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国家自然科学基金(30270368)

作品数:12 被引量:155H指数:6
相关作者:周国华汪维鹏倪坤仪古卓良张晓丹更多>>
相关机构:中国药科大学南京军区联勤部南京大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
相关领域:医药卫生生物学理学更多>>

文献类型

  • 12篇中文期刊文章

领域

  • 6篇医药卫生
  • 4篇生物学
  • 2篇理学

主题

  • 5篇核苷酸
  • 4篇单核
  • 4篇单核苷酸
  • 4篇单核苷酸多态
  • 4篇单核苷酸多态...
  • 4篇多态
  • 4篇多态性
  • 4篇基因
  • 4篇核苷
  • 4篇SNP
  • 3篇等位
  • 3篇等位基因
  • 3篇电泳
  • 3篇微流控
  • 3篇微流控芯片
  • 3篇微流控芯片电...
  • 3篇位点
  • 3篇CYP2D6
  • 2篇电泳法
  • 2篇药物

机构

  • 5篇中国药科大学
  • 3篇南京大学
  • 3篇南京军区联勤...
  • 1篇江苏省人民医...
  • 1篇苏州大学
  • 1篇无锡市妇幼保...

作者

  • 9篇周国华
  • 5篇倪坤仪
  • 5篇汪维鹏
  • 2篇张晓丹
  • 2篇伍小勇
  • 2篇古卓良
  • 1篇丁海霞
  • 1篇卜莹
  • 1篇黄乐群
  • 1篇姚兵
  • 1篇孙晓如
  • 1篇崔英霞
  • 1篇项静英
  • 1篇丁一冰
  • 1篇丁新生
  • 1篇王枫
  • 1篇芦洪涌

传媒

  • 3篇遗传
  • 2篇分析化学
  • 2篇中华医学遗传...
  • 2篇现代生物医学...
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇中国药学杂志
  • 1篇中国生物化学...

