“十五”国家科技攻关计划(2001BA505B0513)
- 作品数:14 被引量:135H指数:6
- 相关作者:李思发颉晓勇蔡完其钟金香何学军更多>>
- 相关机构:上海海洋大学中国水产科学研究院南海水产研究所上海水产大学更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于细胞色素b序列的罗非鱼选育群体遗传变异分析被引量:2
- 2014年
- 对吉富品系尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)不同世代选育群体细胞色素b序列进行测定和分析,45个样本经重排比较后获得1 064 bp的同源序列.共检测到161个变异位点,占分析位点数的15.13%.同源序列中多态位点比例随着选育世代数的累进,呈现出降低的趋势,F_0、F_6、F_7、F_8、F_9代分别为14.38%、13.47%、13.38%、10.24%、9.49%.核苷酸多样性指数也呈现出同样的降低趋势,F_0、F_6、F_7、F_8、F_9代分别为0.065 47、0.049 05、0.048 81、0.036 19、0.033 81.本研究结果表明,新吉富罗非鱼仍保持了一定程度的遗传变异水平,新吉富罗非鱼逐步趋于纯化.
- 颉晓勇李思发
- 关键词:罗非鱼选育
- 遗传标记在罗非鱼良种选育研究中的应用与展望
- 2017年
- 综述了在近些年中传统遗传标记罗非鱼良种选育相关研究中的应用情况,探讨了多种分子标记联合分析的必要性,展示了罗非鱼选育群体基于SSR/AFLP分别计算的Nei(1978)相似性系数比率稳定分布于0.942 07~0.963 70之间,而群体间SSR/AFLP遗传距离比率全都远大于1,具有良好的区分度。综合多种因素,推荐SSR作为罗非鱼良种选育群体遗传多样性水平的常规监测手段。并指出基于DNA序列测定与生物信息学技术开发的新型分子标记类型应当作为未来罗非鱼良种选育研究的重点方向。
- 颉晓勇钟金香赵金良
- 关键词:罗非鱼良种选育
- 罗非鱼选育群体遗传结构的SSR与AFLP对比分析
- 2017年
- 对基于SSR和AFLP的罗非鱼选育群体遗传变异开展对比研究,得到5个选育世代群体内多态位点指数SSR/AFLP比率平均为1.683 17,群体内Fst比率平均为1.249 87,群体内基因多样性比率平均为1.676 60。5个选育群体间遗传距离比率平均为3.972 02,遗传相似性比率平均为0.937 92。本研究结果可以为其它类似研究提供参考。
- 钟金香颉晓勇李思发
- 关键词:罗非鱼SSRAFLP
- 尼罗罗非鱼肝cDNA文库的构建被引量:4
- 2005年
- 用Stratagene技术构建了吉富品系尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus, GIFT strain)肝cDNA文库.首先用TRIZOL法提取肝总RNA,经琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度检测,表明总RNA纯度高且完整性良好.然后分离纯化mRNA,合成双链cDNA之后,加EcoRⅠ接头、EcoRⅠ末端磷酸化、XhoⅠ消化,并用葡聚糖凝胶柱层析分级收集cDNA样品,得到300 mg cDNA,符合建库要求.双链cDNA与Uni-ZAP XR Vector连接后,用GigapackⅢGold Packaging Extract进行体外包装得到cDNA文库.测得的文库滴度为1.25×107 pfu/mL,文库噬菌体的滴度符合文库保存和筛选实验的要求.随机挑选20个阳性单克隆噬菌斑进行PCR鉴定后,得出文库的重组率达100%,扩增出的片段主要集中在0.5~2 kb之间,平均插入片段长度约为1.05 kb,结果说明本实验所构建的cDNA文库质量较高.取扩增文库80 μL进行体外切割,约含3.6×106个重组子,切割后phagemid量为2.0×106,切割效率为79.4%.经抽提质粒获得质粒DNA约1.2 mg.
