国家自然科学基金(30771354) 作品数:7 被引量:15 H指数:2 相关作者: 董金皋 董志平 瓮巧云 李志勇 马继芳 更多>> 相关机构: 河北省农林科学院 河北农业大学 河北北方学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 河北省自然科学基金 河北省杰出青年科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
谷子弯孢病菌Clgα-1基因克隆及特征分析 被引量:2 2011年 谷子弯孢病菌(Cochliobolus lunatus)引起的谷子叶斑病是谷子生产上的重要病害之一,常造成严重经济损失。本研究利用候选基因法和RACE技术克隆了谷子弯孢病菌中的1个Gα基因,命名为Clgα-1,在GeneBank登陆号为HQ699081。Clgα-1基因开放阅读框为1 062 bp,编码353个氨基酸多肽,该开放阅读框被3个大小分别为57,49,59 bp的内含子隔开。聚类分析结果表明,谷子弯孢病菌Clgα-1基因与其他植物病原真菌Gα基因的同源性很高,Southern杂交结果表明该基因以单拷贝形式存在。Clgα-1基因具有其他病原真菌Gα基因具有的保守结构,如在氮端有豆蔻酰化位点,碳端具有ADP核糖基化位点。谷子弯孢病菌Clgα-1基因的克隆,为进一步研究Clgα-1基因在该菌致病过程中的功能奠定基础。 李志勇 谢夏青 董金皋 董志平关键词:异三聚体G蛋白 RACE 谷子弯孢菌海藻糖酶基因(ClTRE)及其启动子的克隆和序列分析 被引量:2 2011年 海藻糖代谢调控真菌生长、发育及致病性,为了进一步研究海藻糖代谢在谷子弯孢病菌中的功能,对海藻糖酶基因及其启动子进行了克隆。根据植物病原真菌海藻糖酶基因的保守序列设计简并引物,扩增得到海藻糖酶基因同源序列。通过RACE技术,首次在谷子弯孢病菌中克隆得到了海藻糖酶基因(ClTRE)全长cDNA序列。序列分析表明,该基因最大开放阅读框为2 037 bp,编码679个氨基酸;二级结构预测表明,该蛋白含约40.48%的α螺旋,12.99%的延伸串,6.5%的β转角,40.03%的不规则卷曲;蛋白保守结构域分析发现其含有海藻糖酶特有的保守位点,与其他植物病原真菌中海藻糖酶基因有51%-86%同源性;利用SignalP3.0软件预测谷子弯孢海藻糖酶蛋白具有信号肽。通过染色体步移技术克隆得到其上游启动子序列,利用TFSEARCH软件分析含有多个与逆境胁迫相关的顺式作用元件,初步推测该基因与逆境胁迫相关。谷子弯孢病菌ClTRE基因及其启动子的克隆,为进一步研究该基因在病菌致病中作用以及以该基因为靶位点的化学防控奠定基础。 谢夏青 李志勇 马继芳 刘磊 董志平 董金皋关键词:海藻糖酶 染色体步移 生物信息学 谷子NBS类型抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:1 2012年 以谷子(Setaria italica Beauv.)抗锈病植株十里香和感锈病植株豫谷1号为材料,利用抗病基因同源序列(RGA)技术克隆谷子核苷酸结合位点(NBS)类型RGA并进行分析。共获得了3个RGA,分别命名为RUS1-1、RUS1-2、RUS1-3(Resistance against Uromyces setariae-italicae,RUS),它们编码的蛋白质均含有NBS类型抗病基因编码蛋白的共有特征结构域P-loop和Kinase2α。BLASTX分析结果表明,3个RGA的编码蛋白与水稻中含有NB-ARC信号传导结构域的蛋白质、NBS-LRR类型抗病基因等的编码蛋白同源性为47%~66%。聚类分析结果表明,3个RGA属于NBS-LRR类型抗病基因,且与番茄NBS-LRR类型抗病基因I2聚为一类。 