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- 面向基因测序芯片应用的TiN电极薄膜制备及性能研究
- 2023年
- 基因测序技术正处于快速发展阶段,作为灵敏度极高的测序技术——纳米孔测序,对薄膜电极的电阻率和储能特性提出了更高的要求。为了降低薄膜的电阻率并提高储能特性,本文利用反应磁控溅射方法,基于原位生长原理,分别制备了TiO_(x)N_(y)和Ti/TiN/TiO_(x)N_(y)电极薄膜。采用扫描电子显微镜、X射线衍射仪和电化学工作站对薄膜的微观结构、化学成分及其电化学性能进行研究。结果表明,在TiN高导电性和TiO_(x)N_(y)高比表面积的协同作用下,Ti/TiN/TiO_(x)N_(y)电极薄膜表现出优异的电化学性能。当电流密度为0.15 mA/cm^(2)时获得7.01 mF/cm^(2)的比电容,是TiO_(x)N_(y)电极薄膜比电容值的1.3倍。同时,与TiO_(x)N_(y)单电极相比,Ti/TiN/TiO_(x)N_(y)电极薄膜电阻降低约2个数量级。分析发现:将致密结构的TiN用作集流体引入疏松多孔的TiO_(x)N_(y)单电极中,可以有效降低Ti/TiN/TiO_(x)N_(y)体系内阻,同时保持良好的比电容,可为磁控溅射方法制备高性能基因测序芯片电极提供理论基础。
- 王梦晓徐进苏云鹏顾佳烨孙纳纳周大雨
- 关键词：基因测序磁控溅射
- 复可托产品及原料中6种猪病毒基因膜芯片检测方法研究
- 2022年
- 目的利用基因膜芯片技术建立复可托产品及原料中6种猪病毒快速检测方法。方法设计6种猪病毒特异性引物及探针,对样本核酸进行多重PCR扩增,进一步利用基因膜芯片技术进行产物杂交并分析判定。结果建立的检测方法特异性强,稳定性好,灵敏度高,综合检测限为1.0×10^(5)copies·mL^(-1),满足日常检验要求。结论建立了6种猪病毒PCR-基因膜芯片技术的快速筛查方法,可保障复可托产品及原料的质量安全,该技术可进一步应用于养殖场和市场的猪肉检测,为政府监管部门提供有力的技术支撑。
- 洪亮王福云潘映秋卢敏
- 关键词：复可托猪病毒多重PCR
- CT影像在OSA相关肺癌易感基因序列植芯片技术中的应用
- 2020年
- 目的探讨CT影像在阻塞性睡眠呼吸暂停(obstructive sleep apnea,OSA)相关肺癌易感基因序列植入芯片技术中的应用。方法选择2017年2月—2018年12月OSA患者67例作为对象,所有患者均于CT影像下植入OSA相关肺癌易感基因序列植芯片技术,植入后对患者进行12个月随访,统计OSA患者肺癌发生率。结果67例患者CT影像下均完成基因芯片植入,66例植入位置准确,准确率为98.51%;患者均完成12个月随访,中途无失访病例。患者中,12个月随访时肺癌发生率最高,占10.45%,随访12个月中不同时间肺癌发生率比较具有统计学意义(P<0.05)。结论CT影像用于OSA相关肺癌易感基因序列植入芯片技术中能获得较高的准确性,能较好的预测肺癌的发生,能为肺癌诊疗提供依据和参考。
- 孟宪锋林庆艳姜洪尹虹雷
- 关键词：CT影像阻塞性睡眠呼吸暂停肺癌诊疗
- 一种常见致病菌耐药基因检测芯片的建立及其应用被引量：6
- 2019年
- 目的评价新开发的一种基因芯片技术在6种常见致病菌的耐药基因检测中的作用,以期快速、高效地监测相关细菌的耐药情况。方法收集临床分离的革兰氏阳性菌(金黄色葡萄球菌41株、肠球菌33株)和革兰氏阴性菌(大肠埃希菌57株、肺炎克雷伯菌39株、鲍曼不动杆菌32株、铜绿假单胞菌35株),通过微生物鉴定药敏测试系统进行药敏测试;同时制备耐药基因芯片,对各菌株行多重PCR扩增、芯片杂交及检测;比较药敏实验和芯片检测结果的符合率。结果研究显示6种常见致病菌的β-内酰胺类、大环内酯.林克酰胺.