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小麦背景下冰草6P染色体特异EST标记的开发被引量：3: 2012年; 小麦-冰草[Agropyroncristatum(L.)Gaertn.]6P附加系普冰4844-12具有多粒等可用于小麦改良的优异基因。为高效率检测由小麦-冰草6P附加系衍生的易位系和渐渗系,以普冰4844-12及其亲本普通小麦Fukuhokomugi和冰草Z559(2n=4x=28,PPPP)为材料,通过对冰草转录组测序获得的EST序列设计的P基因组EST分子标记引物,筛选在普通小麦背景下的6P染色体特异分子标记。结果从1453对P基因组EST引物中筛选出130对小麦-冰草6P附加系特异标记引物。进而将这些特异标记与NCBInr蛋白质数据库及小麦EST序列进行了比对,发现4条冰草EST序列的功能注释与抗病、抗逆相关;36条冰草EST与已经定位的小麦EST具有较高的相似性,其中33条(91.67%)位于小麦第6部分同源群染色体。为了进一步验证这些标记的特异性,分别对其中4个具有功能注释的EST标记在中国春等7个普通小麦背景下和随机选择的5个标记在小麦-冰草6P易位系背景下进行了检测,结果证明其确实可用于检测6P染色体。这些冰草6P染色体特异标记的开发为大规模地鉴定小麦-冰草衍生后代中P染色质成分奠定了基础。; 代程张锦鹏武晓阳杨欣明李秀全刘伟华高爱农李立会; 关键词：小麦冰草

小麦品种周8425B抗叶锈病基因LrZH84的EST标记被引量：2: 2010年; 本研究利用周8425B与中国春杂交获得的F2和F3群体,采用分离群体分组分析法(BSA),获得了与LrZH84紧密连锁的EST分子标记BF482555,并在F2和F3群体中检测的连锁距离分别为3.8cM和4.5cM,该标记在抗感品种间扩增出了共显性的多态性片段。这些研究结果证明,通过EST建立小麦抗叶锈病基因的分子标记是可行的,同时为周8425B抗叶锈病基因的分子标记辅助育种奠定了基础。; 闫媛媛潘阳李星李在峰姜谓刘大群; 关键词：小麦抗叶锈病基因 EST标记

簇毛麦6V染色体短臂特异性EST标记的开发及缺失定位被引量：3: 2010年; 为了准确鉴定簇毛麦6VS易位染色体小片段的长度和断点位置,根据定位于小麦第6部分同源群染色体短臂不同区段的EST序列,利用PRIMER5.0软件设计PCR引物,成功开发出3个对6V染色体短臂特异的分子标记(CINAU89-740、CINAU90-730、CINAU91-390)。利用小麦和簇毛麦第六部分同源群染色体短臂的12个缺失系对簇毛麦6VS的8个特异性分子标记进行了定位。标记CINAU88-381、CINAU17-1086、CINAU15-902分别被定位在FL值为0.79~0.99、0.58~1.00、0.46~0.58的染色体区段,标记CI-NAU91-390、CINAU90-730、CINAU16-1650被定位在FL值为0.35~0.45的染色体区段,标记CINAU18-723、CINAU89-740被定位在FL值为0.00~0.45的染色体区段。利用这8个分子标记可以更准确地鉴定6VS小片段易位的断点和片段长度。; 陈升位陈佩度; 关键词：小麦 EST标记

大麦染色体特异性EST标记在5H短臂成株期叶锈病抗性基因定位中的应用被引量：4: 2010年; 为了明确大麦成株叶锈病抗性品种‘Pompadour’抗性基因的性质,以‘WABAR2482×Pompa-dour’的457个F2后代为材料,采用单链构象多态性(SSCP)分析技术,对发掘的SNP-EST分子标记在抗性品种的F2后代中进行分子标记检测。结果表明,457株F2分离群体中328株表现抗病,129株表现感病,卡方检验符合3∶1的分离比例。推断新发现的5HS成株叶锈病抗性基因为主效显性抗性基因。在所筛选的15对大麦5HS染色体EST标记中,共显性SNP标记K05820共检测出109株抗性亲本纯合体、115株感病亲本纯合体和233株杂合体。利用F2代表型分离结果对标记K05820进行验证分析发现,该标记与‘Pompa-dour’5HS染色体成株叶锈病抗性高度相关(r=0.82)。同时,新的定位分析表明,K05820与成株叶锈病抗性基因间的遗传距离为7 cM。这说明共显性EST-SNP标记K05820可以运用于大麦5HS染色体成株叶锈病抗性基因后代杂合体及纯合体的筛选,能够应用于田间抗病材料的初步筛选。; 刘凤楼王辉; 关键词：大麦成株抗性

