搜索到10018篇“ DNA结合结构域“的相关文章
- 一种模块化正交的高效转录因子DNA结合结构域系统的构建方法
- 本发明公开了一种模块化正交的高效转录因子DNA结合结构域系统的构建方法,包括以下步骤:S1、选取模块化转录因子的基本架构及其调控启动子的基本架构；S2、在转录因子和调控启动子的基本架构基础上，构建含有致死基因CCDB的标...
- 陈业黎欣睿栗曾理
- 用于连接DNA结合结构域和切割结构域的组合物
- 本文公开用于连接DNA结合结构域和切割结构域(或切割半结构域)以形成具有替代性构型的非天然存在的核酸酶的组合物。还描述了制备和使用包含这些接头的组合物的方法。
- J·C·米勒D·帕斯乔恩E·J·瑞巴
- 合成的DNA结合结构域及其应用
- 本发明的方面提供了多肽构建体，其包含：(a)包含来源于转录因子蛋白的碱性螺旋的氨基酸序列的第一多肽，所述转录因子蛋白包含碱性螺旋‑环‑螺旋结构域；以及(b)包含来源于在C端方向上从转录因子蛋白的碱性螺旋‑环‑螺旋结构域的...
- 雷蒙德·E·莫勒林托马斯·E·斯佩尔茨肖恩·上官
- DNA结合结构域、融合型phi29 DNA聚合酶及其制备方法和应用
- 本发明属于生物技术领域，公开了DNA结合结构域、融合型phi29DNA聚合酶及其制备方法和应用。本发明的融合型phi29DNA聚合酶包括phi29DNA聚合酶，上述DNA结合结构域，连接前两者的连接肽。本发明还提出编码融...
- 高亚平王壹陈丽伊何筠伊戈尔·伊万诺夫田晖孙亚萍付康
- 灭癌素链霉菌中磷硫酰化修饰DNA结合结构域的功能分析
- 2022年
- 【目的】DNA磷硫酰化(phosphorothioation,PT)是由硫原子取代DNA骨架磷原子上的非桥联氧原子形成的一种新型DNA修饰。PT修饰除参与组成限制修饰系统外,其更为广泛的生物学功能仍有待揭示。PT修饰现有的检测方法操作复杂、成本高、耗时长,而具有操作简便、成本低、耗时短等特点的酶联免疫检测(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)成为新PT检测方法开发的优选。灭癌素链霉菌(Streptomyces gancidicus)中具有天蓝色链霉菌中PT修饰依赖的IV型限制酶(ScoMcrA)的同源酶,暗示其同样含有特异性结合PT修饰DNA的硫结合结构域(sulfur binding domain,SBD)。本文对灭癌素链霉菌中的SBD(简称为Sg-SBD)与PT修饰DNA的亲和力进行定性检测与定量表征,评估其用于PT修饰ELISA方法开发的潜力。【方法】对ScoMcrA-SBD和Sg-SBD的氨基酸序列进行比对分析,利用ScoMcrA-SBD为模板进行同源建模。在大肠杆菌中异源表达Sg-SBD,利用纯化的Sg-SBD进行凝胶迁移(electrophoresis mobility shift assays,EMSA)检测。利用生物膜层干涉(biolayer interferometry,BLI)技术进行Sg-SBD结合PT修饰DNA的定量表征。【结果】生物信息学分析揭示了Sg-SBD含有结合硫原子的保守的氨基酸残基,同时表明Sg-SBD具有与ScoMcrA-SBD相似的结构。EMSA实验发现Sg-SBD可以结合PT修饰DNA形成明显的迁移带,初步证实Sg-SBD结合PT修饰DNA的活性。BLI数据显示,Sg-SBD具有比ScoMcrA-SBD更强的PT修饰DNA结合能力,其与PT修饰DNA的亲和力常数在nmol/L级别,并且Sg-SBD不结合非PT修饰DNA。【结论】Sg-SBD结合PT修饰DNA活性接近抗原-抗体的反应水平,可用于PT修饰DNAELISA快速检测方法的开发。
- 陈英孔令新邓子新由德林
- 关键词：酶联免疫检测
- 增殖细胞核抗原通过其DNA结合结构域促进乙肝病毒rcDNA向cccDNA的转化被引量：2
- 2021年
- 慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是造成肝癌的主要原因,消除病毒基因组中稳定的共价闭合环状DNA(cccDNA)是乙肝治疗的主要难点。HBV cccDNA的形成需要填充单链区域和闭合松弛环状DNA(rcDNA)。我们之前已报道,增殖细胞核抗原(PCNA)参与了HBV cccDNA的形成。然而,HBV rcDNA向cccDNA转化的分子机制尚不清楚。本研究旨在探讨PCNA参与从HBV rcDNA到HBV cccDNA的转化过程的分子机制。结果显示,CRISPR/Cas9系统敲除PCNA能显著阻止HBV rcDNA向cccDNA的转化,而过表达PCNA能够有效地拯救这一现象(P<0.001)。敲除PCNA可显著减缓HBV rcDNA向cccDNA转化的动力学(P<0.01)。在HBV rcDNA向cccDNA转化的过程中,PCNA的DNA结合域是必需的(P<0.01)。由此获得结论,PCNA通过其DNA结合结构域促进乙肝病毒从rcDNA向cccDNA的转化。在临床上,PCNA可能成为抗病毒治疗的新靶点。
- 袁颖冯巾晏赵丽娜杨光赵曼袁红凤贠昊林刘姿娴李悦国张晓东
- 关键词：共价闭合环状DNA增殖细胞核抗原DNA结合域
- 模块式DNA结合结构域及使用方法
- 本发明涉及通过多肽选择性识别DNA序列中碱基对的方法，特异性识别DNA序列中一个或多个碱基对的修饰多肽，被修饰而使它可以被多肽特异性识别的DNA，所述多肽和DNA在特异性DNA靶向中的用途，以及调节靶基因在细胞中表达的方...
