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绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选
2025年
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。
郭飞翔李春霞周爽郭彬彬张均马超
关键词:绿豆
参与胡薄荷酮生物合成调控的两个MYB转录因子及其应用
本发明以荆芥柠檬烯合酶(StLS)基因启动子为诱饵,利用生物筛选方法筛选出两个参与荆芥胡薄荷酮生物合成调控的MYB转录因子即StMYB76和StMYB13。这两种基因具有的核苷酸序列如SEQ:NO.1和SEQ:NO.2所...
刘潺潺王雪党静洁吴啟南
一种同时促进分蘖和穗发育的MYB转录因子OsMYBR17基因在提高水稻产量中的应用
本发明属于植物基因工程技术领域,涉及作物育种技术领域,具体涉及一种同时促进分蘖和穗发育的MYB转录因子OsMYBR17基因在提高水稻产量中的应用,OsMYBR17基因编码的蛋白质为氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示的...
方中明金锋黄玮婷赵全志
沙地云杉MYB转录因子家族鉴定及其对盐胁迫的响应
2025年
沙地云杉(Picea mongolica)具有耐寒、耐旱及耐盐的优良特性,是“三北”地区生态建设及城市绿化的重要树种。MYB转录因子可以响应非生物胁迫及次生代谢产物合成过程,为鉴定沙地云杉MYB转录因子家族并探究其在盐胁迫过程中的响应,本研究以挪威云杉基因组及沙地云杉转录组数据为参考,共鉴定出196个MYBs家族成员。根据系统进化树,MYB转录因子家族分为7个亚类,其中,R2R3-MYB亚类基因数量最多,占84.77%,R-R和R1R2R3亚类数量最少,均占0.51%。基序、结构域、基因结构及保守性分析表明,同一亚类MYB转录因子具有高度保守性且具有相似基序和基因结构。不同盐胁迫梯度实验表明,沙地云杉最高的耐受盐胁迫浓度为1000 mmol/L。在1000 mmol/L盐胁迫浓度下设置不同处理时间(0、3、6、12、24 h)并测定转录组数据,共筛选出34个MYBs差异表达基因,表明其可能在调控盐胁迫过程中发挥着重要作用。对差异基因编码的蛋白进行理化性质分析发现,蛋白序列长度在89–731 aa,分子量约为10.19–79.73 kDa,等电点为4.80–9.91,不稳定系数41.20–70.99。亚细胞定位显示,大部分蛋白位于细胞核,3个蛋白位于叶绿体中。选取其中12个MYB基因进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,其表达模式与RNA-seq数据一致。本研究为后续探索沙地云杉中MYB家族成员在响应盐胁迫过程的功能及作用机制提供了数据支持。
隋明明张富满田甜闫艳秋耿乐李慧白玉娥
关键词:沙地云杉盐胁迫
一种杧果MYB转录因子、互作蛋白及其在增强抗病性中的应用
本发明提供一种杧果MYB转录因子、互作蛋白及其在增强抗病性中的应用,所述杧果MYB转录因子命名为MiMYB44转录因子,其编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,互作蛋白为1‑氨基环丙烷‑1‑羧酸氧化酶ACO,...
张贺刘志鑫孙宇蒲金基高爱平罗睿雄
一个旱金莲R2R3-MYB转录因子基因TmPAP及其应用
本发明提供了一个旱金莲R2R3‑MYB转录因子基因TmPAP及其应用,属于植物基因工程技术领域。本发明提供的旱金莲R2R3‑MYB转录因子基因TmPAP具有调控植物花色素苷合成的作用,通过原生质体转染发现TmPAP定位于...
