国家自然科学基金(61070130)
- 作品数：5 被引量：10H指数：2
- 相关作者：陈月辉林云光闫宝强乔善平刘海红更多>>
- 相关机构：济南大学山东师范大学青岛理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 基于前馈人工神经网络的miRNA预测
- 2012年
- microRNA(miRNA)是一类长度约为20～24个核苷酸保守的非编码小分子RNA,如何能准确预测miRNA一直是生物信息学的难点之一。文中提出一种新的预测方法—粒子群优化的前馈人工神经网络预测miRNA,从331(阴性数据168,阳性数据163)个样本组成的数据集中提取每个样本的36维特征向量训练人工神经网络模型,并用训练好的模型对不同的测试集进行测试,结果表明这种方法平均预测精度达到91.0%,高于传统的SVM预测方法,从而为miRNA预测提供了一个新的研究方向。
- 林云光陈月辉邵光亭
- 关键词：MICRORNA粒子群优化算法
- 基于组合特征集成的蛋白质相互作用位点预测
- 2012年
- 运用RBF神经网络预测蛋白质相互作用位点。首先提取序列谱、保守权重、熵值、复合物可及表面积和序列变化率等一系列蛋白质相互作用位点的关键特征。然后应用RBF神经网络以及它们的集成来对这些样本集进行训练与测试。使用10次交叉验证进行训练与测试,创建了4组具有对比性的蛋白质相互作用特征组合。实验中每加入一种新的特征时正确预测率都会相应的提高,特别是加入可及表面积和序列变化率特征时正确率提高幅度更大,表明利用多特征组合,结合RBF神经网络算法进行预测蛋白质相互作用位点的方法是正确有效的。
- 崔娟陈月辉
- 关键词：神经网络
- 基于Lempel-Ziv复杂度和经验模态分解的癫痫脑电信号的检测方法被引量：3
- 2015年
- 癫痫脑电信号是非平稳、非线性的,根据此特性我们提出一个基于Lempel-Ziv复杂度和经验模态分解(EMD)的癫痫脑电信号的检测方法,首先将癫痫脑电信号用EMD分解,再分别计算每阶固有模态函数(IMF)的复杂度,最后将得到的复杂度作为特征进行检测.实验用波恩数据库来评估提出的方法.结果表明,该方法检测准确率可达到95.25%,具有准确率高、适应性强等优点.
- 夏德玲孟庆芳牛贺功魏英达刘海红
- 关键词：经验模态分解准确率
- 基于集成学习的神经网络对小RNA的预测被引量：2
- 2013年
- 通过计算智能的方法,即粒子群算法优化的前向人工神经网络和集成神经网络来预测小RNA。从小RNA前体序列中提取36维特征用于训练神经网络模型,利用训练好的模型分别对阳性和阴性小RNA数据集进行测试,预测平均精度达到90%以上,并且通过集成神经网络的方法取得了更高的精度。实验结果表明,利用集成神经网络建模进行小RNA的预测是一条行之有效的途径。
- 林云光陈月辉
- 关键词：小RNA人工神经网络粒子群优化算法
- 蛋白质亚细胞定位预测研究综述被引量：5
- 2014年
- 蛋白质亚细胞定位预测对于确定蛋白质功能、揭示分子交互机理、理解复杂生理过程和设计药物靶标等方面都有很大的促进作用。随着后基因组时代中蛋白质序列数据的指数增长,研究基于机器学习的计算性蛋白质亚细胞定位预测方法变得越来越重要。为了能够把握该问题的研究状况,从数据集构建、蛋白质特征提取与表示、预测算法设计、算法测试和Web服务的建立等五个方面对蛋白质亚细胞定位预测的研究进行了综述。指出了目前该研究领域需要解决的核心问题及难点问题,分析了当前研究中出现的一些新情况,并对将来的研究方向和研究重点进行了展望。
- 乔善平闫宝强
- 关键词：蛋白质亚细胞定位预测WEB服务器
- Prediction of miRNA based on flexible neural tree
- microRNA(miRNA)is a class of 20-24 nucleotides conserved non-coding small RNA.How to predict miRNA accurately ...
- Yunguang Li School of Information science and Engineering
- 关键词：MIRNA
