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新冠病毒NTD特异性抗体研究现状及展望
2025年
新冠病毒N末端结构域(N-terminal domain,NTD)特异性抗体在体外实验中可以表现出截然相反的功能,既可以中和病毒,又可以促进病毒感染.因此如何利用NTD抗体来对抗新冠病毒,需要系统深入地研究和思考.本文对当前新冠病毒NTD特异性抗体的特征和研究现状进行综述,重点阐明NTD抗体发挥不同功能与其识别表位的对应关系.面对新冠病毒突变株持续流行的现状,持续研究NTD抗体特征及功能,可进一步理解新冠病毒感染的抗体应答特征,为制定新型抗病毒策略提供重要理论基础.
桂琪张政鞠斌
关键词:新型冠状病毒识别表位中和抗体
苏拉明与HIV-1衣壳蛋白六聚体中NTD/CTD界面互作调节CA蛋白装配
2025年
HIV-1衣壳蛋白(HIV-1 capsid protein,CA)是寻找抗病毒药物的有效靶点。靶向HIV-1 CA C端结构域(C-terminal domain of HIV-1 CA,CA CTD)中的CAI(capsid assembly inhibitor peptide)结合口袋可用来筛选CA蛋白抑制剂。本研究基于均相时间分辨荧光技术发现小分子化合物苏拉明(suramin)通过结合到该口袋靶向HIV-1CA,其抑制CA CTD-CAI相互作用的半数抑制浓度(IC_(50))值为2.1μmol·L^(-1)。生物膜干涉法(bio-layer interferometry,BLI)实验表明,苏拉明直接与CA蛋白结合,且与CA蛋白六聚体的结合亲和力(K_(D)=248 nmol·L^(-1))高于与CA单体的结合亲和力(K_(D)=227μmol·L^(-1))。此外,CA蛋白体外组装实验表明苏拉明促进了CA蛋白的无序多聚化。分子模拟结合模式分析结果显示,苏拉明通过N57、Q63、Q67和Y169残基结合到CA六聚体中相邻CA单体之间的界面上,起到增强CA蛋白多聚化的作用。综上所述,苏拉明是一种靶向CA六聚体的CA蛋白抑制剂,可作为发现新型CA抑制剂的起点。
许晓双张大为
关键词:苏拉明人类免疫缺陷病毒1型
SARS⁃CoV⁃2免疫逃逸NTD中和抗体的分子机制
2024年
针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)中和抗体的开发,主要针对SARS-CoV-2表面的刺突(Spike,S)蛋白。大多数中和SARS-CoV-2的单克隆抗体(MAbs)可结合S蛋白的受体结合结构域(receptor-binding domain,RBD),从而阻断病毒与血管紧张素转化酶2(Angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)的相互作用。作者早期通过SARS-CoV-2原型株S蛋白免疫小鼠,筛选得到S2G4,S2H5,S4D4,S5B84株与S蛋白氮末端结构域(N-terminal domain,NTD)不同表位结合的单克隆抗体,其中S2H5活病毒中和能力最强。本研究利用冷冻电镜技术解析了S2H5的抗原结合片段(Fab)结合SARS-CoV-2原型株S蛋白复合体的结构,共获得六种构象,其中S2H5 Fab结合在S蛋白的NTD上,结构模拟完整S2H5抗体结合S蛋白可以空间上阻碍S蛋白与ACE2相互作用,揭示了S2H5中和SARS-CoV-2原型株的结构基础。此外,作者应用假病毒中和实验,分析了上述四种抗体对SARS-CoV-2多种突变株的中和能力,显示了其突变株对NTD抗体的免疫逃逸,并从结构生物学角度对各突变株表现出的免疫逃逸提供了可能的解释。
洪琴徐诗奇王艳兴张超黄忠丛尧
关键词:刺突蛋白中和抗体冷冻电镜
靶向冠状病毒核衣壳蛋白NTD-RNA位点的小分子抑制剂虚拟筛选
2024年
核衣壳蛋白(Nucleocapsid Protein,N蛋白)是冠状病毒(CoVs)家族保守的结构蛋白,其N端结构域(NTD)与病毒RNA结合形成核糖核蛋白复合物(RNP),参与病毒复制与组装,已被认定为重要的抗冠状病毒药物靶点。以NTD-RNA结合位点为靶点,针对小分子片段库,开展基于计算机辅助药物设计方法的N蛋白抑制剂虚拟筛选。方法:建立基于受体结构的药效团模型,利用特征元素和测试集分子匹配程度选择最优模型,并运用基于受体和基于配体的方法以检验模型的可靠性。对小分子片段库进行基于Lipinski五规则、药效团模型和分子对接的虚拟筛选,筛选出可以干扰NTD与RNA结合的潜在N蛋白抑制剂。结果最佳药效团模型包含两个疏水特征和两个氢键受体,并筛选出药效团模型匹配值高、对接得分值排序靠前且结构新颖的2个化合物。结论:所筛选出的2个化合物可作为潜在的抑制剂以用于后续研究。
玄亚男张娜
关键词:核衣壳蛋白药效团模型
新型冠状病毒S1、S2和NTD抗原特异性B细胞及其亚型标记技术的建立与应用
2024年
建立一种新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS⁃CoV⁃2)S1、S2、NTD蛋白特异性B细胞及其亚型的标记技术,该技术可通过与流式细胞术联用检测抗原特异性B细胞及其亚型含量,或与10×免疫组库联用对抗原特异性B细胞进行测序。首先,测试最佳蛋白使用浓度:将生物素标记的S1、S2和NTD蛋白按照600 nmol/L、1200 nmol/L、2400 nmol/L、3600 nmol/L和4800 nmol/L分别与荧光素⁃亲和素偶联,通过流式检测S1+CD19+B、S2+CD19+B、NTD+CD19+B细胞占比,确定不同蛋白对应的最佳使用浓度;进一步优化生物素⁃蛋白与荧光素⁃亲和素的比例:将检测生物素⁃蛋白与荧光⁃亲和素的摩尔比分别按照4∶1,5∶1和6∶1比例测试,对小鼠脾脏S1+CD19+B、S2+CD19+B、NTD+CD19+B细胞及S1+CD19+CD27+B、S2+CD19+CD27+B、NTD+CD19+CD27+B细胞的检测效果,优化荧光素⁃亲和素的最佳使用量;通过测试BV421、Super Bright 600、PE、PE/Cy7和APC等荧光对小鼠脾细胞的非特异结合能力,选择非特异结合较弱的荧光;根据筛选的荧光,给生物素化的S1、S2和NTD均标记PE和APC荧光,建立检测这3个蛋白特异性B细胞和记忆B细胞的方法,并测试带核酸序列的荧光素⁃亲和素对B细胞和记忆B细胞的检测效果,测试该方法的稳定性。