年份

  • 2篇2009
  • 2篇2008
  • 4篇2006
  • 1篇2005
  • 3篇2004
12 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
单核苷酸多态性(SNP)与个体化用药被引量:4
2004年
医学和药学研究目的是预防和治疗疾病,提高生活质量,并能对疾病进行早期诊断.随着人类基因组计划的完成,人们正盼望着21世纪医药科学有一个飞跃性的发展[1].事实上,在近10多年间,基因组科学和分子生物学已经使医学和药学向前迈了一大步.人类的平均寿命也正在延长.可是全世界每年依然有几十万人由于用药不当或药物不良反应而死亡.同时,全世界每年也有许多效果不错的药物,因不良反应太大而在药物研究中被淘汰,从而使药物研究的成本增加、周期延长.
周国华
关键词:单核苷酸多态性SNP个体化用药药物
应用基于适配器连接介导的等位基因特异性扩增法检测LRRK2基因的单核苷酸多态性被引量:2
2009年
目的:应用基于适配器连接介导的等位基因特异性扩增法(Adapter Ligation-mediated Allele-specific Amplification,简称ALM-ASA)技术,检测与帕金森病(PD)发病相关的LRRK2基因中的4个SNP位点(6055G>A,7153G>A,4321C>T和2264C>T),探讨该法用于筛查帕金森病相关SNP位点的可行性,研究多个SNP位点同时检测的准确性和可靠性。方法:运用ALM-ASA法原理,改进使用多重PCR法代替单一预扩增法,使用4对引物在单管中预扩增含所待测SNP位点的四段片段,通过酶切、酶连和PCR特异性扩增检测判断SNP的类型。经PCR体外定点突变实验制备的相应位点的突变阳性片段,检验方法的准确性和可靠性。结果:采用该法成功测定了20名PD病人和20名健康中国人的LRRK2基因中最受关注的4个SNP位点的多态性。并随机对其中10分样本的检测结果以测序法检测进行验证,结果完全一致。结论:ALM-ASA法极大提高了PCR反应的特异性,是一种准确、可靠,且费用低廉的SNP筛查方法,可推广应用于临床和实验室进行与PD有关的单核苷酸多态性的筛查检测。
孙晓如卜莹丁新生汪维鹏丁海霞丁一冰邓黎丽王枫周国华黄乐群
关键词:单核苷酸多态多重PCR
微流控芯片电泳-多重聚合酶链反应法同时测定多个单碱基多态性位点被引量:2
2006年
以微流控芯片电泳为检测平台,建立了多重PCR扩增法同时测定多个单碱基多态性(SNP)位点的方法。先通过PCR扩增得一段含所有待测SNP位点的长片段;用限制性内切酶消化成短片段,再将酶切反应产物与脱氧核糖核酸适配器(DNAadapter)相连;以连接产物为模板,分成两管,分别用n条等位基因特异性引物和一条通用引物进行n重PCR扩增;最后用微流控芯片电泳法分离PCR扩增产物,根据两管扩增产物的芯片电泳图谱中扩增片段的大小判断SNP的类型。以细胞色素P4502D6(CYP2D6)基因中的5个SNP位点(100C>T、1661G>C、1758G>T、2470T>C和2850C>T)为检测对象,考察了各等位基因特异性引物之间的相互影响和扩增反应的特异性,采用微流控芯片电泳法成功测定了20名健康中国人的CYP2D6基因中5个SNP位点的基因多态性,与聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)测定结果完全一致。
汪维鹏倪坤仪周国华
关键词:微流控芯片电泳多重聚合酶链反应药物代谢酶
四引物PCR扩增反应的单管SNP快速测定法被引量:35
2004年
建立一种在单管中进行单核苷酸多型性 (SNP)快速测定的高效廉价方法 .以人ABCA1基因中的I82 3M为研究对象 ,设计 4种引物进行PCR扩增 ,其中两种引物用于扩增一段含有SNP位点的DNA片段 ,另两种引物为SNP位点特异性引物 ,4种引物在单管中同时进行PCR扩增反应 ,根据延伸产物的长度确定SNP的类型 .为提高SNP测定的特异性 ,在特异性引物的 3′端倒数第 3个碱基引入了一个人为错配碱基 ,使引物的错误延伸率显著降低 ,大大提高了SNP分析的准确性 .实验结果表明 ,所建立的方法简单 ,操作简便 ,可在单管中完成SNP的测定反应 .
卜莹古卓良张晓丹周国华
关键词:人类基因组核苷酸序列聚合酶链反应
全血直接多重PCR法快速检测Y染色体微缺失被引量:6
2008年
目的以全血为起始模板直接进行PCR多重扩增,建立一种快速、简便的Y染色体微缺失检测方法。方法用作者自行研制的“HpH-Buffer”,以不经基因组DNA提取的抗凝全血为模板直接进行多重PCR扩增。分别在5管中检测无精症因子(azoospermia factor,AZF)区域的a区、b区和c区共12个序列标签位点(sequence tagged sites,SIS)。为保证方法有效性,加做Y染色体性别决定区(sex-determining region Y,SRY)和X/Y连锁锌指蛋白基因(X-linked or Y-linked zinc fingergene,ZFX/Y)作为内控。同时,为考察方法的准确性,对每例血液样本提取基因组DNA平行实验。结果共检测了156例男性血液样本,每组实验均加做阳性对照(正常已生育男性样本)和阴性对照(正常女性样本),以保证实验有效性。结果表明,156例样本中有144例无缺失,AZFa区缺失1例,AZFb区缺失1例,AZFc区缺失7例,AZFb和AZFc区缺失1例,AZFa、AZFb和AZFc区全缺失2例。以全血为模板和以基因组DNA为模板进行扩增所得到的实验结果完全一致。结论所建立的方法省略了DNA提取这一繁琐的步骤,减少了PCR实验过程中可能出现的污染,缩短了操作时间,节约了实验成本。可在2小时内完成所有检测过程,有效地提高了临床检测效率。“HpH-Buffer”的试剂成本很低,全部检测成本与普通PCR扩增基本相同。
卜莹黄欢武海萍张晓丹周国华崔英霞姚兵芦洪涌项静英
关键词:Y染色体微缺失无精症因子多重聚合酶链反应
利用胎儿核酸进行产前诊断的研究进展
2008年
