国家自然科学基金(30270041)
- 作品数：8 被引量：44H指数：4
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- 相关机构：西南交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程农业科学更多>>
- 植物金属硫蛋白MT2的生物信息分析被引量：7
- 2009年
- 用生物信息分析方法对已在GenBank上注册的拟南芥等13种植物金属硫蛋白MT2的氨基酸序列与组成、亚细胞定位、跨膜区与信号肽、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构以及功能等进行分析与预测。结果表明,植物MT2主要位于叶绿体中,无信号肽,是非跨膜的亲水性蛋白,不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,无功能结构域。这一结果可为植物MT2深入的结构与功能分析及利用提供进一步的信息与参考。
- 江年茆灿泉
- 关键词：植物金属硫蛋白生物信息重金属
- Ni^(2+)金属结合肽的筛选和序列分析被引量：3
- 2006年
- 利用噬菌体随机十二肽库对金属N i2+进行了结合肽筛选,经5轮生物淘洗、噬菌体扩增和DNA测序,获得8条多肽序列,分析发现其中富含组氨酸(4~6个/肽).结果表明,组氨酸的存在对蛋白质和金属N i2+的结合起着关键作用.
- 徐柳谢明德佟鑫马春燕茆灿泉
- 关键词：NI^2+噬菌体随机肽库结合肽
- Cd^(2+)结合肽的筛选及与重金属离子的亲和作用被引量：2
- 2006年
- 利用噬菌体随机十二肽库和亲和层析技术对重金属Cd进行亲和筛选,共获得两条Cd结合肽序列。将展示有Cd2+结合肽的噬菌体单克隆扩增物对不同重金属离子(Cd2+、Cr2+、Cu2+、Co2+、Zn2+、Ni2+)螯合的树脂进行亲和测定,结果表明Cu2+、Co2+、Zn2+、Ni2+对结合肽的亲和力高于Cd2+和Cr2+。抑菌解毒试验进一步确认了Cd2+结合肽对大肠杆菌重金属的解毒作用。显微观察可见金属结合肽与金属螯合树脂混合后分散度发生改变。
- 黄敬双马春燕佟鑫易卓林徐柳茆灿泉
- 关键词：噬菌体随机肽库CD^2+
- 重金属结合肽(蛋白)的结构分析被引量：2
- 2009年
- 金属离子与金属结合肽(蛋白)的相互作用与应用研究,一直是生物无机化学的重点和热点,也是分子间相互作用研究领域的难点。本研究利用ClustalX、BLAST等生物信息技术与方法对大量已知的重金属结合肽进行分析与数据挖掘。确定筛选获得的重金属结合肽常富含His,无Cys,无金属结合肽模式序列,进化不保守;部分氨基酸序列结构(如六肽)可在蛋白数据库中找到相似序列。序列特征主要为Zn2+相关的转录因子。本研究为重金属结合蛋白-重金属离子的相互作用分析简化为重金属结合肽-重金属离子的结构模拟与分析提供了重要的理论基础和研究手段。
- 江年茆灿泉
- 关键词：重金属生物信息分子间相互作用
- 金属结合蛋白(肽)与环境重金属生物修复被引量：15
- 2004年
- 重金属污染是全球关注的重要环境问题。针对重金属的生物修复技术 ,因其特有的优势 ,越来越受到重视 ,其中一个重要的研究领域是利用金属离子和金属结合蛋白或结合肽之间存在的强亲和能力特性进行的生物修复研究。就金属结合蛋白 (肽 )的种类、结构特点、以及金属结合的作用机理进行了总结 ,同时综述了展示或表达有不同金属结合蛋白或结合肽的微生物和植物对重金属污染进行生物修复的最新研究进展 ,对基于金属结合蛋白 (肽 )的环境重金属生物修复的进一步研究 (如肽库的构建和筛选 ,金属与蛋白 (肽 )的相互作用 )进行了讨论。
- 徐柳宋琴茆灿泉
- 关键词：重金属生物修复生物细胞
- 蛋白骨架在随机肽库构建及靶分子筛选中的应用被引量：1
- 2009年
- 自然界有着丰富的蛋白骨架来源。选择适宜的蛋白骨架和展示、筛选方法,可构建基于合理蛋白骨架结构的优化限制性随机肽库。与非限制性随机肽库相比,可望获得针对靶分子具有新功能的蛋白结构或更高亲和力的配体分子。目前,骨架蛋白限制的随机肽库已在高效靶分子筛选、基础研究、临床诊断和医学治疗等方面显示出巨大的潜在应用价值。以S-S限制性骨架、抗体分子、锌指蛋白、Z结构域、FN3结构域等为主要代表,综合介绍了蛋白骨架的结构基础、分类、基于蛋白骨架的限制性随机肽库构建及近年来在靶分子筛选等方面的应用最新进展。
- 郭红光吴海江茆灿泉
- 关键词：结构域随机肽库
- 微生物与重金属作用机理研究被引量：14
- 2009年
- 以微生物与重金属相互作用为对象,结合近年来国内外研究,系统地说明了5种主要分子作用机理,分别为细胞表面吸附、主动运输、细胞内隔绝、胞外沉淀及酶的解毒作用。对重金属产生抗性的基因位于微生物的染色体、质粒和转座子上。最后介绍了多种抗性菌株,并就研究和应用前景进行了分析。
- 吴海江茆灿泉郭红光
- 关键词：微生物重金属生物修复
- Ni^(2+)高效结合肽的筛选与作用研究被引量：9
- 2006年
- 利用噬菌体随机十二肽库和金属亲和层析对重金属Ni2+进行结合肽筛选。经4轮生物淘洗、噬菌体扩增和DNA测序,获得一组多肽序列。GenBank Blast分析未发现同源序列,Clustal W多重序列比对也未找到Ni2+金属结合肽结合基序,但可能含有多聚组氨酸(His)2-5。噬菌体单克隆金属离子螯合树脂的亲和力测定和反筛、抑菌解毒试验表明:展示有金属结合肽的噬菌体不仅对Ni2+具有高亲和力,而且对其它金属离子也有作用,Cu2+、Ni2+、Co2+、Zn2+等金属离子对金属结合肽的亲和力显著高于Cd2+和Cr2+,展示金属结合肽的噬菌体对重金属Ni2+具有一定的耐受和解毒作用。显微形态学观察也显示金属结合肽与金属螯合树脂的作用。对于了解重金属与多肽的相互作用机理以及环境重金属修复等均具有重要意义和价值。
- 易卓林佟鑫马春燕黄敬双茆灿泉除柳谢明德
- 关键词：噬菌体展示技术
