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柳叶蜡梅PAL基因家族的鉴定及表达分析
2024年
苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙烷代谢的关键限速酶,在调节植物胁迫应答和生长发育方面发挥重要作用。为明确PAL基因家族在柳叶蜡梅生长发育中的功能,本研究系统分析了PAL基因家族成员的理化特征、顺式作用元件、系统发育树、保守基序、染色体定位及共线性关系,并比较了它们在不同组织、叶和花不同时期及不同激素处理下的表达模式。结果显示,7个柳叶蜡梅CsPAL家族基因锚定于5条染色体上,编码413~768个氨基酸,分为2个亚族,与腊梅CpPAL蛋白亲缘关系较近,存在基因复制现象。CsPAL家族基因启动子区域富集大量激素响应与胁迫应答的顺式元件。CsPAL家族基因在柳叶蜡梅不同组织、叶和花不同生长阶段及ABA、MeJA处理下呈现差异表达,CsPAL6在叶中高表达,受ABA、MeJA诱导,与黄酮物质在叶和花不同时期的减少相一致,推测可能与黄酮物质的合成有关。研究结果为将来研究CsPAL基因家族在黄酮生物合成中的功能提供了理论参考。
张桂华李贺鹏岳春雷俞振明
关键词:柳叶蜡梅PAL黄酮脱落酸
基于FPGA的PAL图像数据解码与传输设计
2024年
为了满足地面监控设备将视频数据快速上传至存储设备的需求,解决图像传感器输出PAL制信号的模拟解码和数据传输的问题,设计了基于FPGA的PAL数据输入、网络接口输出的硬件模块。通过解码器将PAL模拟信号转换为并行数字信号,并在FPGA端将输入数据进行奇偶场数据缓存,通过乒乓操作实现隔行转逐行的视频输出。同时在FPGA内部采用调用MAC软核的方式在UDP协议上增加重传机制和异步FIFO,实现数据的网络传输。
赵清琳任勇峰武旌阳
关键词:千兆以太网PALUDPFIFO
茉莉花PAL基因家族的多基因组鉴定与表达分析
2024年
为深入探究茉莉花PAL基因家族的功能及在香气成分形成中的作用,本研究以福州单瓣茉莉花、双瓣茉莉花和重瓣茉莉花基因组数据为基础,利用生物信息学方法及实时荧光定量PCR技术,对JsPAL基因家族进行多基因组分析。结果表明,在单瓣茉莉花、双瓣茉莉花和重瓣茉莉花全基因组中分别鉴定出4个、1个和4个PAL家族基因,JsPAL家族成员均具有丙氨酸-丝氨酸-甘氨酸(Ala-Ser-Gly)组成的三肽活性中心。共线性分析发现单瓣茉莉花、重瓣茉莉花和拟南芥的PAL基因间的共线性关系与双瓣茉莉花相比更强;系统发育树分析结果显示,JsPAL基因家族分布在2个亚家族中。JsPAL基因启动子区域存在大量与胁迫响应、激素响应、光响应和植物生长相关的顺式调控元件。荧光定量分析结果表明,JsPAL在茉莉花组织中存在特异性表达,多数JsPAL在花中的相对表达量高于其他组织;大多数JsPAL基因在福州单瓣茉莉花中的相对表达量高于双瓣茉莉花;福州单瓣茉莉花中SP_JsPAL2、SP_JsPAL4、MP_JsPAL1和MP_JsPAL3在其花朵预开放期(F3)的相对表达量显著高于其他时期,双瓣茉莉花中DP_JsPAL1在F3阶段的相对表达量也较高;SP_JsPAL1和SP_JsPAL2与2-苯乙醇和苯乙醛含量呈显著正相关,其中SP_JsPAL1还与苯甲醛含量呈显著正相关。说明,JsPAL可能在茉莉花的发育中起重要作用,SP_JsPAL2、SP_JsPAL4、MP_JsPAL1、MP_JsPAL3和DP_JsPAL1可能对福州单瓣茉莉花、双瓣茉莉花的香气成分形成具有重要的调控作用,SP_JsPAL1可能对福州单瓣茉莉鲜灵香气的形成具有重要作用。
张宇航谷梦雅洪雅萍林宏政金珊叶乃兴
关键词:茉莉花
海藻酸钙固定化重组暗紫贝母PAL蛋白
2024年
利用IPTG诱导含暗紫贝母(Fritillaria unibracteata)苯丙氨酸解氨酶FuPAL-pET28a的重组大肠杆菌BL21菌株,经Ni2+亲和层析与质谱鉴定获得纯度较高的FuPAL重组蛋白。以海藻酸钙凝胶为固定化介质,包埋FuPAL重组蛋白。单因素考察试验与统计学分析结果表明,海藻酸钠质量分数、CaCl_(2)浓度、固定化时间、海藻酸钠与酶质量比影响固定化酶的活性,它们的最优条件分别为3.5%、1g/L、4 h与40 000:1。进一步采用L9(3~4)正交试验设计,确定影响因素的重要性从高到低依次为CaCl_(2)浓度、海藻酸钠质量分数、固定化时间、海藻酸钠与酶质量比,最佳的固定化条件是CaCl_(2)浓度为2 g/L,海藻酸钠质量分数为4%,固定化时间为3 h,海藻酸钠与酶质量比为40 000:1。在该优化工艺条件下,制备的固定化酶凝胶颗粒呈较好的圆整性和均一性,相对酶活力达到最高,为68.53%。该固定化方法具有试验成本低、工艺流程简单、反应条件温和的特点,应用前景较好,并为固定化FuPAL蛋白的制备优化提供了重要的理论基础。
