教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-07-0287)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
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- 相关机构：华东理工大学更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 无胶筛分毛细管电泳对SNP分型的初步研究被引量：1
- 2008年
- 建立了非涂层无胶筛分毛细管电泳对多个SNP位点快速分型的方法。采用长度为20 bp和40 bp的DNA片段为实验对象,对筛分介质的种类及其质量浓度、电泳缓冲溶液的浓度及其pH值、分离电压进行了优化,确定最合适的分离条件如下:6%PDMA为筛分介质,缓冲溶液TAPS浓度为100 mmol.L-1、pH值为8,分离电压为15 kV。并在此条件下成功地对3个SNP位点进行分型。结果表明,以PDMA为筛分介质的非涂层无胶筛分毛细管电泳方法用于SNP分型是可行的,而且具有特异性强、灵敏度高、重复性好、操作简单快速、结果直观等优点。
- 王先飞尹斌成叶邦策
- 关键词：无胶筛分毛细管电泳SNP分型
- 阿维链霉菌基因表达谱芯片的初步研究
- 2009年
- 用表达谱芯片分析阿维链霉菌在发酵过程中转录组表达情况,优化微生物转录组分析条件。提取RNA,进行荧光探针的合成,杂交,扫描对数据进行分析。RNA的提取要注意破壁方法的选择以及菌体量;合成cDNA时,RNA的加入量一般在10μg左右;当cDNA用逆转录的方法得到时,用专门的纯化试剂盒要比传统的异丙醇纯化效果好;杂交温度对于合成基因来说一般在42℃,对于比较长的PCR产物来说,温度相比较要高点;对于杂交时间来说,杂交12h之上,效果要明显比6h的好,所以杂交时间一般选择12h之上。对芯片上的197个合成基因进行分析:大约有60个基因进行了表达,其中包括18个双组分或激酶基因;10个糖酵解或者三羧酸循环途径基因;3个阿维基因簇;7个调节基因;5个细胞分化或孢子形;4个运输或固定基因;两个伴侣分子;5个RNA聚合酶σ因子;3个转录基因;两个脂肪酸合成基因;1个RNA聚合酶β亚基。
- 许迎霞叶邦策
- 关键词：基因芯片探针杂交信号