新疆小麦材料的抗叶锈鉴定及抗叶锈基因LrZH84的EST标记: 由小麦叶锈菌（Puccinia triticina）引起的小麦锈病是影响世界小麦稳产高产的重要病害之一,也是影响我国小麦生产的重要因素,该病害在世界各产麦区均有发生,严重时可造成5%～15%甚至更大的产量损失。实践证明,...; 潘阳; 关键词：新疆小麦叶锈病慢锈性 EST标记; 文献传递

鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位被引量：5: 2010年; 利用GLM模型对12个表达序列标签(expressed sequence tag,EST)标记的基因型与鲤耐低温性状进行相关性分析,然后使用OneMap软件将这些EST标记进行连锁定位研究,并通过Blast x搜索引擎对这些候选EST进行注释。结果显示,EST标记CC009(P<0.05)和CC115(P<0.01)与鲤鱼耐低温性状显著相关;12个EST标记中有8个标记分别连锁定位到6个连锁群中,其中与耐低温相关的CC009和CC115分别定位到鲤连锁图谱的第38号连锁群和第2号连锁群;蛋白质数据库同源性比对发现,CC009与斑马鱼(Danio rerio)尿嘧啶激酶1(uridine-cytidine kinaseI)的同源性高达94%;而CC115为原绿球藻(Prochlorococcus marinus str)的假定糖基转移酶(putative glycosyl transferase)的同源性为56%。; 常玉梅高国强徐丽华刘金亮刘春雷梁利群; 关键词：鲤鱼表达序列标签耐低温

鲤鱼多态性EST标记的筛选与特性分析被引量：5: 2008年; 表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)标记在基因组作图和分子标记辅助育种研究中具有重要价值。筛选和开发可用于遗传作图的鲤鱼多态性EST标记,对研究鲤鱼的基因组结构、遗传多样性研究和遗传育种有重要意义。本研究根据GenBank数据库中鲤鱼EST序列设计了67对EST引物,有47对在鲤鱼基因组DNA中成功扩增得到稳定的特异性条带,经单链构象多态性(SSCP)分析,12对(25.5%)引物扩增的EST在1个鲤鱼回交家系中具有多态性,其中6个为鲤鱼功能基因,5个与斑马鱼(Danio rerio)功能基因具较高相似性,1个与斑点叉尾(Ictaluruspunctatus)功能基因具较高相似性。这些多态性的EST在鲤鱼二倍体家系和单倍体群体中的等位基因分离均符合孟德尔规律(1∶1或3∶1),单倍体中的SSCP条带数目为二倍体的二分之一。选用其中4对多态性的EST引物对洞庭湖鲤鱼进行初步群体遗传分析,结果显示基因多样性(H)为0.437,远低于微卫星标记所揭示的该群体基因多样性(接近于1)。结果表明,多态性的EST-SSCP标记尽管遗传变异性较低,但是作为来源于编码区的Ⅰ型遗传标记,在遗传作图和种群遗传适应性等研究中有较好的应用潜力。; 王春艳俞小牧童金苟; 关键词：鲤鱼 EST标记

小麦EST标记的开发及其应用研究: EST标记是基于表达序列的一类新型分子标记，快速增长的EST数据为其开发提供了丰富的来源。本研究利用网上公布的转录因子EST数据/(包括161条来自于国际小麦簇协作网的EST-SSR和237条来自于赤霉菌诱导的苏麦三号幼...; 梅铭凤; 关键词：EST EST-SSR 转录因子 QTL; 文献传递

微卫星和EST标记在两种鲤科鱼类遗传分析中的应用: 生境破碎化是生物多样性丢失的首要原因，也是造成近几十年长江流域渔业资源衰退的重要因素之一。本研究利用微卫星分子标记对长江中下游流域不同生境7个湖泊中300多尾红鳍原鲌进行了群体遗传分析。研究结果显示这些群体具有显著的小尺...; 王春艳; 关键词：鲤科鱼类生境破碎化微卫星标记群体遗传结构 EST标记

小麦EST标记的开发及其应用研究: EST标记是基于表达序列的一类新型分子标记，快速增长的EST数据为其开发提供了丰富的来源。本研究利用网上公布的EST数据（包括编码转录因子的161条来自于国际小麦簇协作网的EST-SSR和237条来自于赤霉菌诱导的苏麦三...; 梅铭凤著

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