瓮巧云 宋晋辉 张爱香谷子抗锈病基因AFLP分子标记的筛选 2012年 [目的]筛选与谷子抗锈病相关的AFLP分子标记。[方法]以谷子抗锈病十里香和感锈病豫谷1号及其F2代分离群体为材料,利用AFLP技术筛选谷子抗锈病基因分子标记。[结果]在192对引物组合中,初步筛选到能够揭示抗感材料之间多态性的10对引物组合,检出率为5%。对10个抗病材料中特异条带进行回收及分析,比对结果表明,2个特异条带与玉米W22 pol基因和水稻的丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶基因同源性分别为86%和92%;其他特异条带未发现同源的序列,可能为新基因。[结论]该研究为分子辅助育种及谷子抗锈基因克隆奠定了基础。 瓮巧云 宋晋辉 张爱香关键词:谷子 锈病 AFLP分子标记 谷子基因表达定量PCR分析中内参基因的选择 谷子锈病是谷子生产上的重要流行性病害,发生严重时,不少地块植株倒伏,颗粒无收。开展谷子与锈菌互作关系的机理研究,揭示寄主植物的抗/感病机理,对于谷子抗锈性品种的合理利用和谷锈病的可持续控制具有重要的理论和实际意义。目前在... 朱彦彬 李志勇 白辉 董立 董志平 董金皋关键词:谷子 锈菌 内参 实时荧光定量PCR 谷子抗锈基因分子标记研究 谷子锈病是由谷子锈菌(Uromyces setariae-italicae Yosh.)引起的气传性病害,遍及全国各谷子产区,严重时可使谷子减产30%以上,甚至绝收。 赵立强 潘文佳 瓮巧云 马继芳 董志平 董金皋文献传递 一个谷子新抗锈基因的AFLP标记 被引量:9 2010年 【目的】研究谷子抗源的抗锈遗传规律,寻找和定位与谷子抗锈基因连锁的分子标记,为谷子抗锈病基因的定位、克隆和抗病育种等研究奠定基础。【方法】用谷子锈菌单胞菌系93-5接种十里香和豫谷1号及杂交后代F1、F2进行抗锈鉴定,并根据鉴定结果构建抗、感基因池;利用AFLP技术筛选128对EcoRⅠ/MseⅠ引物组合,从中寻找和定位与谷子抗锈基因连锁的分子标记;根据AFLP分析结果进行抗锈基因连锁分析并进行SCAR标记转化。【结果】根据十里香×豫谷1号杂交后代F2群体(131株)抗感谷锈病分离比例,确定十里香抗锈性由显性单基因控制。筛选获得3个与谷子抗锈基因Rusi1(暂命名)连锁的AFLP分子标记,经计算标记与该抗锈基因的遗传距离分别为7.4、9.2和27.4cM。将3个标记片段回收、克隆和测序,成功地将AFLP标记E+CTT/M+TAC-256转化为SCAR标记。初步构建了谷子抗锈基因Rusi1的遗传连锁图谱。【结论】谷子十里香抗锈性由显性单基因控制,Rusi1是一个新发现的谷子抗锈基因。 赵立强 潘文嘉 马继芳 瓮巧云 董立 全建章 邢继红 董志平 董金皋关键词:谷子 抗锈基因 分子标记 遗传连锁图 谷子抗锈种质资源创新利用研究 谷子锈病是谷子上的重要流行性病害,发生严重时全田植株倒伏,颗粒无收。防治谷子锈病最经济有效的措施是利用抗锈品种,为了准确鉴定抗源和抗锈品种,从1991年开始,课题组鉴定 董志平 宋银芳 全建章 董立 李志勇 郑直 刘磊 甘耀进文献传递 谷子十里香与锈菌非亲和互作转录组测序分析 谷子锈病是谷子上的主要病害,十里香为优秀的谷子抗锈种质资源,但农艺性状较差。从转录组水平上了解谷锈菌侵染后谷子的基因表达状况,不仅能从分子水平上加深对谷子与谷锈病互作的认识,还将有助于抗锈性的合理利用与抗病分子育种工作。... 李志勇 白辉 朱彦彬 全建章 董金皋 董志平关键词:谷子 抗锈病 转录组 谷子抗锈基因同源序列的克隆及分析 谷子锈病是谷子上的一种重要真菌病害,病原为单孢锈菌。该病发作时能够使作物减产10%~ 30%,流行年份植株倒伏,颗粒无收。不断发掘和利用新的抗锈基因、培育抗锈新品种是长期有效控制该类病害的关键。目前,有关谷子抗锈基因的克... 瓮巧云 邢继红 董志平 董金皋文献传递