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一种融合知识驱动和数据驱动的稻瘟菌AVR基因RNA二级结构生成器及其预测方法
本发明公开了一种融合知识驱动和数据驱动的稻瘟菌AVR基因RNA二级结构生成器,采用ARM芯片的片上存储器和外部DRAM芯片,分别存储RNA原始数据及中间结果;采用FPGA芯片实现RNA序列到知识图谱的映射,并通过LUT融...
张浩梅栖源刘元宁朱禹衡刘瀚渤赵恩爽
一种知识与数据融合的RNA二级结构预测方法
RNA(Ribonucleic Acid)作为承载遗传信息的载体,在基因表达和蛋白质合成等生物学过程中扮演重要角色,不同类型的RNA由于其特定结构能够实现不同功能。不过 RNA 三级结构更为复杂且易受温度影响,结构相对不...
杨恩斌
关键词:RNA二级结构预测知识提取数据融合
基于多模态的含假结的RNA二级结构预测方法研究
核糖核酸(Ribonucleic Acid,RNA)是一种生物大分子,它存在于生物细胞以及部分病毒中,对于我们的生命活动至关重要。要全面深入地研究RNA分子的结构与功能,首要任务便是精确解析其二级结构。自RNA这一生物大...
臧子楠
关键词:RNA二级结构预测TRANSFORMER硬约束
基于深度学习的RNA二级结构预测研究
RNA二级结构,如同精心编曲的交响乐章,蕴含着揭示RNA功能的核心旋律。碱基配对作为RNA二级结构的基石,对RNA的稳定性、功能特异性都有重要的影响。传统的基于热力学的RNA二级结构预测方法在处理非嵌套结构时面临挑战,...
王云祥
关键词:RNA二级结构
基于量子计算的RNA二级结构的预测方法及相关装置
本发明公开了基于量子计算的RNA二级结构的预测方法及相关装置,方法包括:获得目标RNA对应的所有茎和哈密顿量;基于所获得的所有茎和哈密顿量,构造目标量子线路;利用所述目标量子线路,获得目标量子态;基于所述目标量子态,获得...
请求不公布姓名请求不公布姓名窦猛汉
一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法
本发明公开了一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法,包括以下步骤:从数据库中选取已知的RNA二级结构数据并进行预处理和划分,获得训练数据集和测试数据集;构建Wfold神经网络模型,将训练数据集作为输入对模型进行训...
袁永娜杨恩杰
一种RNA二级结构预测方法、系统和计算机设备
本发明公开了一种RNA二级结构预测方法、系统和计算机设备,涉及RNA结构预测技术领域,包括步骤:以卷积神经网络CNN为前置基础网络,并在卷积神经网络CNN末尾连接卷积层来构建全卷积神经网络模型FCN;将一个L*L*10的...
徐成振张燕强李赛
基于深度学习的RNA二级结构预测
近年来,随着深度学习的广泛引用,深度学习与生物信息相关预测的融合进一步加快,如RNA二级结构预测、蛋白质预测等。传统的RNA二级结构预测网络无论在模型鲁棒性还是泛化能力上仍然存在一些缺陷,有进一步提升的空间,具有继续研究...
陈宇
关键词:RNA二级结构预测循环神经网络
一种基于迁移学习的端到端RNA二级结构预测方法
核糖核酸(RibonucleicAcid,简称RNA)是一种在生命体的各项生命活动中扮演着重要的角色的遗传物质。对RNA结构的研究是解析基因表达规则、调控基因表达乃至改变生物体性状的基础。在过去的研究中,学界曾使用生物化...
费寅超
关键词:RNA二级结构预测神经网络TRANSFORMER
一种RNA二级结构预测的处理方法和装置
本发明实施例涉及一种RNA二级结构预测的处理方法和装置,所述方法包括:构建二级结构预测模型;构建数据集对二级结构预测模型进行模型训练和测试处理;模型训练和测试处理成功,则获取任意RNA序列作为对应的第一RNA序列X;并将...
王喜温翰张林峰孙伟杰

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刘元宁
作品数:143被引量:224H指数:7
供职机构:吉林大学计算机科学与技术学院
研究主题:虹膜 虹膜识别 计算机应用 RNA二级结构 虹膜特征
张浩
作品数:191被引量:215H指数:8
供职机构:吉林大学
研究主题:生物信息学 计算机应用 RNA二级结构 解剖学 二级结构预测
杨赟
作品数:14被引量:0H指数:0
供职机构:浙江大学
研究主题:RNA二级结构 可变剪接 RNA RNA编辑 互斥
章群
作品数:103被引量:675H指数:15
供职机构:暨南大学生命科学技术学院
研究主题:细胞色素B 线粒体控制区 中国近海 系统发育 基因序列分析
金勇丰
作品数:118被引量:843H指数:15
供职机构:浙江大学
研究主题:家蚕 克隆 在家 融合蛋白 传染性法氏囊病病毒