浙江省自然科学基金(Y3110080)
- 作品数：4 被引量：34H指数：3
- 相关作者：林志华董迎辉姚韩韩周小龙朱东丽更多>>
- 相关机构：浙江万里学院上海海洋大学中国海洋大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金宁波市科技创新团队项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测被引量：11
- 2013年
- 为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172～0.744、0.040～0.720、0.187～0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40%和30%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究。
- 齐晓艳董迎辉姚韩韩周小龙林志华
- 关键词：文蛤EST-SSRS多态性
- 利用微卫星标记对文蛤4个壳色花纹品系的遗传分析被引量：17
- 2012年
- 利用9个微卫星位点对文蛤红壳(RS)、黑斑(BS)、细纹(TC)、暗纹(DF)4个壳色花纹品系共120个个体进行遗传差异分析。结果共检测到105个等位基因,每个位点平均观察等位基因数为11.7个,其中WG07位点等位基因数最多(21个),WG11位点最少(7个)。每个品系均具有特异等位基因类型,不同品系中相同微卫星位点的等位基因分布规律不同。4个文蛤品系的观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量变异范围分别为0.110～1.000、0.486～0.867、0.433～0.834,均属高度多态性位点。Hardy-Weinberg平衡的卡方检测发现,大多数位点偏离平衡状态;聚类分析表明,4个品系间存在较明显的遗传差异,TC品系与其它品系的遗传距离最大,DF品系和RS品系的遗传距离相对较小。
- 朱东丽董迎辉林志华姚韩韩
- 关键词：文蛤微卫星标记
- 浙江和广西两种文蛤的分子鉴定及形态特征分析被引量：3
- 2011年
- 以文蛤如东群体(RD)和北海群体(BH)为对照群,利用线粒体COⅠ基因序列分析技术对苍南文蛤(CN)和北海白壳文蛤(BW)进行了分子鉴定。结果表明,苍南文蛤和斧文蛤的碱基组成非常相似,通过文蛤属贝类基因序列同源性比对和分子系统聚类分析发现,苍南文蛤CN1、CN2与斧文蛤的同源性分别达到100.0%、99.2%,在依据遗传距离构建的系统进化树上,2个苍南文蛤也与斧文蛤单独聚为一支,据此将苍南文蛤确定为斧文蛤,此结果将斧文蛤的分布区域向北扩展到了浙江南部沿海,修正了现有文献中记载的仅在我国南海诸省分布的说法;而白壳文蛤与其它6种文蛤的基因序列同源性都不高(79.6%～85.3%),在系统进化树上单独分出一支,明显是独立于这些文蛤之外的新种。斧文蛤、白壳文蛤与文蛤群体COⅠ基因的遗传多样性分析显示,文蛤BH群体的变异位点数、单倍型数和核苷酸多样性指数均最大,斧文蛤其次,而白壳文蛤10条基因序列完全相同,未发生任何核苷酸位点变异,说明其遗传多样性很低。应用方差分析和Tukey多重比较,分析了斧文蛤、白壳文蛤与文蛤群体的形态差异,发现斧文蛤的壳长明显大于壳高,且SMW/TW、IW/TW 2个参数与文蛤、白壳文蛤群体差异显著(P<0.05);而白壳文蛤的壳宽指数大、壳型相对膨胀,SW/SL和SW/SH值均最大,与文蛤和斧文蛤群体差异显著(P<0.05)。本研究结果可为文蛤属贝类种间鉴别、种质资源保护及系统进化研究提供基础资料。
- 董迎辉姚定余林志华姚韩韩陆荣茂
- 关键词：分子鉴定
- 海洋贝类功能基因的研究进展被引量：4
- 2012年
- 本世纪初人类基因组序列图谱的完成从分子水平上揭示了DNA内部结构和遗传机制的本质，极大地推动了生命科学的发展，同时也使人们意识到基因资源的巨大科研和商业价值。在此后的10年间，基因组测序及分析技术取得了一系列重大突破，大量模式生物基因组数据库相继发布，生物信息量呈爆发式增长。
- 周小龙郑云云董迎辉林志华
- 关键词：功能基因海洋贝类人类基因组序列基因组数据库模式生物基因组测序