本文分别介绍了孕妇血浆中胎儿DNA和RNA的特性以及近年采利用胎儿DNA和胎儿RNA进行产前基因诊断技术的研究进展,并且着重介绍了其中三种产前基因诊断技术:多重连结探针扩增法(MLPA)、单碱基延伸-质谱分析(SABER-MS)和SNP-RNA等位基因比率法。综述了利用胎儿核酸进行产前诊断技术在临床上的应用。
伍小勇倪坤仪周国华
关键词:产前诊断
人工修饰双等位基因特异性引物扩增法测定人ABC1基因突变点I823M被引量:11
2004年
目的 建立一种简单、快速测定三磷酸腺苷结合盒转运子 1(ATP binding- cassettetransporter 1,ABC1)基因突变点 I82 3M的方法。方法 设计两种等位基因特异性引物 ,分别与 DNA双链的两条单链互补 ,其 3′端正好与单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism ,SNP)位点重合 ,由引物的 3′端控制着引物的延伸反应 ,根据延伸反应的长度确定等位基因的类型 ,并通过在引物的 3′端区域引入一个人为不匹配碱基来提高延伸反应的特异性。结果 人为引入错配碱能提高单核苷酸多态性分析的特异性 ;通过优化实验条件 ,用本室建立的双等位基因特异性扩增法 ,可测定人 ABCA1基因突变点 I82 3M的不同 SNP类型。结论 人工修饰双等位基因特异性引物扩增法可用于人基因组中单核苷酸多态性的快速测定 ,不需使用复杂仪器设备 ,便于推广使用。
伍小勇张晓丹古卓良周国华
连接反应介导的等位基因特异性扩增-微流控芯片电泳法同时检测多个SNP位点被引量:3
2006年
To detect multiplex single nucleotide polymorphisms(SNPs)simultaneously,a new method was established by combining ALM-ASA with microfabricated CE-chip.Taking the CYP2D6 gene as an example,six SNPs,100C>T(P34S),1707T>del(frameshift),1758G>T(stop codon),2470T>C,2549A>del(frameshift)and 2613AGA>del(K281del),were typed by four steps consisting of preamplification,digestion and ligation,allele-specific amplification,and amplicon separation by chip-CE.The genotyping results of 20 different genome samples by 6-plexed ALM-ASA were completely consistent with those obtained by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis(PCR-RFLP),indicating that the multiplex approach established in this study was accurate and inexpensive.As the small reagent consumption by CE-chip device,a low cost for SNP typing was achieved together with the multiplex PCR technology proposed in this report.Neither modification of microchip channels nor clean-up process of PCR products was required;this greatly shortens the whole time for SNP typing.
汪维鹏倪坤仪周国华
关键词:微流控芯片电泳SNPCYP2D6
一种基于适配器连接介导的等位基因特异性扩增法测定多重SNP被引量:7
2006年
建立了一种基于DNA适配器连接介导的等位基因特异性扩增法测定多重SNP。以CYP2D6基因中的5个SNP位点(100C>T,1661G>C,1758G>T,2470T>C和2850C>T)为例,用PCR法预扩增得一段含所有待测SNP位点的长片段,然后用限制性内切酶将其消化成短片段,在连接酶的作用下与设计的DNA适配器(adapter)相连;该适配器的一端与限制性内切酶降解后留下的粘性末端相同,另一端带有一段公共序列。在两管中加入与适配器连接的片段作为PCR扩增模板,并分别加入SNP特异性引物和一种适配器特异性的通用引物进行PCR扩增,最后用凝胶电泳法分离PCR扩增产物。由于每管与SNP的两种特异性引物中的一种对应,可以根据每管中扩增片段的大小判断SNP的类型。通过凝胶电泳法可以一次分离与5种SNP类型相对应的引物特异性延伸反应产物;采用该法成功测定了20名健康中国人的CYP2D6基因中5个SNP位点的基因多态性,与限制性片段长度多态性法(RFLP)测定结果完全一致。该方法采用n+1种引物(n种SNP特异性引物和一种通用引物)进行n重PCR反应,极大提高了PCR反应的特异性,结果准确,可用于同时测定多个SNP位点。
汪维鹏倪坤仪周国华
关键词:SNP多重PCRCYP2D6
五引物单管聚合酶链反应(PCR)扩增法快速测定人CYP2D610等位基因的类型被引量:8
2005年
以人CYP2D6 10等位基因位点为研究对象,建立了一种由5条引物同时PCR扩增在单管中进行等 位基因快速检测的新方法。该方法在等位基因特异性扩增法的基础上,在内引物3′端引入了一个人工错配 碱基并在5′端附加一段“尾巴”作为引物的锚定部分,使扩增反应的特异性得到了提高。本实验所建立的方 法可在单管中同时完成SNP3种可能等位基因类型的快速检测。实测了47份样品的CYP2D6 10等位基因 的类型,并随机对其中20份样品的测定结果用RFLP法进行了验证,结果完全一致。结果表明本法简便、快 速,结果准确。
卜莹张晓丹马涛周国华
关键词:等位基因CYP2D6扩增引物
共2页<12>
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