- 何学军李思发
- 关键词:尼罗罗非鱼CDNA文库
- 吉富品系尼罗罗非鱼生长性能的选择响应分析被引量:6
- 2011年
- 在流水池饲养环境里,对吉富品系尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)选育系F6~F9 4代鱼生长性能进行比较。153 d的试验结果表明,F6~F9 4代鱼绝对增重率分别为1.31、1.38、1.45、1.51 g/d。其中,F9比F8提高4.14%,F8比F7提高5.07%,F7比F6提高5.34%,生长速度逐代提高的平均值为4.85%,与2004年研究得到F7比F6提高4.42%的结果相近。F6~F9 4代鱼体重变异系数分别为0.33、0.31、0.29、0.29,呈现出逐代降低的趋势。试验期间,F6~F9 4代鱼的雌鱼特定每天增重率分别为2.69%、2.73%、2.77%、2.78%,F6~F9 4代鱼雄鱼特定每天增重率分别为2.81%、2.85%、2.88%、2.90%,雌、雄鱼间差异显著(P<0.05)。F6~F9 4代鱼的生长性能比较表明,吉富品系尼罗罗非鱼选育系生长性状的选择响应约4.85%。
- 颉晓勇李思发蔡完其钟金香张汉华叶卫陈辉崇
- 关键词:罗非鱼生长性状
- 罗非鱼选育群体Cytb与D-loop序列变异信息对比分析被引量:12
- 2014年
- 对罗非鱼选育群体mtDNA Cytb和D-loop序列遗传变异开展对比研究,根据2种方法得到的多态位点比率平均为0.776 74单倍型多样度比率平均为0.919 45核苷酸多样性指数比率平均为0.769 77平均核苷酸差异数比率均值为0.936 19Cytb序列碱基转换率平均0.042 67Cytb碱基颠换率平均0.004 10D-loop序列碱基转换率平均0.037 25D-loop碱基颠换率平均0.022 84。该结果对比揭示了Cytb和D-loop序列分析中的差异。
- 颉晓勇李思发
- 关键词:罗非鱼CYTBD-LOOP
- 尼罗罗非鱼8个养殖群体遗传差异的微卫星分析被引量:19
- 2009年
- 利用18对微卫星引物对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)国内外8个养殖群体进行遗传差异分析。结果表明:(1)8个群体的平均等位基因数(Na)为3.61~5.11,平均有效等位基因数(Ne)为2.81~3.76,平均观察杂合度(Ho)为0.8611—0.9250,平均期望杂合度(He)为0.6039~0.6977,平均多态信息含量(PIC)为0.5229~0.6373。表明这8个养殖群体具有丰富的遗传变异。(2)在对8个群体的遗传距离和遗传相似度进行估算基础上所作聚类分析表明,8个群体分为两大支,3个“吉富”群体明显聚为一支,其他5个群体聚为一支,反映了这8个群体的亲缘关系。(3)微卫星引物UNH187可以初步作为区分“新吉富”尼罗罗非鱼和其他尼罗罗非鱼群体的特异性标记。
- 李先仁李思发唐首杰蔡完其
- 关键词:尼罗罗非鱼微卫星
- 吉富品系尼罗罗非鱼选育F_6评估被引量:25
- 2003年
- 报道了对吉富品系尼罗罗非鱼进行混合选择所产生的F6代的生长速度和尾鳍条纹的研究结果。在青岛和蚌埠两个试验站,同F5相比,F6的平均日增重率分别提高了2.5%和8.5%,体重变异系数分别降低了14.3%和11.0%;同对照组相比,F6的平均日增重率提高了29.5%,体重变异系数降低了16.4%。同时,在青岛和蚌埠两个试验站,F6尾鳍条纹清晰与整齐的比例从对照组的17.6%分别提高到了28.8%和38.9%。以上表明,吉富品系尼罗罗非鱼经六代选择仍保持一定的选择效应。另外,对一些影响选育效果评价的因子作了分析。
- 赵金李思发何学军白志毅蔡完其邓效伟周培勇丁国强康和平
- 关键词:尼罗罗非鱼吉富品系
- 尼罗罗非鱼育种学研究进展被引量:6
- 2005年
- 赵金良李思发
- 关键词:尼罗罗非鱼育种
- 基于Cytb与D-loop的罗非鱼选育群体遗传结构对比分析被引量:3
- 2014年
- 对罗非鱼选育群体线粒体Cytb与D-loop序列遗传变异开展对比研究,得到5个选育世代群体内遗传距离比率范围0.754 67~0.872 81,平均值0.795 15,D-loop标记所得群体间遗传距离是Cytb方法所得相应遗传距离的约1.25倍。根据2种方法得到的群体间遗传分化指数比率范围为1.051 40~2.914 65,平均值为1.506 55。该研究结果可为其他类似研究提供参考。
- 颉晓勇钟金香李思发
- 关键词:罗非鱼CYTBD-LOOP