- 乌拉·博纳斯延斯·博赫塞巴斯蒂安·朔尔纳克托马斯·拉艾
- 文献传递
- DNA结合结构域反式激活因子及其用途
- 在一些方面，本公开涉及包含编码包含DNA结合结构域和转录调控子结构域的融合蛋白的核酸的重组腺相关病毒(rAAV)及其使用方法。在一些实施方案中，所述融合蛋白的表达导致细胞中靶基因的修饰的表达。
- M·S·埃斯特维斯S·A·沃尔夫
- 文献传递
- 核因子I/A(NFIA)依赖其N末端的DNA结合结构域抑制猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)复制被引量：2
- 2020年
- 猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)严重危害世界养猪业,目前仍无有效防控策略,因此探究宿主内源性蛋白拮抗PRRSV的分子机理意义重大。前期试验发现核因子I/A(nuclear factor I/A,NFIA)可以有效抑制PRRSV复制,故本试验以非洲绿猴胚胎肾细胞Marc-145细胞为模型,对NFIA抑制PRRSV复制的分子机理进行了深入探究。首先,构建NFIA的N末端DNA结合结构域缺失质粒pcDNA3.1-Flag-ΔN和C末端转录激活结构域缺失质粒pcDNA3.1-Flag-ΔC并分别转染Marc-145细胞,24 h后感染PRRSV,48 h后用qRT-PCR和Western blot的试验方法分别检测病毒N蛋白的RNA和蛋白表达水平。结果显示ΔC仍能有效降低PRRSV的RNA水平和N蛋白水平,但ΔN则不再能降低PRRSV的RNA水平和N蛋白水平,这表明NFIA的N末端结构域是抑制病毒的关键。其次,对NFIA全长质粒pcDNA3.1-Flag-WT进行N末端结构域内不同功能位点的双碱基突变,分别破坏掉NFIA的促腺病毒复制功能(Mut1,YR86~87WL)、DNA结合功能(Mut2,LR119~120VD)和二聚化功能(Mut3,LF135~136VD),将突变质粒分别转染Marc-145细胞,24 h后感染PRRSV,48 h后通过qRT-PCR和Western blot检测发现,Mut2和Mut3不再能降低PRRSV的RNA水平和N蛋白水平,说明N端结构域的DNA结合功能位点和二聚化功能位点是NFIA抑制PRRSV复制的关键。结果表明,核因子I/A(NFIA)主要依赖其DNA结合结构域的二聚化与DNA结合功能来抑制PRRSV复制。
- 赵旭阳史西保张小转陈静王丽邓瑞广张改平
- 人源雄激素受体DNA结合结构域的原核表达与其响应元件的复合物结晶
- 2019年
- 为获得高分辨率的雄激素受体与其响应元件的复合物晶体结构,为前列腺癌的治疗提供药物靶点设计的理论基础.本研究构建了AR-DBD的原核表达载体,在0.5 mmol/L IPTG,16℃条件下诱导24 h表达该蛋白.通过与AR响应元件寡核酸的结合优化蛋白纯化条件,使AR-DBD蛋白易于纯化.最终,蛋白核酸复合物晶体呈现出边缘清晰,短棒状的立体结构,本研究制备的蛋白核酸复合物晶体可直接用于X射线衍射分析.
- 秦童黄震
- 关键词：雄激素受体前列腺癌DNA结合结构域原核表达