李响童婧莹张鑫薇刘玢秦余唐婕苗祖源许天成廖海周嘉裕
关键词:海藻酸钙苯丙酮尿症
茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析
2024年
【目的】分析茶树PAL、C4H和4CL基因家族成员的基本特征,探索它们与苯乙醇樱草糖苷含量性状之间的因果关系,对于深入研究PAL、C4H和4CL基因家族在茶树上的生物学功能具有重要意义。【方法】基于生物信息学方法及转录组测序技术,分析PAL、C4H和4CL基因成员在茶树基因组中的分布、理化性质、基因结构、系统发育关系、启动子顺式作用元件与表达特性,以及探索茶树PAL、C4H和4CL基因成员在苯乙醇樱草糖苷含量差异显著的茶树新品系(高糖苷和低糖苷品系)新梢中的表达差异。【结果】7个CsPAL、4个CsC4H与4个Cs4CL基因分布在9条染色体上。所有CsPAL均只有1个内含子;除CsC4H4外,其他CsC4H成员均含有2个内含子;Cs4CL成员均含有多个内含子。系统进化分析表明,它们与杨树PAL、C4H和4CL蛋白的亲缘关系较近。基因结构和保守基序分析显示,亲缘关系较近的基因,其基因结构和保守基序的组成也较为相似。启动子顺式作用元件预测发现,CsPAL、CsC4H与Cs4CL基因成员的启动子区域内含有多种顺式元件,包括逆境胁迫响应、生长发育相关以及激素响应等多种顺式元件。转录组分析发现,大多数CsPAL、CsC4H与Cs4CL的成员表现为组织特异性表达,且会受到激素、低温、干旱及高盐的诱导。CsPAL7、CsC4H4与Cs4CL3在苯乙醇樱草糖苷含量明显差异的品系中存在表达差异,CsPAL7在高糖苷品系中的表达量要大于低糖苷品系,CsC4H4与Cs4CL3在低糖苷品系中的表达量均显著高于高糖苷品系,推测这3个家族基因的表达可能对茶树新梢中苯乙醇樱草糖苷的形成起不同的作用。【结论】本研究为PAL、C4H和4CL基因的功能分析提供了有用的信息,其家族成员可作为茶树分子育种的候选基因。
张力岚杨军王让剑
关键词:茶树
PAL联合思维导图教学法在血液科体格检查临床教学中的应用
2024年
目的 探索同伴互助教学(peer-assisted learning,PAL)联合思维导图教学法在血液科体格检查中的教学效果。方法 选择苏州大学附属第三医院2022年1月—2023年3月117名临床医学生作为研究对象,随机分为3组,对照组行传统教学法,试验组1行PAL教学法,试验组2行PAL联合思维导图教学法,每组学生各39名,对3组学生进行不同方式的体格检查教学,教学完成后进行理论知识考核、操作考核和问卷调查。结果 3组间比较,学生在理论知识考核、操作考核以及问卷调查方面的差异均有统计学意义(P <0.05);与对照组比较,试验组1和试验组2的各项得分均更具优势,其中试验组2的成绩优于试验组1,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 PAL联合思维导图教学法有助于体格检查技能的掌握和临床思维能力的培养,能够有效提高教学质量。
岳延华曹阳顾伟英
关键词:体格检查临床教学
Pal影响肠炎沙门菌的生物被膜形成和耐药性
2024年
为了研究肽聚糖相关脂蛋白(peptidoglycan-associated lipoprotein,Pal)在肠炎沙门菌生物被膜形成和耐药中的作用,本研究构建了肠炎沙门菌的pal缺失株,对其生物被膜形成能力进行检测,同时检测Curli菌毛和纤维素形成,以及检测生物被膜形成相关基因表达水平。结果显示,与野生型菌株相比,pal基因缺失株生物被膜形成能力显著降低,Curli菌毛分泌量降低,但纤维素形成无显著降低,生物被膜相关基因表达水平显著降低。为进一步分析pal基因在肠炎沙门菌耐药性中的作用,本研究测试了多黏菌素B对该菌的最低抑菌浓度(MIC)。结果显示,pal基因缺失株对多黏菌素B的MIC降低了75%。综上所述,本研究表明pal基因影响肠炎沙门菌生物被膜形成和耐药性,研究结果为肠炎沙门菌Pal的功能研究奠定了基础。
赵桂新王亚男张鹿段文龙刘万王凤杰吴同垒史秋梅
关键词:肠炎沙门菌基因缺失生物学特性
PAL变体、包含该PAL变体的药物组合物以及用于制备该PAL变体的方法
本发明提供一种苯丙氨酸解氨酶(PAL)的变体,该苯丙氨酸解氨酶(PAL)来源于变异鱼腥藻并包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列,其中,所述变体包含氨基酸取代C503S/C565L,使得所述变体包含SEQ ID NO...
