国家自然科学基金(31370334)
- 作品数:2 被引量:5H指数:2
- 相关作者:李晶李勇孔稳稳更多>>
- 相关机构:东北农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- flg22诱导的拟南芥转录组分析及芥子油苷代谢途径的变化被引量:2
- 2014年
- flg22是细菌鞭毛蛋白N端的一段保守性极高的区域,能够诱导植物天然的免疫反应,为全面了解植物在受到细菌性病原菌侵害后的系统响应,利用Illumina Hiseq2000对flg22处理和未处理的拟南芥幼苗进行转录组测序。对两组数据进行差异表达分析,共获得1 200个差异表达基因,包括290个下调基因和910个上调基因。对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG pathway富集分析,结果显示,flg22处理后,拟南芥在能量代谢、氨基酸代谢及次生代谢产物的生物合成等方面产生了巨大变化。芥子油苷是一类在植物防御病原菌的天然免疫反应中起重要作用的次生代谢产物,因此对芥子油苷代谢途径的变化进行了深入分析。根据测序结果,Flg22处理后吲哚族芥子油苷合成途径的基因表达水平显著提高,而脂肪族芥子油苷代谢途径几乎没有变化,进一步对吲哚族芥子油苷合成途径的关键酶基因进行Real Time RT-PCR的分析,验证了测序结果的正确性,证明了吲哚族芥子油苷在植物抗病防御反应中的重要作用。这为深入理解病原菌诱导的植物防御性反应及吲哚族芥子油苷的抗病机制提供了大量参考数据。
- 于欣鑫高晋君李勇李晶
- 关键词:拟南芥高通量测序天然免疫反应芥子油苷
- 西兰花CYP83A1基因的克隆及序列分析被引量:3
- 2015年
- 为深入研究西兰花4-甲基亚磺酰丁基芥子油苷的合成代谢途径,对关键合成酶基因CYP83A1进行了克隆与生物信息学分析。根据前期西兰花转录组测序工作中获得的序列数据,同时参照Gen Bank数据库中拟南芥、小白菜和油菜等7种植物的CYP83A1基因CDS序列与西兰花进行比对,确定西兰花CYP83A1基因(Bo CYP83A1)的CDS序列。采用RT-PCR技术对其进行了克隆,获得Bo CYP83A1基因的CDS区序列,其全长为1 509 bp,编码502个氨基酸。预测该蛋白质的分子量为57.47 k D,理论等电点为7.1,包含2个跨膜结构域,且整个序列中不含信号肽,具有一个典型的P450结构域。氨基酸同源性分析表明,西兰花与油菜、大白菜的CYP83A1的相似性较高,均为98%。首次获得Bo CYP83A1的CDS序列,其登录号为KM111290。
- 曹阳理惠李勇孔稳稳李晶
- 关键词:西兰花芥子油苷抗癌活性
- 拟南芥PYK10与BGLU28基因功能鉴定及表达模式分析
- 芥子油苷是一种存在于十字花科植物中的重要次生代谢产物,广泛存在于模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芸薹属蔬菜中。芥子油苷本身通常不具有显著的生物活性,在遭受外界生物胁迫,如动物的啃噬或病原菌的侵...
- 盛宇欣
- 关键词:代谢过程基因表达
- 文献传递