、265~308位谷氨酸富集区高度保守;系统进化树显示,在该基因座位上梅花鹿与马的亲缘关系较近,来源于同一个分化支。实时荧光定量RT-PCR分析表明,该基因的表达与鹿茸组织的矿化进程呈显著正相关,推测该基因在鹿茸组织矿化过程中起到了重要的调节作用。
- 郝丽
- 关键词:鹿茸CDNA文库
- 鹿科动物茸角组织Osteopontin基因全长cDNA的克隆及表达分析被引量:1
- 2010年
- 骨桥蛋白(Osteopontin,OPN)是在骨基质的矿化和吸收过程中起重要作用的细胞因子,研究首次从梅花鹿鹿茸尖端组织cDNA文库中成功克隆了OPN基因的全长cDNA序列,并结合生物信息学方法和实时荧光定量RT-PCR技术对该基因的氨基酸序列及表达特征进行分析。结果表明,OPN的cDNA全长为1 406 bp,编码279个氨基酸。经生物信息学分析,该基因为不稳定蛋白,具有N端信号肽,相对分子质量为30.99 ku,理论等电点为4.40,其一级结构中丝氨酸和谷氨酸残基所占比例最高,含有特异的Arg-Gly-Asp序列(RGD)。同源序列比对及系统进化树分析表明,鹿源OPN氨基酸序列不仅与欧洲牛和山羊相似性最高(分别为86%,85%),且在该基因座位上也与二者在亲缘关系最近。实时荧光定量RT-PCR分析表明,OPN基因在鹿茸尖端不同组织层的表达存在差异,前软骨层和软骨层的表达量普遍高于间充质和皮肤层,推测OPN可能通过介导破骨细胞与矿化组织的黏附,从而参与了鹿茸组织的矿化。
- 郝丽
- 关键词:CDNA文库实时荧光定量RT-PCR