中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(SJB1304)
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 相关作者：师勇强赵丽红冯自力李志芳朱荷琴更多>>
- 相关机构：中国农业科学院棉花研究所西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 黑白轮枝菌基因组中微卫星的频率和分布被引量：1
- 2013年
- 为了明确重要植物病原真菌黑白轮枝菌基因组中的微卫星(SSR)分布情况,利用软件SciRoKo从已测序的VaMs102菌株基因组(32.8 Mb)中,成功搜索得到4224个SSR。结果显示,三碱基重复微卫星的数量最多,为1481个,占SSR总数的35.1%;其次是二碱基、六碱基、四碱基和五碱基;单碱基重复的微卫星数量最少,为308个,仅占总数的7.3%。不同重复单元的微卫星在黑白轮枝菌基因组中的分布是非随机的,具有明显的偏好性。单碱基、二碱基、四碱基和五碱基偏爱出现于非编码区,尤其是基因间区。三碱基和六碱基重复微卫星较为集中分布在外显子区,并且重复次数变化丰富,推断黑白轮枝菌编码区的SSR可能会通过调节自身的重复次数来适应新环境。
- 李志芳冯自力赵丽红师勇强李彩红王玲飞刘义杰朱荷琴
- 关键词：基因组简单重复序列
- 农杆菌介导的基因敲除技术在丝状真菌基因功能研究中的应用被引量：12
- 2013年
- 近年来不少丝状真菌全基因组测序已经完成或正在进行,基因功能研究已成为真菌研究的一个热点。利用反向遗传学的方法敲除基因是研究丝状真菌功能基因的常用方法之一,基因敲除是通过外源DNA与染色体DNA之间的同源重组,可以敲除整个基因,或者将一个基因替换成该基因的等位基因,或者用一个调控启动子替换一个基因正常的启动子,从而精细地定点修饰和改造基因DNA片段的技术。本文简述了利用农杆菌介导的遗传转化方法(ATMT)进行基因敲除的技术在丝状真菌基因组功能研究中的应用。
- 李彩红李志芳冯自力赵丽红师勇强王玲飞刘义杰朱荷琴
- 关键词：基因敲除同源重组丝状真菌
- 棉花黄萎病菌低致病力突变体的表型分析及致病相关基因克隆被引量：2
- 2015年
- 本研究通过对菌核型强致病力菌株Vd080产生的800个T-DNA插入突变体进行致病力测定,筛选得到31株致病力极显著降低的突变体,并对其进行了生物学性状分析。分子验证结果表明,这些低致病力突变体均为阳性,且有25株的T-DNA为单拷贝插入。与野生型菌株Vd080相比,这25株低致病力突变体菌落形态变异丰富,除了8株与野生型菌株形态一致的菌核型突变体外,还有3株黄色菌丝型,2株白色菌丝型和12株中间型突变体。此外,多数突变体的生长速率、产孢量和粗毒素产量都发生了显著变化,且各生理指标之间并无明显相关性。借助TAIL-PCR技术和Vd Ls.17的基因组数据库,进一步获得了这25株单拷贝插入低致病力突变体T-DNA的侧翼序列,并从Vd080中成功克隆得到了影响黄萎病菌致病力的相关基因。
- 刘义杰李志芳冯自力赵丽红周芳芳师勇强杨家荣朱荷琴
- 关键词：大丽轮枝菌基因克隆