链阳菌素、四环素类、氯霉素类、甲氧苄啶和磺胺类、喹诺酮类、氨基糖苷类耐药基因阳性率与药敏试验结果一致,总符合率在93%~100%,其中仅有肺炎克雷伯菌检出青霉素类耐药基因blaZ,大肠埃希菌未检出碳青霉类耐药基因。大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌的糖肽类耐药基因阳性率与药敏试验结果一致,但金黄色葡萄球菌、肠球菌、铜绿假单胞菌糖肽类耐药基因阳性率与药敏试验结果存在差异。结论新开发的芯片可检出6种常见致病菌的8类抗生素耐药基因,而青霉素类耐药基因blaZ可能在芯片设计上仅适用于肺炎克雷伯菌,碳青霉类耐药基因可能在该芯片设计上不适用于大肠埃希菌,有待进一步改进。
- 郭健莲肖斌龙刘惠娜江先海徐忠玉
- 关键词：基因芯片耐药性药敏实验
- 基因表达芯片技术筛选转移性卵巢癌相关性基因被引量：2
- 2018年
- 目的:利用基因表达谱芯片筛选转移性卵巢癌相关性基因,对卵巢癌转移过程中可能参与的基因间的信号转导通路进行分析。方法:选取6例不同病理类型的转移性卵巢癌组织和2例正常卵巢上皮组织,提取DNA。采用CytoScan HD芯片检测,筛选卵巢癌转移性相关性基因,并进行基因本体(GO)和信号通路分析,筛选出对转移过程可能具有重要作用的基因。结果:染色体定位分析6例转移性卵巢癌组织共同有216个基因发生微结构异常,分别位于8、12、16、17及X染色体,其中X染色体最多。对216个基因GO分析显示,92个基因编码与3个GO分类(生物学过程、分子功能、细胞组分)相关的蛋白,信号通路分析得到20个基因具有显著性的调节信号通路。进一步与正常卵巢上皮组织对比筛选出38个差异性基因,GO分析显示24个基因编码与3个GO分类相关的蛋白,B2M和CTDSPL、NOBOX等11个基因具有显著性的调节信号通路。结论:卵巢癌的转移与多个基因相关,8、12、17号染色体拷贝数的变异可能与卵巢癌的转移密切相关,差异性基因中B2M基因是卵巢癌转移的关键基因,通过TGF信号通路调节卵巢转移癌的转移,是一个转移性卵巢癌治疗的新靶点。
- 刘贵芬孙蓬明阮冠宇
- 关键词：卵巢癌基因表达谱基因本体信号转导
- 维甲酸诱导腭裂小鼠的舌组织基因芯片筛选和差异基因生物学信息的初步探讨被引量：3
- 2018年
- 目的:利用基因芯片技术筛选维甲酸腭裂小鼠舌组织相关的差异基因,确定其功能及相关信号通路,并观察差异表达基因在维甲酸诱导腭裂小鼠形成中基因表达变化的调控模式及其生物学意义。方法:建立维甲酸诱导的腭裂小鼠模型,在ICR系小鼠怀孕第10 d管饲浓度为100 mg/kg全反式维甲酸,获取胚胎13.5 d的实验组和对照组小鼠舌组织,进行Affymetrix Mouse 430 2.0表达谱芯片实验,获得维甲酸腭裂小鼠的舌组织的异常表达基因,进而结合GO分类功能分析差异基因功能。通过Biocarta及Kegg信号通路数据库查询筛选基因相关转导信号通路信息,并分析在腭裂发生发展过程中信号转导以及基因表达调控网络等相关信息。结果:基于腭裂与舌组织基因表达谱芯片结果,以两倍差异倍数为标准筛选差异表达基因,共发现差异基因2146个,其中发现上调的基因有1457个,下调的基因689个。未被注释的631个,已经注释1515个。上调的差异基因功能大多与粘多糖生物合成过程、小脑发育、间充质细胞正调控以及肌动蛋白聚合或解聚有关。下调的基因功能大多与神经管的闭合、Wnt受体的正负调控、细胞增殖的调控和细胞外基质组成有关。主要的差异基因相应信号转导通路如Metabolic pathway,Hedgehog signaling pathway,Wnt signaling pathway,MAPK signaling pathway等可能在腭裂的发生发展中起重要作用。结论:利用基因芯片技术,在维甲酸诱导腭裂小鼠舌组织中发现了涉及到多个信号通路的上千个差异基因表达,提示舌发育异常可能直接导致腭裂发生。
- 王媛媛王媛媛刘波蒋玉玲肖晶