王树才王晓苹
棉花MYB转录因子研究进展
2024年
当前,传统育种手段已经不能完全满足棉花市场及生产的需求,可以利用分子生物技术来加快棉花品种的更新,转录因子为棉花基因功能研究和遗传育种提供了重要的帮助。MYB转录因子家族作为最大的转录因子家族之一,在多种植物中存在,并且在植物的生长发育过程中行使着多种功能。MYB转录因子具有很高的研究价值,在模式植物中的功能已经得到较为深入的研究,但在非模式植物,特别是棉花中的研究仍然较为有限,大多集中在陆地棉中。为进一步了解MYB转录因子,对部分植物及棉花中MYB转录因子的相关研究进展进行了综述,主要涵盖了它们的分类依据、结构特点、进化方式以及在响应生物及非生物胁迫、棉花纤维发育和次生代谢等方面的作用,并对目前已知的棉花MYB转录因子的相关功能进行了分析。通过对这些内容的综述,有助于加深我们对棉花MYB转录因子的了解,为后续研究不同棉种中MYB转录因子以及深入研究它们的功能和机制提供了重要的参考。
李晨宇足木热木·吐尔逊李晓荣杨洋于月华李波
关键词:棉花MYB转录因子
MYB转录因子在水稻胁迫响应中的研究进展
2024年
水稻是重要的粮食作物之一,不利环境条件及病虫害等严重影响水稻产量和品质。MYB家族转录因子是植物中最大转录因子家族之一,参与植物多种生长发育途径调控,对植物响应生物和非生物胁迫发挥重要作用。文章总结近年来MYB家族转录因子在水稻生物和非生物胁迫响应中的功能及调控机制,为水稻抗逆育种提供参考。
吴秀菊张新颖许敏卜庆云王臻昱
关键词:水稻非生物胁迫生物胁迫
RR类MYB转录因子调控番茄果实成熟的机制
番茄(Solanum lycopersicum L.)果实成熟是一个由多个基因共同调控的精细过程,已成为科学研究的焦点。番茄果实成熟是果实发育的重要阶段,也是果实品质形成的关键时期;研究果实成熟对于解析番茄果实品质调控机...
范玉博
关键词:番茄果实成熟转录组
MYB转录因子在调控植物响应逆境胁迫中的作用被引量:2
2024年
MYB作为植物中最大的多功能转录因子(transcription factors,TFs)家族之一,在基因转录水平上广泛地参与调控植物生长发育、激素信号转导及逆境胁迫应答等过程。该类转录因子N端含有典型的MYB结构域,根据MYB结构域中R重复序列的数量分为不同的亚组;而C端结构域差异较大,因此功能上具有多样性。大量研究表明,在受到外界环境信号的激活后,MYB可单独或通过和其他蛋白互作后,与下游靶基因启动子区域的顺式作用元件MYBCORE和AC-box结合,参与调控下游胁迫应答相关基因的表达,从而调节植物对逆境胁迫的耐受性。另外,MYB也通过参与脱落酸(abscisic acid,ABA)、油菜素内酯(brassinolide,BR)、茉莉酸(jasmonic acid,JA)和活性氧(reactive oxygen species,ROS)等信号通路的方式,对非生物胁迫以及生物胁迫做出应答反应。论文对植物MYB家族的结构与分类及其作用方式进行了归纳,重点对植物MYB参与调控响应盐、干旱、极端温度、营养亏缺、重金属以及病原菌等非生物和生物逆境胁迫的作用机制进行了综述,并对未来重点研究方向提出了展望,为今后农作物的抗逆性遗传改良和生物育种提供优异基因资源和理论支持。
胡雅丹伍国强刘晨魏明
关键词:MYB转录因子DNA结合结构域非生物胁迫生物胁迫

相关作者

唐益雄
作品数:65被引量:773H指数:17
供职机构:中国农业科学院生物技术研究所
研究主题:MYB转录因子 大豆 转基因植株 基因表达调控 逆境胁迫
杨文杰
作品数:57被引量:127H指数:6
供职机构:淮阴师范学院
研究主题:大豆 MYB转录因子 基因表达调控 根系活力 小麦
李景文
作品数:102被引量:185H指数:7
供职机构:吉林大学
研究主题:大豆 苦豆子 编码基因 大豆异黄酮 异黄酮
吴燕民
作品数:100被引量:663H指数:15
供职机构:兰州大学草地农业科技学院
研究主题:百脉根 编码基因 逆境胁迫 转录因子 MYB转录因子
王庆钰
作品数:131被引量:349H指数:11
供职机构:吉林大学
研究主题:大豆 苦豆子 编码基因 异黄酮 向日葵