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纳米孔测序技术区分HLA基因分型模棱两可组合结果的探索: 2025年; 目的利用纳米孔测序技术解决新一代测序技术(next generation sequencing, NGS)HLA基因分型中模棱两可组合问题。方法收集本实验室NGS检测分型存在模棱两可组合的标本38例,采用相同的商品化NGS HLA分型试剂盒引物对HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DRB3/4/5、-DQA1、-DQB1、-DPA1和-DPB1位点进行特异性扩增后,实施三代测序建库并在纳米孔测序仪上测序,数据转换成Fastq文件并通过软件指定11个HLA位点基因分型结果。直接计数法统计模棱两可组合结果。结果以第2域数字作为高分辨结果,三代测序技术(third generation sequencing, TGS)检测的38个标本11个HLA位点结果与NGS结果符合率为100%。TGS法检测HLA-A、-B、-C、-DRB3、-DRB4、-DQA1、-DPA1位点均为唯一性结果,对HLA-A、-B、-C和-DQA1位点模棱两可组合(均因NGS读长短致使定相困难而形成)的区分率为100%;HLA-DRB1、-DRB5、-DQB1和-DPB1位点的模棱两可组合中,TGS法对1号外显子未扩增导致的模棱两可组合的区分率为0%,对因NGS读长短导致的模棱两可组合的区分率为100%。结论本项目利用纳米孔技术对11个HLA位点模棱两可组合进行区分研究,有效解决了NGS方法短读长引起的模棱两可组合问题,提高了HLA基因分型准确性。; 陈男英章伟董丽娜王芳何亿镇陈晨朱发明; 关键词：HLA基因

杂交探针捕获与扩增子文库构建法对HLA基因分型分辨水平的影响: 2025年; 目的比较高通量测序(next generation sequencing, NGS)杂交探针捕获和扩增子文库构建方法,分析HLA基因分型分辨水平的影响因素及临床应用中的前景。方法选择207例已知分型结果临床标本和能力验证计划标本,确认HLA基因分型结果符合率、等位基因覆盖度及分型数据分析指标,比较2种文库构建方法对HLA基因分型分辨水平的影响。结果 207例标本杂交探针捕获法结果与能力验证反馈结果或已知结果符合率均为100%。其中91例标本与原扩增子法比较,杂交探针捕获法可区分13例标本DRB1、DPB1不能确定的等位基因;解决6例标本存在DRB1、DPA1、DQB1位点等位基因不平衡;明确3例患者标本存在DQA1、DQB1位点等位基因漏检。结论杂交探针捕获与扩增子法均满足HLA基因分型临床检测的要求,本文为其临床推广应用提供了实验方法和依据。; 袁晓妮张腾腾李杨姜雪杨天杰鲍晓晶何军; 关键词：HLA 高通量测序等位基因

单分子实时测序在HLA基因分型中的应用初探: 2024年; 目的分析单分子实时(SMRT)测序技术判断HLA基因型、单体型的准确性,以探讨该方法应用于临床的可行性。方法留取19例需行肾移植的患者血液标本,提取DNA后利用SMRT测序技术检测样本基因序列,并利用PCR-SBT方法验证其准确性。结果 SMRT技术可鉴定出19例样本的HLA基因型和基因单体型,且结果与PCR-SBT方法相符。1和14号样本PCR-SBT方法的C位点结果存在模棱两可现象,结果为HLA-C*03:02/04;03:03/132,SMRT技术可直接区分,结果为HLA-C*03:02:02,03:03:01。另外,SMRT方法在1号样本的B位点发现新的HLA等位基因。结论 SMRT测序技术应用于HLA高分辨率分型具有高度准确性,在HLA单体型分析具有精准定位多个长间距突变位置的独特优势。; 储玉霜肖彦琳望喆冯青青李亭亭卞茂红; 关键词：HLA分型单体型分析

纳米孔基因测序技术在HLA基因分型中的应用被引量：1: 2024年; 人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)基因是人类基因组中最复杂的基因区域,主要参与机体免疫反应,HLA的基因分型在器官移植以及疾病诊疗等领域有着广泛的临床应用。现有的HLA分型方法在临床实践中发挥了重要作用,但也存在一些技术限制和局限性。纳米孔基因测序技术的出现为快速鉴定HLA基因分型提供了全新视角。该技术以其快速、实时测序和长读长等特点,为复杂的HLA区域提供了更为快速精确的识别能力。该技术不仅能更快速地解析HLA基因型,还对前沿高通量基因测序新技术开发HLA分型方法的研究具有潜在的借鉴意义。本文主要对纳米孔基因测序技术在HLA分型领域中的研究方法和临床应用进行综述。; 朱孟琳何燕琴谢水莲杨影万绍贵; 关键词：人类白细胞抗原基因分型技术

基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究: 2024年; 目的探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对全部样本进行HLA基因分型,比较两种方法的基因分型结果及性能。结果 TGS法和PCR-SBT法对48份样本的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1的基因检测结果,在高分辨水平上完全一致,TGS法可以对全部样本进行直接指定新基因及单一组合分型结果。TGS法在耗时、新基因判定、读长、机器维护、模棱两可结果和实时数据等性能方面优势更明显。结论与PCR-SBT测序技术相比,基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在指定HLA基因结果方面准确性更高、耗时更短。; 廉雪张丹温玉洁范成艳刘娜张荣芳王东梅; 关键词：人类白细胞抗原 PCR-SBT

同时检测TCR和HLA基因分型的方法及应用: 本发明涉及一种同时检测TCR和HLA基因分型的方法及应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：样品提取：取待测生物样本，提取其中DNA；PCR扩增：取上述DNA，同时加入TCR扩增引物和HLA扩增引物，对TCR目标...; 杨凡林莉娅张伟

NGS自动化平台在HLA基因分型的建立及应用被引量：1: 2024年; 目的建立基于二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术对人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)基因进行分型的自动化操作平台,并评估其在HLA常规检测中的应用。方法根据试剂盒操作说明编写相应的计算机程序,利用Hamilton Microlab STARlet全自动液体处理工作站联合96通道小型液体工作站、荧光化学发光分析仪等仪器,实现NGS技术对HLA基因分型过程中文库制备步骤的自动化操作。结果手工法和自动化平台获取的文库片段两者读长基本一致,浓度及质量均符合要求,测序结果一致;而自动化平台操作时间明显少于手工操作。结论建立的NGS自动化操作平台检测HLA基因分型方法可行,值得推广使用。; 何亿镇王芳董丽娜陈晨章伟; 关键词：人类白细胞抗原自动化平台

一种用于HLA基因分型的引物组、试剂盒及其应用: 本发明公开了一种用于HLA基因分型的引物组、试剂盒及其应用；所述引物组包括HLA基因扩增引物组，所述HLA基因扩增引物组包括HLA‑A引物组、HLA‑B引物组、HLA‑C引物组和/或HLA‑DRB1引物组。通过本发明方案...; 费云舟李超鹏吴春杨钟欧阳冬生李晓晖

HLA基因分型的方法、装置、存储介质及处理器: 本申请公开了一种HLA基因分型的方法、装置、存储介质及处理器。其中，HLA基因分型的方法包括：构建HLA基因型数据库，HLA基因型数据库包括与HLA‑A基因相关的假基因的DNA序列；将待测样本的测序数据与HLA基因型数据...; 郭现超宋小凤赵义陈维之杜波何骥

一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法: 本发明属于基因检测领域，具体涉及一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法，提供的HLA基因扩增引物组，包括如下引物组中至少一组引物组组成的混合物：所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑18所示；上述HL...; 蒋廷亚刘海涛刘枫王银锋

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