国家自然科学基金(90412018)
- 作品数:3 被引量:2H指数:1
- 相关作者:刘青焱夏永静刘湘军蒋博张颜更多>>
- 相关机构:清华大学北京林业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金清华-裕元医学科学研究基金教育部跨世纪优秀人才培养计划更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 大规模单核苷酸多态性位点验证的集群解决方案
- 2007年
- 随着高通量的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测技术的发展,世界各地的实验研究积累了大量的SNP数据,但是目前尚无一个全面综合的SNP数据库。SNP在致病基因发现、司法鉴定、个体化医疗等方面的应用得到了极大的关注和发展,因此有必要建立一个整合的人类SNP数据库。在整合中需要进行大规模的单核苷酸多态性位点的验证,该工作通过一个自主开发的、健壮的、用户友好的生物信息学集群计算工具包EasyC luster在集群系统上得以高效完成。
- 刘青焱庄海滨夏永静刘湘军
- 关键词:单核苷酸多态性集群计算OSCARPBS
- 一种文本数据挖掘与可视化的新方法被引量:2
- 2008年
- 传统搜索引擎的搜索结果采用的是以一维列表的形式展现,随着文献数据的急剧增多,用户对于搜索结果的辨识和分析速度也在急剧下降。为了弥补传统工具的这一不足,本文开发了"语义图"(semantic map,SMAP),此工具对文献数据进行数据挖掘和可视化,包括关联匹配和聚类,将搜索结果以二维矩阵图的形式展示出来,方便用户理解数据之间的内部联系,并帮助用户迅速从整体上把握搜索结果。最后以蛋白质组学文献分析过程为例具体展示了此工具的应用。
- 宋驰刘青焱张颜蒋博徐振愚夏永静刘湘军
- 关键词:可视化语义图