国家自然科学基金(81000746)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 相关机构：新疆医科大学第一附属医院新疆医科大学更多>>
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- 细粒棘球绦虫DNA聚合酶δ小亚基EgPolD2基因的克隆及序列分析被引量：1
- 2012年
- 目的从新疆株细粒棘球绦虫原头蚴中克隆DNA聚合酶δ小亚基EgPolD2,进行序列测定和生物信息学分析。方法设计EgPolD2特异性引物,用RT-PCR方法从细粒棘球绦虫原头蚴cDNA中克隆EgPolD2基因,然后将其克隆至pMD18-T载体,测序并进行生物信息学分析,半定量反转录PCR分析其在细粒棘球绦虫原头蚴和囊泡中的表达情况。结果 EgPolD2基因开放阅读框为1 218bp,编码405个氨基酸,等电点为4.74。NCBI保守功能区分析软件预测EgPolD2蛋白第113～378个氨基酸为MPP_PolD2_C结构域。登陆GenBank进行Blast比对,EgPolD2与曼氏血吸虫SmPolD2基因同源性为32.1%,与线虫和人等其他物种PolD2基因同源性在18.3%～22.8%之间。进化树分析表明EgPolD2与SmPolD2相聚集,与其他物种同源性较低。半定量RT-PCR显示,EgPolD2在细粒棘球绦虫原头蚴和囊泡中均有表达,且表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论本实验成功克隆出细粒棘球绦虫EgPolD2新基因,为进一步研究抗细粒棘球绦虫药物靶标奠定了基础。
- 吕国栋叶建蔚张传山王俊华李亮温浩林仁勇
- 关键词：细粒棘球绦虫
- 细粒棘球绦虫核糖体蛋白S9基因克隆鉴定及其在不同发育阶段表达分析被引量：3
- 2014年
- 目的克隆鉴定细粒棘球绦虫原头蚴核糖体蛋白S9基因，分析其在细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达情况。方法从已构建的cDNA文库挑选基因，克隆EgRPS9基因并对编码产物的理化性质、功能位点、蛋白质的结构和功能域进行预测和分析，通过Real Time-PCR检测RPS9基因在细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达情况。结果通过各种生物数据库对EgRPS9基因进行预测并测序，显示该基因具有完整开放阅读框，大小为564bp，编码188个氨基酸，预测分子质量单位为22．0ku，等电点为10．32。SMART保守功能区域分析发现该基因第107～149个氨基酸为40s亚基即结构域s4超家族。通过多序列比对发现该基因具有较高的保守性，进化树结果表明该基因与曼式血吸虫、日本血吸虫及华氏睾吸虫亲缘关系较近。RealtimePCR检测原头蚴和囊泡RPS9基因相对表达量分别为1．16和1．02，差异无统计学意义（P〉0．05）。结论成功克隆出细粒棘球绦虫40S亚基RPS9新基因，该基因在细粒棘球绦虫不同发育阶段均有表达。
- 肖云峰刘辉吕国栋赵军高惠静李娟王建华
- 关键词：细粒棘球绦虫