袁哲凡郑华宝魏冉唐扬洋金城东
PAL-BERT:An Improved Question Answering Model
2024年
In the field of natural language processing(NLP),there have been various pre-training language models in recent years,with question answering systems gaining significant attention.However,as algorithms,data,and computing power advance,the issue of increasingly larger models and a growing number of parameters has surfaced.Consequently,model training has become more costly and less efficient.To enhance the efficiency and accuracy of the training process while reducing themodel volume,this paper proposes a first-order pruningmodel PAL-BERT based on the ALBERT model according to the characteristics of question-answering(QA)system and language model.Firstly,a first-order network pruning method based on the ALBERT model is designed,and the PAL-BERT model is formed.Then,the parameter optimization strategy of the PAL-BERT model is formulated,and the Mish function was used as an activation function instead of ReLU to improve the performance.Finally,after comparison experiments with traditional deep learning models TextCNN and BiLSTM,it is confirmed that PALBERT is a pruning model compression method that can significantly reduce training time and optimize training efficiency.Compared with traditional models,PAL-BERT significantly improves the NLP task’s performance.
Wenfeng ZhengSiyu LuZhuohang CaiRuiyang WangLei WangLirong Yin
关键词:ALBERT
肠炎沙门菌pal基因缺失株部分生物学特性研究
肠炎沙门菌是常见的革兰氏阴性、人畜共患致病菌,严重危害公共卫生安全。抗生素是治疗细菌感染的常用策略,但也造成环境污染和多重耐药菌株的大量出现,进一步危害人类健康。疫苗接种被认为是防治沙门菌感染的另一个重要措施。沙门菌疫苗...
赵桂新
关键词:肠炎沙门菌细胞感染动物感染

相关作者

杨顺楷
作品数:82被引量:388H指数:13
供职机构:中国科学院成都生物研究所
研究主题:L-苯丙氨酸 苯丙氨酸解氨酶 没食子酸 黑曲霉 新月弯孢霉
张永清
作品数:563被引量:3,222H指数:26
供职机构:山东中医药大学药学院
研究主题:金银花 忍冬 化学成分 丹参 栝楼
吴锦程
作品数:59被引量:411H指数:14
供职机构:莆田学院
研究主题:枇杷 低温胁迫 枇杷果实 枇杷幼果 木质化
毕阳
作品数:541被引量:2,561H指数:24
供职机构:甘肃农业大学
研究主题:采后 愈伤 马铃薯块茎 厚皮甜瓜 丙烷
冯立娟
作品数:207被引量:983H指数:17
供职机构:山东省果树研究所
研究主题:石榴 大丽花 石榴品种 石榴果实 花青苷