质检公益性行业科研专项项目(2007GYJ020)
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 相关作者：肖正康朱水芳张万霞许瑾徐涛更多>>
- 相关机构：湖南农业大学中国检验检疫科学研究院中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：质检公益性行业科研专项项目国家质检总局科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 禾本科psbA-trnH基因的序列分析及其在斑点野生稻鉴定中的应用被引量：6
- 2011年
- 通过对稻属(Oryza L.)及其近缘种等禾本科(Gramineae)植物叶绿体psbA-trnH基因进行扩增和测序,分析其系统进化关系及序列差异,并设计鉴定斑点野生稻(O.punctata)的特异分子标记。序列分析的结果表明,栽培稻材料间psbA-trnH基因序列没有或很少存在碱基差异,野生稻相对变异丰富,其中靠近3′端下游序列碱基变异较为丰富,5′端相对保守。根据斑点野生稻psbA-trnH基因序列的特异位点设计的引物,扩增的目的片段ptBD118长118bp,退火温度在62℃时特异性最佳。在条码基因差异位点分析的基础上,开发的特异分子标记用于物种的快速鉴定,为珍贵物种的口岸鉴定提供了检测方法。
- 许瑾徐涛肖正康朱水芳张万霞
- 关键词：分子标记物种鉴定
- 基于SNP位点快速鉴定药用、斑点野生稻的dCAPS标记体系的建立被引量：3
- 2011年
- 为防止野生稻重要基因资源流失,便于口岸准确快速鉴定,探讨了基于SNP位点建立dCAPS分子标记体系。采用生物信息学软件寻找了药用野生稻和斑点野生稻上7个基因碱基序列上适合设计错配引物的SNP位点,设计合成适当的错配引物进行PCR扩增,选择相应的限制性内切酶进行酶切。在这2种野生稻DNA的matk基因上分别找到1个合适的SNP位点,设计了3对错配引物,PCR后3种相应的限切酶都可以特异性地切开PCR产物,将药用野生稻或斑点野生稻与栽培稻和其它野生稻区分开来。本结果证明了dCAPS分子标记可以在口岸查验上应用。
- 赵红敬许瑾高必达徐涛朱水芳
- 关键词：SNP水稻