S1、S2和NTD蛋白浓度分别为4800 nmol/L、3600 nmol/L和3600 nmol/L时,对B细胞的检测效果最佳,且对阴性小鼠的染色效果较低;生物素⁃S1蛋白与荧光素⁃亲和素的最佳摩尔比为6∶1时,检测结果最佳;生物素⁃S2蛋白、生物素⁃NTD蛋白与荧光素⁃亲和素均在4:1时,检测结果最佳,且在该浓度下BV421、APC、Super Bright 600、PE与细胞的非特异结合较弱;建立了一种检测SARS⁃CoV⁃2 S1、S2和NTD抗原特异性B细胞及记忆B细胞的方法,通过对一批样本的重复3次检测,发现该方法较为稳定,CV值≤20%。通过抗原特异性B细胞标记技术,实现了对SARS⁃CoV⁃2 S1�
宋彦丽杨惠洁赵玉秀鲍春婷李淑艳李长贵
关键词:新型冠状病毒
Enhancing RBD exposure and S1 shedding by an extremely conserved SARS-CoV-2 NTD epitope
2024年
Dear Editor,Multiple waves of outbreaks of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)have resulted in unprecedented public health and socioeconomic crises.After 4 years of primary as well as breakthrough infections and under the increased immune pressure exerted by vaccination,SARS-CoV-2 has evolved into multiple variants that displayed either enhanced transmissibility or immune escape properties.
Qianhui ZhuPan LiuShuo LiuCan YueXiangxi Wang
Accelerating the Control and Elimination of Major Parasitic Diseases in China—On World NTD Day 2024被引量:1
2024年
Neglected tropical diseases(NTDs)are a group of diseases associated with poverty that affect over 1 billion people worldwide(1).On May 31,2021,the World Health Assembly(WHA)officially recognized January 30 as World Neglected Tropical Diseases Day through decision WHA74(18).This designation aims to raise awareness about the severe impact of NTDs on disadvantaged populations and to mobilize support for control,elimination,and eradication efforts.
Yuwan HaoTian TianZelin ZhuYijun ChenJing XuShuai HanMenbao QianYi ZhangShizhu LiQiang Wang
关键词:DISEASESDISEASESDISADVANTAGE
一种NFE2L1蛋白的NTD多肽及其在制备抗肿瘤药物中的用途
本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一种NFE2L1蛋白的NTD多肽及其在制备抗肿瘤药物中的用途。所述NTD多肽单体的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明通过构建NFE2L1的NTD氨基酸序列的多肽,意外发现N...
邱露高艳锋宁浩明
一种靶向新冠病毒S-NTD蛋白的纳米单域抗体及其应用
本发明公开了一种靶向新冠病毒S蛋白NTD结构域的特异性单域抗体NTD‑R4P1‑A1,针对高度保守的S蛋白NTD结构进行多轮筛选最终获得特异性高的单域抗体,其序列如SEQ ID No.1所示。本发明公开的单域抗体NTD‑...
孙磊申思仙
低温晶体量热器中NTD-Ge热传感器的研究
无中微子双贝塔衰变(0vββ)是当前国际上粒子物理与核物理领域的研究前沿,是可能突破粒子物理标准模型的最重要研究方向之一。对无中微子双贝塔衰变的实验研究涉及中微子物理的一系列关键科学问题:轻子数是否守恒;中微子的基本属性...
赵康康
关键词:微纳加工

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李红丽
作品数:120被引量:245H指数:8
供职机构:第三军医大学
研究主题:神经管缺陷 CDK5 维甲酸 星形胶质细胞 大鼠脑
蔡文琴
作品数:506被引量:1,761H指数:18
供职机构:第三军医大学基础部
研究主题:神经干细胞 发育 中枢神经系统 星形胶质细胞 内皮细胞
李竹
作品数:217被引量:2,207H指数:25
供职机构:北京大学公共卫生学院生育健康研究所
研究主题:神经管畸形 叶酸 患病率 儿童 流行病学
李泽桂
作品数:98被引量:352H指数:10
供职机构:第三军医大学西南医院
研究主题:小鼠 神经管缺陷 STAT3 胚胎干细胞 胚胎发育
孙延芝
作品数:32被引量:58H指数:4
供职机构:解放军第211医院
研究主题:先兆子痫 SCE NTD 着丝粒 神经管缺陷