- 关键词：维甲酸腭裂
- PCR-反向斑点杂交膜芯片技术在遗传性非综合征耳聋患儿基因检测中的应用被引量：5
- 2018年
- 目的探讨PCR-反向斑点杂交(PCR—RDB)膜芯片技术在遗传性非综合征耳聋患儿基因诊断中的应用价值。方法收集东莞市康复学校38例排除耳聋高危因素的先天性耳聋患儿的外周血2mL,提取基因组DNA,采用自行研究设计的多重PCR扩增结合RDB膜芯片技术针对中国人群4个常见耳聋致病基因20个热点突变进行检测。以Sanger测序技术作为金标准对阳性样本进行验证。结果38例耳聋患儿中,共有16例患儿检出耳聋基因突变,检出率为42.11%,耳聋基因突变的患儿均行家系验证。16例耳聋患儿基因突变中GJB2基因突变6例,检出率为15.79%,其中纯合子3例、杂合子3例;SLC26A4基因突变4例,均为杂合子,检出率为10.53%;MTRNR基因m.1555A>G突变位点2例,检出率为5.26%;复合突变4例,检出率10.53%;未检出GJB3基因突变。16例耳聋基因突变患儿DNA样本经Sanger测序法验证,结果符合率为100%。结论应用针对4个常见耳聋致病基因20个热点突变设计的PCR-RDB膜芯片技术检测先天性耳聋患儿易感基因具有检出率高、快速、准确、经济等特点,是遗传性非综合征耳聋患儿基因筛查的理想方法,具有较好的临床应用前景。
- 叶敏南李文瑞彭琪黎四平彭陆衡陆小梅
- 关键词：基因突变
- 一种基因芯片光学扫描图像倾斜校正方法研究被引量：2
- 2017年
- 针对在基因芯片光学扫描时产生的图像倾斜问题,提出了一种基于像素灰度的芯片图像倾斜校正方法。结合基因芯片图像的结构特点,基于行、列方向像素灰度定义芯片图像的校正指标。在角度检测范围内,利用折半搜索方法,基于校正指标来检测芯片图像的校正角度和芯片图像的校正位置。实验结果表明,该方法能有效地检测多类基因芯片图像的倾斜角度,具有较强的鲁棒性和实用性。
- 刘全金赵志敏张文杰
- 关键词：信息光学像素灰度倾斜校正
- Affymetrix基因表达谱芯片技术筛选胰腺癌异常表达基因的研究被引量：5
- 2017年
- 目的:利用基因表达谱芯片筛选出胰腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因。方法:收集新疆医科大学第三附属医院2014年1月—2016年6月间手术切除的10例胰腺导管细胞癌组织及其相应癌旁正常组织,用TRIzol法提取总RNA后采用含49395个基因探针的Affymetrix基因表达谱芯片筛选出差异表达基因,并行GO分析和pathway分析,对部分差异表达基因行实时定量PCR法验证表达情况。结果:样本总RNA检测合格,基因芯片质量评估良好,检测结果可靠且可重复性高。经芯片降噪处理后共检测38079个基因,其中存在差异表达的基因共512个,表达上调的基因419个,表达下调的基因93个;共287个差异表达基因编码与3个GO分类(生物学过程、分子功能、细胞组分)相关的蛋白;共29条信号通路存在明显基因差异表达,涉及126个基因。经PCR验证,差异表达基因CPB1、CELA3B、CPA1、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINK1的表达情况与基因芯片检测结果吻合。结论:胰腺导管细胞癌组织与癌旁正常组织间存在大量差异表达的基因,这些基因主要与生物学过程、分子功能及细胞组分相关,且参与了多个细胞信号通路的调控。
- 易超依马木买买提江.阿布拉丁伟苏雅婷晏冬李海军
- 关键词：基因表达谱芯片分析技术基因本体
- 大豆、油菜中外源基因成分的测定 膜芯片法
- 本标准规定了膜芯片法检测大豆、油菜中外源基因成分的防污染措施、抽样与制样、原理、试剂与标准品、仪器与设备、试验方法和流程、结果判断、确证实验、结果表述。
本标准适用于大豆、油菜中外源基因成分的定性检测。
